| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,924,743 | C→T | 5.9% | G39S (GGC→AGC) | peaB ← | quinohemoprotein amine dehydrogenase modification protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,924,743 | 0 | C | T | 5.9% | 258.4 / 4.4 | 85 | G39S (GGC→AGC) | peaB | quinohemoprotein amine dehydrogenase modification protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/44); new base T (3/2); total (39/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.30e-01 | |||||||||||
GTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCAGTAGTACGCCCATGGCGACCTCCCGATAATCGATCCGTTGGAAAA > NC_002947/3924595‑3924889 | gTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGccgccg > 1:450764/1‑150 (MQ=255)gTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGccgccg < 1:158164/150‑1 (MQ=255) tCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCgg > 2:1532086/1‑150 (MQ=255) tCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCgg > 2:2125001/1‑150 (MQ=255) gcggcgAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCa > 1:1729269/1‑150 (MQ=255) gAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACcgc‑g > 2:884130/1‑150 (MQ=255) ccAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGAAGACGTTCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACa < 1:1376491/150‑1 (MQ=255) cAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAg > 1:2346331/1‑150 (MQ=255) aGCGCCAGCGCGATCAGGTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTTTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGc < 2:282540/150‑1 (MQ=255) ttgtccaacggatcgattatcgggaggtcgccatgggcgtactactgaacctggtcgaacgcaacctgcacgaagtacaggttgatgccgaccgcatgctgttccatatccccagcagttCGCTGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCg > 2:125426‑M1/121‑150 (MQ=255) accctgcgcGAACTGATCGCGCTGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACcgc > 1:331959/6‑132 (MQ=255) aacggatcgattatcgggaggtcgccatgggcgtactactgaacctggtcgaacgcaacctgcacgaagtacaggttgatgccgaccgcatgctgttccatatccccagcagttCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCgg > 1:2366081‑M1/115‑135 (MQ=255) aacggatcgattatcgggaggtcgccatgggcgtactactgaacctggtcgaacgcaacctgcacgaagtacaggttgatgccgaccgcatgctgttccatatccccagcagttCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCgg < 2:2366081‑M1/21‑1 (MQ=255) cgATTAGTTCGCACAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGTCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTgg < 1:768576/150‑1 (MQ=255) cgATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGCCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTgg < 1:632994/150‑1 (MQ=255) gATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTggg > 1:492081/1‑150 (MQ=255) gATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTggg < 2:812508/150‑1 (MQ=255) gTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTg > 2:1765523/1‑128 (MQ=255) gTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTg < 1:1765523/128‑1 (MQ=255) gTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGatat < 2:533701/150‑1 (MQ=255) gTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGatat > 1:1857432/1‑150 (MQ=255) ttCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATg < 1:1532086/150‑1 (MQ=255) ttCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATg > 1:1865880/1‑150 (MQ=255) gcAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACa > 2:2341365/1‑150 (MQ=255) gcAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACa < 2:957239/150‑1 (MQ=255) gcAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACa < 1:1213739/150‑1 (MQ=255) gtCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCg < 2:450764/150‑1 (MQ=255) cTGGCTCTCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTc > 2:713539/1‑150 (MQ=255) cTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTc > 1:1494909/1‑150 (MQ=255) cTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTc > 2:885860/1‑150 (MQ=255) cTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTc < 2:1481919/150‑1 (MQ=255) ggATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCTAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCgg > 2:802862/1‑150 (MQ=255) tatCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCAt < 1:1179426/150‑1 (MQ=255) atCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATc < 1:564429/150‑1 (MQ=255) ccTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCaa < 1:713539/150‑1 (MQ=255) cTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAAc > 2:1114718/1‑150 (MQ=255) tCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAActgctg > 1:2212858/1‑117 (MQ=255) tCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAActgctg < 2:2212858/117‑1 (MQ=255) gCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTg < 2:1865880/150‑1 (MQ=255) cGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAAc > 1:313203/1‑145 (MQ=255) cGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAAc < 2:313203/145‑1 (MQ=255) aaaCTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCGACCTGTACTTc < 2:1494909/150‑1 (MQ=255) aaaCTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTc < 1:1556398/150‑1 (MQ=255) tgctgGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGc > 1:183541/1‑150 (MQ=255) ctgGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAg < 1:884130/150‑1 (MQ=255) tgGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAgg < 1:332068/150‑1 (MQ=255) tgGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAgg > 2:1020634/1‑150 (MQ=255) gCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCgg > 2:2051667/1‑125 (MQ=255) gCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCgg < 1:2051667/125‑1 (MQ=255) ccAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCg > 2:1361223/1‑81 (MQ=255) ccAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCg < 1:1361223/81‑1 (MQ=255) cAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGc > 2:481776/1‑150 (MQ=255) gcTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGa < 2:1336019/150‑1 (MQ=255) aTCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAgg < 1:2125001/150‑1 (MQ=255) tCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGt > 2:1470081/1‑150 (MQ=255) gCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCa < 1:885860/150‑1 (MQ=255) ctcctcGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCag < 1:2320945/150‑1 (MQ=255) ctcctcGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCag < 1:2385247/150‑1 (MQ=255) ctcGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCagtag > 2:1392086/1‑150 (MQ=255) tcGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCt > 2:1265693/1‑112 (MQ=255) tcGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCt < 1:1265693/112‑1 (MQ=255) tcGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCagtagt > 1:1734600/1‑150 (MQ=255) tcGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGCGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTc > 2:50389/1‑101 (MQ=255) tcGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGCGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTc < 1:50389/101‑1 (MQ=255) gAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCAGTAGTACGccc < 1:802862/150‑1 (MQ=255) ccTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCAGTAGTACGCCCATGGCg < 1:2154840/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCAGTAGTACGCCCATGGCGAcc < 1:227364/150‑1 (MQ=255) gcgcAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCg > 2:1304231/1‑100 (MQ=255) gcgcAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCg < 1:1304231/100‑1 (MQ=255) cgcAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGTGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCAGTAGTACGCCCATGGCGACCTCCCGa < 2:2346331/150‑1 (MQ=255) catatccccagcagttCGCTGTTCACCGCTGAC‑GCGGTGACCGGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCAGTAGTACGCCCATGGCGACCTcc > 1:2262058‑M1/17‑144 (MQ=255) catatccccagcagttCGCTGTTCACCGCTGAC‑GCGGTGACCGGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCAGTAGTACGCCCATGGCGACCTcc < 2:2262058‑M1/128‑1 (MQ=255) aGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATCTGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCAGTAGTACGCCCATGGCGACCTCCCGATAAt < 1:327243/150‑1 (MQ=255) tCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCAGTAGTACGCCCATGGCGACCTCCCGATAATCGATc > 1:603301/1‑150 (MQ=255) ccagcagttCGCTGTTCACCGCTGAC‑GCGGTGACCGGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAg > 1:2023039‑M1/10‑109 (MQ=255) ccagcagttCGCTGTTCACCGC‑TGACGCGGTGACCGGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAg < 2:2023039‑M1/100‑1 (MQ=255) gatgatGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCAGTAGTACGCCCATGGCGACCTCCCGATAATCGATCCg > 2:585511/1‑150 (MQ=255) atgatgCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCAGTAGTACGCCCATGGCGACCTCCCGATAATCGATCCGt > 1:2248889/1‑150 (MQ=255) tgatgCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCAGTAGTACGCCCATGGCGACCTCCCGATAATCGATCCGtt < 1:777394/150‑1 (MQ=255) gatgCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCAGTAGTACGCCCATGGCGACCTCCCGATAATCGATCCGTTg < 1:585511/150‑1 (MQ=255) gatgCCGCCGGTCACCGC‑GTAAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCAGTAGTACGCCCATGGCGACCTCCCGATAATCGATCCGTTg < 2:183541/150‑1 (MQ=255) atgCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCAGTAGTACGCCCATGGCGACCTCCCGATAATCGATCCGTTgg > 2:1974165/1‑150 (MQ=255) CGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGtgccg > 2:1553428‑M1/1‑83 (MQ=255) CGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAg < 1:1553428‑M1/85‑1 (MQ=255) CGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCAGTAGTACGccc < 1:1997018‑M1/116‑1 (MQ=255) CGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCAGTAGTACGccc > 2:1997018‑M1/1‑116 (MQ=255) CGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGGACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCAGTAGTACGCCCATGGCGACCTCCCGATAATCGATCCGTTGGaaaa < 1:1974526‑M1/150‑1 (MQ=255) | GTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTGGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGC‑GTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGGGATATGGAACAGCATGCGGTCGGCATCAACCTGTACTTCGTGCAGGTTGCGTTCGACCAGGTTCAGTAGTACGCCCATGGCGACCTCCCGATAATCGATCCGTTGGAAAA > NC_002947/3924595‑3924889 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |