| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 335,436 | A→T | 5.4% | intergenic (‑39/+165) | PP_0277 ← / ← PP_5437 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 335,436 | 0 | A | T | 5.4% | 282.5 / 5.1 | 94 | intergenic (‑39/+165) | PP_0277/PP_5437 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (45/42); new base T (2/3); total (48/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.83e-01 | |||||||||||
GCCGGGGTGGTTCCAGCCCAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACGGG > NC_002947/335287‑335585 | gCCGGGGTGGTTCCAGCCCAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCCCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCa > 2:313907/1‑150 (MQ=255) ccGGGGTGGTTCCAGCCCAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCaa > 1:2364447/1‑150 (MQ=255) gtgttgtTCGAGCCCAGCTTGCTGCTGGTGTGGGGCGTGGTGCCGCCGGCCCAGCCGGTCAGGGCTAGGGCGAGGGTCAAGAGGGCGACGGGGTTGGCTCGGGTGACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACgg < 2:792551/145‑2 (MQ=255) gtTCCAGCCCAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGTTGCGCCAGaa < 2:87787/150‑1 (MQ=255) gtTCCAGCCCAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGaa < 2:605442/150‑1 (MQ=255) ttCCAGCCCAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGTTGCGCCAGaac < 1:689447/150‑2 (MQ=255) cAGCCCAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGGGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTc > 1:1599794/1‑150 (MQ=255) gcggTTGCTGGGGGGGTGGGGGGTGGTGCCGCCGCCGCAGCCGGTGAGGGCGAGGGCGAGGGTAGACAGGGCGAGGGGGTTGGTTCGGGTCGCGATGCTCAGGTCCGGTGGGCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCggg < 2:365628/148‑1 (MQ=255) cAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGaa > 1:1275610/1‑141 (MQ=255) cAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGaa < 2:1275610/141‑1 (MQ=255) ttGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGc > 2:310287/1‑150 (MQ=255) ttGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGc > 2:2197838/1‑150 (MQ=255) tggggtggggCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCGGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCa < 1:1682601/150‑1 (MQ=255) tggggtggggAGAGTTGCCTCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCGGGGCGAAGGTCAACAGGGCGGGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCa < 2:14479/150‑1 (MQ=255) gggtggggCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGGGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGaa < 2:1116015/128‑1 (MQ=255) gggtggggCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGCGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTGCTGGCGCAACGCCAGaa > 1:1116015/1‑128 (MQ=255) ggCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGTTGCACGGCAGAAGGGCGCGGGGCTGGCGGGCGGCGCGCGa > 1:1933203/1‑150 (MQ=255) ggCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCgaga > 1:255075/1‑150 (MQ=255) gTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGGTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCAc > 2:879253/1‑150 (MQ=255) ccgccgGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTcgc < 2:1563637/119‑1 (MQ=255) ccgccgGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTcgc > 1:1563637/1‑119 (MQ=255) ccgccgGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACttt > 2:2099127/1‑150 (MQ=255) ccgccgGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACttt > 2:785794/1‑150 (MQ=255) ccgccgGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACttt > 1:1685406/1‑150 (MQ=255) ggCCGGTGAGGGCGAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGAttt < 2:1017671/149‑1 (MQ=255) aGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGAttt < 1:2197838/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGAttt > 1:302870/1‑150 (MQ=255) ccGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTgg > 2:112842/1‑150 (MQ=255) ccGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTgg > 1:226140/1‑150 (MQ=255) cGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTggg < 1:785794/150‑1 (MQ=255) tCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTGTTAATGATTTgggggg > 1:497818/1‑150 (MQ=255) agggccagggcGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGCAAGTCGCTTGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGc > 2:676607/1‑150 (MQ=255) ggccagggcGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCgg > 1:2260459/1‑150 (MQ=255) ggccagggcGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCgg < 1:1918890/150‑1 (MQ=255) 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gTCAACAGGGCGAGGGGATTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGtt > 2:2059815/1‑150 (MQ=255) tCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTg > 2:2096911/1‑150 (MQ=255) aaCAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCgg < 1:1389481/85‑1 (MQ=255) aaCAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCgg > 2:1389481/1‑85 (MQ=255) aCAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCgg < 2:2364447/150‑1 (MQ=255) aCAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCgg < 1:310287/150‑1 (MQ=255) cAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGgat > 2:276839/1‑134 (MQ=255) cAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGgat < 1:276839/134‑1 (MQ=255) gAGGGGGTTGGCTCGGGTCAGGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGa < 2:1911014/150‑1 (MQ=255) gAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGTTGCGCCAGaa > 1:1964515/1‑69 (MQ=38) ggTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCAtt > 2:385177/1‑150 (MQ=255) gTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTa > 2:2057370/1‑150 (MQ=255) tGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGc < 1:385177/150‑1 (MQ=255) ggCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGCCACTTTTTAATGATTTGCCGCCGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGcc > 1:1932537/1‑150 (MQ=255) cTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCtt < 1:2096911/150‑1 (MQ=255) cTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGAGGAGCATTAGCCtt > 2:1422137/1‑150 (MQ=255) tCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTtg > 1:1369705/1‑150 (MQ=255) gTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGc < 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gATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTg > 2:2197948/1‑127 (MQ=255) aTGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTgg < 2:2260459/150‑1 (MQ=255) aTGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTgg < 1:2057370/150‑1 (MQ=255) tCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGgatga > 2:1896420/1‑104 (MQ=255) tCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGgatga < 1:1896420/104‑1 (MQ=255) tCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATg > 2:562979/1‑150 (MQ=255) 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tCCAGTGTCGGTTCTGGCGCAACGCTAGAGGGTTGCGGACCTGGCGGTTAGCGCGCGTAGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGTGCGGATGATACCCCTTTGCGGGCGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCggg < 1:198938/150‑1 (MQ=255) ccATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGt > 1:1694626/1‑150 (MQ=255) ccATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGt > 1:503047/1‑150 (MQ=255) cgTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGAGACACCGCTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAAc < 2:697904/149‑1 (MQ=255) tCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTgg < 2:2216374/126‑1 (MQ=255) tCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTgg > 1:2216374/1‑126 (MQ=255) ggTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTaa < 1:1089503/62‑1 (MQ=255) ggTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTaa > 2:1089503/1‑62 (MQ=255) ggTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGc > 2:1004032/1‑150 (MQ=255) gTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCt > 1:2125171/1‑150 (MQ=255) cttCTGGCGTTGCGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCt > 1:2377795/2‑150 (MQ=255) ttCTGGCGTTGCGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATgg < 1:1312114/127‑1 (MQ=255) ttCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCggg < 2:101924/139‑1 (MQ=255) ttCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCggg > 1:101924/1‑139 (MQ=255) gcgcAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGgat > 2:1820855/1‑73 (MQ=255) gcgcAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGgat < 1:1820855/73‑1 (MQ=255) aaCGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCAt > 2:47984/1‑95 (MQ=255) aaCGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCAt < 1:47984/95‑1 (MQ=255) aaCGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACggg > 1:2040161/1‑150 (MQ=255) | GCCGGGGTGGTTCCAGCCCAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACGGG > NC_002947/335287‑335585 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |