Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,920,669 | G→C | 6.7% | R381G (CGG→GGG) | acs ← | acyl‑CoA synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,920,669 | 0 | G | C | 6.7% | 226.3 / 5.0 | 74 | R381G (CGG→GGG) | acs | acyl‑CoA synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/33); new base C (3/2); total (39/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 |
ATCCAGCCCTCTGCGTCGATGCTCTCGGCGGTGGCTTTGGGGTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGCCATAGGCAATCTGCACTTCGGCCATGTGCATCTCGCCAATCACCCGGCGCATC > NC_002947/3920521‑3920811 | aTCCAGCCCTCTGCGTCGATGCTCTCGGCGGTGGCTTTGGGGTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCgg < 1:627292/150‑1 (MQ=255) aTCCAGCCCTCTGCGTCGATGCTCTCGGCGGTGGCTTTGGGGTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCgg < 1:881592/150‑1 (MQ=255) tCCAGCCCTCTGCGTCGATGCTCTCGGCGGTGGCTTTGGGGTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCggg > 2:2094176/1‑150 (MQ=255) ccAGCCCTCTGCGTCGATGCTCTCGGCGGTGGCTTTGGGGTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCgggg < 2:741296/150‑1 (MQ=255) aGCCCTCTGCGTCGATGCTCTCGGCGGTGGCTTTGGGGTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCt > 2:1564681/1‑150 (MQ=255) aGCCCTCTGCGTCGATGCTCTCGGCGGTGGCTTTGGGGTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCt > 2:2052627/1‑150 (MQ=255) tctGCGTCGATGCTCTCGGCGGTGGCTTTGGGGTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTg < 2:621395/150‑1 (MQ=255) gCGTCGATGCTCTCGGCGGTGGCTTTGGGGTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGcga < 1:1532154/150‑1 (MQ=255) gTCGATGCTCTCGGCGGTGGCTTTGGGGTTGTTGCAGTAACCCAGCATCACGGTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGcgacc > 2:28726/1‑150 (MQ=255) tGCTCTCGGCGGTGGCTTTGGGGTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCTGCTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGcga < 1:1488874/143‑1 (MQ=255) tGCTCTCGGCGGTGGCTTTGGGGTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGcga > 2:1488874/1‑143 (MQ=255) tctcGGCGGTGGCTTTGGGGTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTgg > 1:580305/1‑150 (MQ=255) tcGGCGGTGGCTTTGGGGTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTc < 2:650514/150‑1 (MQ=255) cggTGGCTTTGGGGTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCAcgc < 1:1882174/150‑1 (MQ=255) tGGCTTTGGGGTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGAc > 1:1321223/1‑150 (MQ=255) gCTTTGGGGTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGc < 2:181239/150‑1 (MQ=255) tttGGGGTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTc > 2:1887448/1‑150 (MQ=255) tttGGGGTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTc > 1:492215/1‑150 (MQ=255) ggggTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCg > 2:1128321/1‑111 (MQ=255) ggggTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCg < 1:1128321/111‑1 (MQ=255) ttCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCCCGGCTggaga < 2:147242/114‑4 (MQ=255) ttCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCCCGGCTggaga > 1:147242/1‑111 (MQ=255) tCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAg > 1:2285460/1‑150 (MQ=255) cAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCg > 1:1912903/1‑150 (MQ=255) aGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCgg > 1:353017/1‑150 (MQ=255) ccAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCgg > 2:938262/1‑150 (MQ=255) ccAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCg < 2:539974/149‑1 (MQ=255) ccAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACAGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCg > 1:539974/1‑149 (MQ=255) cAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGt < 1:2052627/150‑1 (MQ=255) cACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCaa < 2:353017/150‑1 (MQ=255) gCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGa > 2:153369/1‑150 (MQ=255) gCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGa < 2:580305/150‑1 (MQ=255) cgGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGTTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTg < 2:1629316/150‑1 (MQ=255) cgGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTg < 2:2389787/150‑1 (MQ=255) acaGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACAcc > 1:1844298/1‑137 (MQ=255) acaGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACAcc < 2:1844298/137‑1 (MQ=255) acaGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGtc > 2:1804580/1‑146 (MQ=255) acaGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGtc < 1:1804580/146‑1 (MQ=255) acaGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCgg > 2:1032635/1‑150 (MQ=255) ttCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCaa < 2:2212100/126‑1 (MQ=255) ttCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCaa > 1:2212100/1‑126 (MQ=255) ttCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCAt > 2:2339547/1‑150 (MQ=255) tCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATg < 1:2094176/150‑1 (MQ=255) cACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGc < 1:1564681/150‑1 (MQ=255) cACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAACCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGc < 1:1588921/150‑1 (MQ=255) aCCGATCTCGCCACGCGGGACGGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGcc > 2:1865963/1‑150 (MQ=255) aCCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGc > 1:2208206/1‑149 (MQ=255) aCCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGc < 2:2208206/149‑1 (MQ=255) gATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGCCATa < 1:1887448/150‑1 (MQ=255) tcGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCCCGGCTggaga < 2:1095482/63‑4 (MQ=255) tcGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCCCGGCTggaga > 1:1095482/1‑60 (MQ=255) gcgGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGCCATAGGCAATCTGCa > 1:245001/1‑150 (MQ=255) aCAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGCCATAGGCAATCTGCACTTCg < 2:245001/150‑1 (MQ=255) gtgtTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCg > 2:1668117/1‑87 (MQ=255) gtgtTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCg < 1:1668117/87‑1 (MQ=255) ttGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAg < 1:238266/99‑1 (MQ=255) ttGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAg > 2:238266/1‑99 (MQ=255) ttGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATg < 2:443166/123‑1 (MQ=255) ttGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATg > 1:443166/1‑123 (MQ=255) ttGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGCTCTCGGTCATGCCATAGGCAATCTGCACTTCGCCCAtg > 2:169761/1‑150 (MQ=255) tGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGCCATAGGCAATCTGCACTTCGGCCAtgt < 2:1912903/150‑1 (MQ=255) ttCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGCCATAGGCAATCTGCACTTCGGCCATGTGCAt > 2:407715/1‑150 (MQ=255) cGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCg > 1:2400494/1‑74 (MQ=255) cGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCg < 2:2400494/74‑1 (MQ=255) accaccTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGCCATAGGCAATCTGCACTTCGGCCATGTGCATCTCGCCAATc > 1:1092089/1‑150 (MQ=255) ccaccTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGCCATAGGCAATCTGCACTTCGGCCATGTGCATCTCGCCAATCa > 2:2220432/1‑150 (MQ=255) accTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGCCATAGGCAATCTGCACTTCGGCCATGTGCATCTCGCCAATCAcc > 1:483643/1‑150 (MQ=255) accTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGCCATAGGCAATCTGCACTTCGGCCATGTGCATCTCGCCAATCAcc < 2:492215/150‑1 (MQ=255) ccTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAg > 2:664503/1‑55 (MQ=255) ccTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAg < 1:664503/55‑1 (MQ=255) ccTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGCCATAGGCAATCTGCACTTCGGCCATGTGCATCTCGCCAATCAccc < 1:153369/150‑1 (MQ=255) cTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGCCATAGGGAATCTGCACTTCGGCCATGTGCATCTCGCCAATCACCCg > 1:1935492/1‑150 (MQ=255) cTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTAACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGCCATAGGCAATCTGCACTTCGGCCATGTGCATCTCGCCAATCACCCg > 1:2285559/1‑150 (MQ=255) gCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCg > 1:1215254/1‑83 (MQ=255) gCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCg < 2:1215254/83‑1 (MQ=255) tctcCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGCCATAGGCAATCTGc < 2:2339314/113‑1 (MQ=255) tctcCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGCCATAGGCAATCTGc > 1:2339314/1‑113 (MQ=255) ctcCGGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCACGGACCCCGGGCTGGTCTCGGTCATGCCATAGGCAATCTGCACTTCGGCCATGTGCATCTCGCCAATCACCCGGCGCAt < 2:1014149/150‑1 (MQ=255) acccAGCCCCGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGCCATAGGCAATCTGCACTTCGGCCATGTGc > 2:1126624/3‑127 (MQ=255) tcCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGCCATAGGCAATCTGCACTTCGGCCATGTGCATCTCGCCAATCACCCGGCGCATc < 1:2339547/150‑1 (MQ=255) | ATCCAGCCCTCTGCGTCGATGCTCTCGGCGGTGGCTTTGGGGTTGTTCCAGTAACCCAGCATCACGCTGTAGCCGCGGGTGCACAGTTCACCGATCTCGCCACGCGGGACAGTGTTGCCTTCAGCGTCCACCACCTTGCTCTCCAGCCGGGGCTGGGTGCGACCGACGCTGGTCACGCGACGCTCCAGGTCGTCAGCGGCACCGGTCTGCAAGGACACCGGGCTGGTCTCGGTCATGCCATAGGCAATCTGCACTTCGGCCATGTGCATCTCGCCAATCACCCGGCGCATC > NC_002947/3920521‑3920811 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |