| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,790,734 | C→G | 5.5% | G45G (GGC→GGG) | PP_3353 → | sulfatase‑modifying protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,790,734 | 0 | C | G | 5.5% | 287.7 / 6.4 | 91 | G45G (GGC→GGG) | PP_3353 | sulfatase‑modifying protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/48); new base G (2/3); total (40/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.06e-01 | |||||||||||
TGGTCAAGCCGCAATGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCTTTTACGACGAAGAAGGCCCGCCTCACCCCGCCAAGGTGTCCGGCTTCTGGATTGACGTGCATCCGGTCACCAACGCCCAGTTCGCGC > NC_002947/3790587‑3790882 | tGGTCAAGCCGCAATGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGccc < 1:495996/150‑1 (MQ=255)tGGTCAAGCCGCAATGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGccc > 2:1774666/1‑150 (MQ=255) tCAAGCCGCAATGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCTGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTg < 2:1100113/150‑1 (MQ=255) cAAGCCGCAATGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTgg < 1:1154191/150‑1 (MQ=255) aaGCCGCAATGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGc > 2:946546/1‑150 (MQ=255) aaGCCGCAATGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGc < 1:1673404/150‑1 (MQ=255) gCCGCAATGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCga > 1:1035316/1‑150 (MQ=255) gCCGCAATGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCga > 1:954106/1‑150 (MQ=255) gCCGCAATGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCga < 2:1463766/150‑1 (MQ=255) gCCGCAATGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGCACTGGTTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGGCCTTGGCgc < 1:1024868/150‑2 (MQ=255) ccGCAATGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGGCCTTGGCgct < 1:2204088/150‑3 (MQ=255) ccGCAATGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCgag > 1:912057/1‑150 (MQ=255) cGCAATGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCgaga > 1:1557235/1‑150 (MQ=255) cGCAATGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCgaga < 1:1704247/150‑1 (MQ=255) gCAATGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGacac < 1:2400084/150‑1 (MQ=255) gCAATGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGAc < 2:1257361/150‑1 (MQ=255) gCAATGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGAc < 1:784889/150‑1 (MQ=255) aaTGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGCGACgg > 1:357930/1‑150 (MQ=255) aaTGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGACTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACgg > 2:1861306/1‑150 (MQ=255) aTCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATg > 2:1344893/1‑150 (MQ=255) aTCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATg > 1:354137/1‑150 (MQ=255) gCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTg > 2:144636/1‑150 (MQ=255) gCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTg < 1:1839709/150‑1 (MQ=255) 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ggCTGCGCGGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGggc < 2:6464/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGggcggc < 1:1492202/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGACTATGCCGTTTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGggcggc > 1:1665835/1‑150 (MQ=255) cgcAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGa < 2:2280625/150‑1 (MQ=255) cgcAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGa < 1:643077/150‑1 (MQ=255) 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gCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCAGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGAGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCaa < 1:1975517/150‑1 (MQ=255) cTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGc < 1:1344893/150‑1 (MQ=255) tCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTCCAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCt > 1:696961/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGGCCTTGGCgctgc < 1:39197/101‑5 (MQ=255) tCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGGCCTTGGCgctgc > 2:39197/1‑97 (MQ=255) gccgccgccTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCttt < 2:2265925/150‑1 (MQ=255) ccctccgccgATGCCGTGTGGCCGCAAGACCCGGAGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCttt < 2:1600582/146‑1 (MQ=255) cgccgccTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCTTTTa > 2:1902829/1‑150 (MQ=255) ccTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCTTTTacgacg > 2:1405668/1‑150 (MQ=255) gCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCTTTTACGACgaagaa < 1:1110162/150‑1 (MQ=255) gCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTCGACTGGCGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCCGCTTTGGTTCAAGCCGCTGTTACGACgaagaa > 1:151433/1‑150 (MQ=255) 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ggCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCTTTTACGACGAAGAAGGCCCGCCTCACCCCGCCAAGGTGTCCGGCTTCTGGATTGAc < 1:605404/150‑1 (MQ=255) cTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCTTTTACGACGAAGAAGGCCCGCCTCACCCCGCCAAGGTGTCCGGCTTCTGGATTGACgg < 2:1364617/150‑2 (MQ=255) tACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCTTTTACGACGAAGAAGGCCCGCCTCACCCCGCCAAGGTGTCCGGCTTCTGGATTGACGTg < 1:1886315/150‑1 (MQ=255) tACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCTTTTACGACGAAGAAGGCCCGCCTCACCCCGCCAAGGTGTCCGGCTTCTGGATTGACGTg < 2:2008878/150‑1 (MQ=255) aGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCTTTTACGACGAAGAAGGCCCGCCTCACCCCGCCAAGGTGTCCGGCTTCTGGATTGACGTGCAt > 1:2302899/1‑150 (MQ=255) gCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCTTTTACGACGAAGAAGGCCCGCCTCACCCCGCCAAGGTGTCCGGCTTCTGGATTGACGTGCATCCgg < 2:354137/150‑1 (MQ=255) ccTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCTTTTACGACGAAGAAGGCCCGCCTCACCCCGCCAAGGTGTCCGGCTTCTGGATTGACGTGCATCCGGt < 2:2302899/150‑1 (MQ=255) cTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCTTTTACGACGAAGAAGGCCCGCCTCACCCCGCCAAGGTGTCCGGCTTCTGGATTGACGTGCATCCGGTc > 1:1613178/1‑150 (MQ=255) cgcgCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGATGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCTTTTACGACGAAGAAGGCCCGCCTCACCCCGCCAAGGTGTCCGGCTTCTGGATTGACGTGCATCCGGTCACCaa > 1:1769860/1‑150 (MQ=255) tcgcCAAGGGCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCTTTTACGACGAAGAAGGCCCGCCTCACCCCGCCAAGGTGTCCGGCTTCTGGATTGACGTGCATCCGGTCACCAACGCCCa > 1:1302453/2‑150 (MQ=255) aaGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCTTTTACGACGAAGAAGGCCCGCCTCACCCCGCCAAGGTGTCCGGCTTCTGGATTGACGTGCATCCGGTCACCAACGCCCAGTTcg > 2:1937174/1‑150 (MQ=255) gCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCTTTTACGACGAAGAAGGCCCGCCTCACCCCGCCAAGGTGTCCGGCTTCTGGATTGACGTGCATCCGGTCACCAACGCCCAGTTcgcgc < 2:1309654/150‑1 (MQ=255) gCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCTTTTACGACGAAGAAGGCCCGCCTCACCCCGCCAAGGTGTCCGGCTTCTGGATTGACGTGCATCCGGTCACCAACGCCCAGTTcgcgc > 1:283151/1‑150 (MQ=255) gCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGGGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCTTTTACGACGAAGAAGGCCCGCCTCACCCCGCCAAGGTGTCCGGCTTCTGGATTGACGTGCATCCGGTCACCAACGCCCAGTTcgcgc < 2:912057/150‑1 (MQ=255) | TGGTCAAGCCGCAATGATCGCCCGGGCAGCCGGCTGCGCAGCACTCGCCACCGGCCTGCTCGCCGCCGCCTATGCCGTGTGGCCGCAAGCCCCGGCGCCGGCGCTGCTGTGTACGGGCTACAGCGGCCTGCCCGCGCAGCGCCAAGGCCCTTGGCGAGACGGCATGGTGCACGTGCCGGGCGGCGAGTTCAGCTTTGGTTCAAGCCGCTTTTACGACGAAGAAGGCCCGCCTCACCCCGCCAAGGTGTCCGGCTTCTGGATTGACGTGCATCCGGTCACCAACGCCCAGTTCGCGC > NC_002947/3790587‑3790882 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |