| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,651,399 | C→T | 5.6% | P80S (CCG→TCG) | PP_3217 → | aliphatic sulfonate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,651,399 | 0 | C | T | 5.6% | 268.3 / 3.4 | 89 | P80S (CCG→TCG) | PP_3217 | aliphatic sulfonate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (46/37); new base T (3/2); total (50/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
AGAGTTACAACGCTCGTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTGCGCGGCAAACGCGCGGCCATCTGGAAA > NC_002947/3651250‑3651548 | agagTTACAACGCTCGTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACgcgc > 2:1640371/1‑150 (MQ=255) ttACAACGCTCGTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGcgccgc > 2:472803/1‑149 (MQ=255) ttACAACGCTCGTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGcgccgc < 1:472803/149‑1 (MQ=255) tACAACGCTCGTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAATAACTGCCTTACAGCCTGGAGTGGAATCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGccc < 2:455068/150‑1 (MQ=255) aCAACGCTCGTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGcccc > 2:1493237/1‑150 (MQ=255) aaCGCTCGTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTg > 1:717887/1‑150 (MQ=255) aaCGCTCGTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTg > 2:1819061/1‑150 (MQ=255) aCGCTCGTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTCGCCGAACCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGt < 1:331276/150‑1 (MQ=255) cGCTCGTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGtt > 1:1242233/1‑150 (MQ=255) cGCTCGTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGGCCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGGCGCGTCGcccagcag < 1:1211034/150‑6 (MQ=255) gTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCg > 1:470030/1‑150 (MQ=255) gCCATGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCACCCCTGTTCCTCGGt > 2:1677180/1‑150 (MQ=255) gTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGcc > 2:1593551/1‑150 (MQ=255) gTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGcc > 2:2138307/1‑150 (MQ=255) aTGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTg < 1:996208/150‑1 (MQ=255) ggAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTggg > 2:254300/1‑150 (MQ=255) aaGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTggggg < 2:2357669/150‑1 (MQ=255) cGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCaa < 1:1362079/150‑1 (MQ=255) gTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGTTCacg < 2:1242233/150‑3 (MQ=255) gTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAg < 1:2054728/150‑1 (MQ=255) tGCTAGAACAACTACCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAgg < 2:2244095/150‑1 (MQ=255) tAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGa > 1:2302156/1‑141 (MQ=255) tAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGa < 2:2302156/141‑1 (MQ=255) aGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGAt > 1:1220540/1‑150 (MQ=255) gAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCCCCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCt < 1:532313/119‑1 (MQ=255) gAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCt > 2:532313/1‑119 (MQ=255) caacTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCGCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGCGCGCCGATCAAGGTGATTGCg < 2:1026945/150‑1 (MQ=255) cTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTc > 2:2144102/1‑150 (MQ=255) tGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTgggg > 2:1059292/1‑125 (MQ=255) tGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTgggg < 1:1059292/125‑1 (MQ=255) tGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTg < 1:1027242/122‑1 (MQ=255) tGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTg > 2:1027242/1‑122 (MQ=255) tGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAg > 2:980370/1‑137 (MQ=255) tGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAg < 1:980370/137‑1 (MQ=255) tGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCa < 1:1493237/150‑1 (MQ=255) ccTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGcgccg < 1:179329/99‑1 (MQ=255) ccTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGcgccg > 2:179329/1‑99 (MQ=255) cTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGcc > 1:398559/1‑150 (MQ=255) acCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAg > 1:1454512/1‑150 (MQ=255) ccTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGaa > 2:1178390/1‑150 (MQ=255) ggAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCt < 1:1634839/150‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGa < 2:1224935/150‑1 (MQ=255) tGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGaa > 1:110231/1‑150 (MQ=255) ggAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAg < 2:1454512/150‑1 (MQ=255) gAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAgg > 1:1633488/1‑150 (MQ=255) gAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAgg > 2:1300856/1‑150 (MQ=255) aaGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAg > 2:776719/1‑117 (MQ=255) aaGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAg < 1:776719/117‑1 (MQ=255) gCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGt < 1:1300856/150‑1 (MQ=255) cAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTg < 1:229924/150‑1 (MQ=255) aGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTgg < 1:1178390/150‑1 (MQ=255) aGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTgg > 2:947608/1‑150 (MQ=255) 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cgcTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGaa < 2:422390/113‑1 (MQ=255) cgcTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGaa > 1:422390/1‑113 (MQ=255) cTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCcac > 2:2334951/1‑150 (MQ=255) cAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCa > 2:1711539/1‑99 (MQ=255) cAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCa < 1:1711539/99‑1 (MQ=255) tCGGCAGTTTAGATATTGTCCCGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCCCCGATGAAGGTGCTTGCTGTTAGCCTTGAGAACCTCGAAGGTGTGGCCATCCTCGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGc < 2:470030/150‑1 (MQ=255) ggCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTg > 2:753000/1‑108 (MQ=255) ggCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTg < 1:753000/108‑1 (MQ=255) gCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGACTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAgg > 1:139609/1‑150 (MQ=255) tcGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTgc > 1:1072385/1‑150 (MQ=255) gATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTgcgc > 2:1814607/1‑150 (MQ=255) gCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGaa < 2:1388475/86‑1 (MQ=255) gCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGaa > 1:1388475/1‑86 (MQ=255) gCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTGCGCGGCAAAc > 2:1547273/1‑150 (MQ=255) tcaaggggCGGCGCGTCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTGCGCGGCAAAcgc > 2:590374/6‑150 (MQ=255) ctgctgGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCa < 2:738420/67‑1 (MQ=255) ctgctgGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCa > 1:738420/1‑67 (MQ=255) tgctgGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTGCGCGGCAAAcgcg > 2:1645124/1‑150 (MQ=255) tgctgGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGCTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTGGCCGTCCTTGCGCGCAGTGCTGCTCCGAGCCACAGCCTGCAGTACCTTCGCGGCAAAcgcg > 2:508360/1‑150 (MQ=255) acaggggCGGCGCGTCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTGCGCGGc > 1:1383421/5‑143 (MQ=255) acaggggCGGCGCGTCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTGCGCGGc < 2:1383421/139‑1 (MQ=255) tgGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTGCGCGGCAAACGCGCgg > 2:1176501/1‑150 (MQ=255) tgGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTGCGCGGCAAACGCGCgg > 2:1651383/1‑150 (MQ=255) gggCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTGCGCGGCAAACGCGCGGc < 2:1220540/150‑1 (MQ=255) cGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTGCGCGGCAAACGCGCGGCCAt > 1:2029533/1‑150 (MQ=255) ccgccCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTGCGCGGCAAACGCGCGGCCATCTGGaaa < 2:110231/150‑1 (MQ=255) | AGAGTTACAACGCTCGTGCCGTGATGGAAGCCGCCGGCGTGCTAGAACAACTGCCTTACACCCTGGAGTGGAAGCAGTTCACCGCAGGCTCCCCGGTGGCCGAAGCGCTCAACGTCGGCAGTCTCGATATTGGCCTGCTGGGCGACGCGCCGCCCCTGTTCCTCGGTGCCTTGGGGGCGCCGATCAAGGTGATTGCGGTCAGCCGGCAGAACCTCGAAGGCGTGGCCATCCTGGCGCGCAAGGATTCTCCGATCCACAGCCTGCAGGACCTGCGCGGCAAACGCGCGGCCATCTGGAAA > NC_002947/3651250‑3651548 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |