| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,799,989 | G→T | 8.7% | R94M (AGG→ATG) ‡ | PP_3360 → | membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,799,989 | 0 | G | T | 8.7% | 290.1 / 10.9 | 92 | R94M (AGG→ATG) ‡ | PP_3360 | membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (43/41); new base T (4/4); total (47/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.50e-01 | |||||||||||
CGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGCAACCCTTTCAGCCTG > NC_002947/3799841‑3800136 | cgcCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAgg < 2:1462743/150‑1 (MQ=255) gcCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAggg < 1:1357326/150‑1 (MQ=255) ccGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCACCTTACTGTTGTTGCTAGCCTCCTTTCCGGCCTGCTGTAACATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGt < 1:657421/150‑1 (MQ=255) ctgttCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCtgtg < 1:2139051/146‑1 (MQ=255) tGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTcag > 1:2054649/1‑140 (MQ=255) tGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTcag < 2:2054649/140‑1 (MQ=255) ggTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGt < 1:435398/150‑1 (MQ=255) gTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGtt > 1:1202613/1‑150 (MQ=255) ccGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGAAGCGTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCg < 1:1232316/150‑1 (MQ=255) acGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTcg > 1:289252/1‑150 (MQ=255) gAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCCTGGTcagcca < 2:1967725/131‑3 (MQ=255) gAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCCTGGTcagcca > 1:1967725/1‑129 (MQ=255) gAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTcgcg > 1:1651260/1‑150 (MQ=255) gAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCCGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCATCCTGTGGTTCGTGGTcgcg > 2:1590061/1‑150 (MQ=255) ggCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGcc < 1:2116945/150‑1 (MQ=255) ccACTGAGATATAGAATGTCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTg < 2:516916/150‑1 (MQ=255) cACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGc < 1:580206/150‑1 (MQ=255) aCTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCa > 2:1015246/1‑150 (MQ=255) aGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGAtt < 1:152914/150‑1 (MQ=255) ccAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTg < 1:1466378/130‑1 (MQ=255) ccAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTg > 2:1466378/1‑130 (MQ=255) cAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCCTGGTcagcca > 2:496605/1‑114 (MQ=255) cAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCCTGGTcagcca < 1:496605/116‑3 (MQ=255) cAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGc < 2:1688499/150‑1 (MQ=255) aaTGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCtgtg < 2:2213461/150‑1 (MQ=255) aaTGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCtgtg < 2:1990647/150‑1 (MQ=255) aTGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTgg > 2:300573/1‑150 (MQ=255) tGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTggg > 2:2024806/1‑150 (MQ=255) cAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCaa > 1:578851/1‑150 (MQ=255) cAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCaa > 1:2358715/1‑150 (MQ=255) cAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCaa > 1:1588191/1‑150 (MQ=255) aaGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAAc > 2:376987/1‑150 (MQ=255) ggTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGCGCGCTGGCTGACTTGGGGGAGCAGCCTGTGGTGCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACcg > 1:285466/1‑150 (MQ=255) ggTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACcg > 1:25787/1‑150 (MQ=255) gCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCgcgc > 2:1524994/1‑150 (MQ=255) cTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCCTGGTcagcca < 1:1580378/98‑3 (MQ=255) cTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCCTGGTcagcca > 2:1580378/1‑96 (MQ=255) cTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGcc > 1:456757/1‑150 (MQ=255) tCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATc > 1:16307/1‑150 (MQ=255) tCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATc < 2:2358715/150‑1 (MQ=255) ggCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCggc > 2:2207463/1‑150 (MQ=255) gCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCggcc > 2:203663/1‑150 (MQ=255) ccAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCggcctgg < 2:25787/150‑1 (MQ=255) cAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTcagcag > 2:432960/1‑87 (MQ=255) cAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTcagcag < 1:432960/87‑1 (MQ=255) aGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCggcctgggc < 1:1472281/150‑1 (MQ=255) cAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTAAGCAGCGTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGCTTGGCCTGTGGGCCAACCGGGCCATCggcctgggcct < 2:1017603/150‑1 (MQ=255) aaCTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGc < 2:536659/117‑1 (MQ=255) aaCTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGc > 1:536659/1‑117 (MQ=255) aaCTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCggcctgggccgg > 2:1116188/1‑148 (MQ=255) aCTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCCGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGa < 1:1590061/150‑1 (MQ=255) cTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTgg > 2:617632/1‑95 (MQ=255) cTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTgg < 1:617632/95‑1 (MQ=255) tttCGGTTGTTGCTGGCCGCCGTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCTCGCGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGTTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGTGCCATCCGCGTCATCGGTCTGGGCCTGAGc < 2:542345/150‑1 (MQ=255) tCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGACCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCg > 2:646554/1‑150 (MQ=255) ttgCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTc < 1:1718460/150‑1 (MQ=255) ttgCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTc > 1:2179646/1‑150 (MQ=255) ttgCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTc < 1:586287/150‑1 (MQ=255) ttgCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCAGGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTc > 1:2246233/1‑150 (MQ=255) ctcctTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCa < 2:2369201/150‑1 (MQ=255) cctTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCAcc < 1:885238/150‑1 (MQ=255) ctTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAgg > 1:444617/1‑52 (MQ=255) ctTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAgg < 2:444617/52‑1 (MQ=255) ttGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGt > 1:1790697/1‑150 (MQ=255) cTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCtt < 2:2097481/80‑1 (MQ=255) cTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCtt > 1:2097481/1‑80 (MQ=255) gtggGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGAc > 1:340582/1‑150 (MQ=255) tggGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGc < 2:1654830/78‑1 (MQ=255) tggGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGc > 1:1654830/1‑78 (MQ=255) gCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGCTCGGCTTGTGGGCCACCCGCGCCATCGGCCTTGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGcc < 1:1374828/150‑1 (MQ=255) ccTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCt < 1:376987/150‑1 (MQ=255) ccTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCATACCGACGGCCt > 1:353629/1‑150 (MQ=255) cTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCAACGTACCGACGGCCTg > 2:673861/1‑150 (MQ=255) aGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCGTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGGAGATTGGCCTGTTGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGCGCCGTTCCTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAAc < 2:1955176/150‑1 (MQ=255) cATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCa < 2:289252/150‑1 (MQ=255) aTGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCac < 2:1651260/150‑2 (MQ=255) aTGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAg < 2:826490/150‑1 (MQ=255) aTGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAg < 1:1524994/150‑1 (MQ=255) cTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGt > 2:1975741/1‑111 (MQ=255) cTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGt < 1:1975741/111‑1 (MQ=255) tGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCAc > 1:1975214/1‑150 (MQ=255) gCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACt > 1:2347205/1‑150 (MQ=255) cGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGc > 2:7507/1‑150 (MQ=255) cGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGc > 2:49408/1‑150 (MQ=255) gAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGc < 1:1004617/68‑1 (MQ=255) gAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGc > 2:1004617/1‑68 (MQ=255) gcgcTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGACAAc < 1:673861/150‑1 (MQ=255) tgctgACCCTGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGCaa < 1:2150421/143‑1 (MQ=255) tgctgACCCTGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGCaa > 2:2150421/2‑144 (MQ=255) ccAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGc < 1:1705643/136‑1 (MQ=255) ccAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGc > 2:1705643/1‑136 (MQ=255) ccAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGCAACCCTTTCAGcc < 2:1061778/149‑1 (MQ=255) ccAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGCAACCCTTTCAGcc > 1:1061778/1‑149 (MQ=255) cAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGa < 2:426953/80‑1 (MQ=255) cAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGa > 1:426953/1‑80 (MQ=255) cAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCAGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGCAACCCTTTCAGCCTg > 2:1071950/1‑150 (MQ=255) gggTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGt > 1:2058553/1‑83 (MQ=255) gggTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGt < 2:2058553/83‑1 (MQ=255) | CGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTGAACCAGGGCAGCGCACTGGCAACCCTTTCAGCCTG > NC_002947/3799841‑3800136 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |