| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,943,063 | T→A | 6.1% | K292* (AAG→TAG) | PP_3478 ← | secretion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,943,063 | 0 | T | A | 6.1% | 269.3 / 4.9 | 82 | K292* (AAG→TAG) | PP_3478 | secretion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/40); new base A (3/2); total (40/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.72e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
CTCCACTTCCAGCACCACCTCGGGGTTGGACTGGTCCTGCGACTGCAGCAGCTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTGCGGCGAATCGGGGTAGACCATGACGGTGTTGTCGTTGACGATCTTCTGGCGCAGCTGGTTTTGC > NC_002947/3942917‑3943211 | cgccACTTCCAGCACCACCTCGGGGTTGGACTGGTCCTGCGACTGCAGCAGCTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGAc > 2:1243914/3‑150 (MQ=255)cTCCACTTCCCGCACCACCTCGGGGTTGGACTGGTCCGGCGACTGAAGCAGCTTCCCGGCCCTGCCCACCGCGTCCGGCTTGTCGCGCAGGGGCAGGGTGTTTAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGAc < 2:2079205/150‑1 (MQ=255) tCCACTTCCAGCACCACCTCGGGGTTGGACTGGTCCTGCGACTGCAGCAGCTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGAcc > 1:1193218/1‑150 (MQ=255) ccACTTCCAGCACCACCTCGGGGTTGGACTGGTCCTGCGACTGCAGCAGCTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTACGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCa > 1:869209/1‑150 (MQ=255) cACTTCCAGCACCACCTCGGGGTTGGACTGGTCCTGCGACTGCAGCTGCTGCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGCAACGGCATTCAAAGGCAAATCAACAAACGCGTCTCGGTTCTTGAGCAGGGTCTAGatcgg > 2:2329337/1‑146 (MQ=255) cgCACCCCCTCGGAGTTGGACTTGTCCTGCGACTGCAGCAGCTCCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAACATGGTCAAGACCATGCTCaag < 1:564995/149‑2 (MQ=255) aGCACCACCTCGGGGTTGGACTTGTCCTGCGACTGCAGCAGCTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAAc < 1:1243914/150‑1 (MQ=255) ccacgTCGGGGTTGGACTCGTCCCGCTACTGCAGCAGGTTCTCGGACATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGTATGGTCAGGGTCTTGAGGCTATAGTCAACGAACACGTCTCGGGTCTTGAGCATGGTCCTGACCATGTTCAACGCgg < 2:114758/150‑1 (MQ=255) tCGGGGTTGGACTGGTCCTGCGACTGCAGCAGCTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTg < 2:798573/150‑1 (MQ=255) tCGGGGTTGGACTGGTCCTGCGACTGCAGCAGCTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTg < 2:2171185/150‑1 (MQ=255) ggTTGGACTGGTCCTGCGACTGCAGCAGCTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGt < 1:700961/150‑1 (MQ=255) ggACTGGTCCTGCGACTGCAGCAGCTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGAt < 2:856848/150‑1 (MQ=255) gACTGGTCCTGCGACTGCAGCAGCTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTAAGTAGTTTGTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATg > 1:22193/1‑150 (MQ=255) tGGTCCTGCGACTGCAGCAGCTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTg < 1:2190512/150‑1 (MQ=255) tCCTGCGACTGCAGCAGCTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTc > 1:1113776/1‑150 (MQ=255) cTGCGACTGCAGCAGCTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCaa > 1:960339/1‑149 (MQ=255) cTGCGACTGCAGCAGCTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAg > 2:1335781/1‑150 (MQ=255) cTGCGACTGCAGCAGCTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAg > 2:660418/1‑150 (MQ=255) gCGACTGCAGCAGCTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGt < 1:660418/150‑1 (MQ=255) cGACTGCAGCAGCTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATg < 2:1988813/139‑1 (MQ=255) cGACTGCAGCAGCTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATg > 1:1988813/1‑139 (MQ=255) cagcagCTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGt < 1:1992770/150‑1 (MQ=255) gcTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCa < 1:968206/150‑1 (MQ=255) cTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCAt > 1:233524/1‑150 (MQ=255) ttCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATg > 2:2071295/1‑150 (MQ=255) ctcGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGCGTGTAGAACCGCGCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGAc < 1:1740574/150‑1 (MQ=255) tcGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGtt < 2:1285540/113‑1 (MQ=255) tcGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGtt > 1:1285540/1‑113 (MQ=255) ggCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAg > 2:1894470/1‑150 (MQ=255) ggCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAg > 1:2250114/1‑150 (MQ=255) ggCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGATCAGGTAGAACATGCAAATGACCAg > 2:1942572/1‑150 (MQ=255) ggCCATGCGCACCGCGTACGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAg < 2:869209/150‑1 (MQ=255) ggCCATGCCCATCGCGACCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGTTGTTGAGGCGCTCGTAAACGAACACGTCGCGGGTCTTGTGCATGGTCTTGACCATCTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGACCGTGCGCATGACCAg < 2:744316/150‑1 (MQ=255) gCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAAcgc > 2:915630/1‑104 (MQ=255) gCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAAcgc < 1:915630/104‑1 (MQ=255) ccATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGtt < 2:130014/150‑1 (MQ=255) ccATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGtt > 2:2257315/1‑150 (MQ=255) ccATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGtt > 2:929175/1‑150 (MQ=255) cgcACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTgg < 1:1942572/150‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAg > 1:697278/1‑150 (MQ=255) cgcgTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTg > 2:383166/1‑100 (MQ=255) cgcgTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTg < 1:383166/100‑1 (MQ=255) cgTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCt < 1:2071295/150‑1 (MQ=255) cgTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCt < 1:1821546/150‑1 (MQ=255) tCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTg < 2:233524/150‑1 (MQ=255) tCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTg > 2:651271/1‑150 (MQ=255) gtCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTg > 1:2303254/1‑150 (MQ=255) cgcATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTgcggc < 2:195789/150‑1 (MQ=255) gcATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGtt > 2:2287376/1‑70 (MQ=255) gcATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGtt < 1:2287376/70‑1 (MQ=255) ccATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTgcggcg > 2:1657746/2‑150 (MQ=255) ggTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTGCGGCGAATc > 1:280453/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) tgtTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTGCGGCGAATCGGGGTAGa < 1:2398045/150‑1 (MQ=255) ttGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTGCGGCGAATCggg > 1:2041313/1‑143 (MQ=255) ttGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTGCGGCGAATCggg < 2:2041313/143‑1 (MQ=255) gAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAg < 2:1588605/84‑1 (MQ=255) gAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAg > 1:1588605/1‑84 (MQ=255) tCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTGCGGCGAATCGGGGTAGACCATGACGgtg < 1:1894470/150‑1 (MQ=255) 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gAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTGAGGCGAATCGGGGTAGACCATGACGGTGTTGTCGtt > 2:562437/1‑150 (MQ=255) acacGTCGCGGGTCTAGAGGAGGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTGCGGCGAATCGGGGTAGACCATGACGGTGTTGTCGTTGa > 2:1193061/1‑150 (MQ=255) acGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTGCGGCGAATCGGGGTAGACCATGACGGTGTTGTCGTTGACg < 2:1113776/150‑1 (MQ=255) tCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTGCGGCGAATCGGGGTAGACCATGACGGTGTTGTCGTTGACGAtc < 1:1196768/150‑1 (MQ=255) gcgGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTGCGGCGAATCGGGGTAGACCATGACGGTGTTGTCGTTGACGAtctt > 1:758015/1‑150 (MQ=255) tCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTGCGGCGAATCGGGGTAGACCATGACGGTGTTGTCGTTGACGATCTTCTGgc > 2:1445935/1‑150 (MQ=255) ttGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCa > 2:885255/1‑52 (MQ=255) ttGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCa < 1:885255/52‑1 (MQ=255) ttGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTGCGGCGAATCGGGGTAGACCATGACGGTGTTGTCGTTGACGATCTTCTGgcgc > 2:13579/1‑150 (MQ=255) gaacATGGTCAAGACCATGCTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTGCGGCGAATCGGGGTAGACCATGACGGTGTTGTCGTTGACGAtc > 2:2361547/4‑139 (MQ=255) gaacATGGTCAAGACCATGCTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTGCGGCGAATCGGGGTAGACCATGACGGTGTTGTCGTTGACGAtc < 1:2361547/136‑1 (MQ=255) aacATGGTCAAGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGCGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTGGGTCCTCTGCGGCGAATCGGGGTAGACCATGACGGTGTTGTGCTTGACGATCTTCTCGCGCAGc > 2:541492/3‑150 (MQ=255) ggTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTGCGGCGAATCGGGGTAGACCATGACGGTGTTGTCGTTGACGATCTTCTGGCGCAGCTGGtt < 1:2151399/150‑1 (MQ=255) ttGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTGCGGCGAATCGGGGTAGACCATGACGGTGTTGTCGTTGACGATCTTCTGGCGCAGCTGGTTTTGc < 1:1335781/150‑1 (MQ=255) | CTCCACTTCCAGCACCACCTCGGGGTTGGACTGGTCCTGCGACTGCAGCAGCTTCTCGGCCATGCGCACCGCGTCCGACGTGTCGCGCATGGTCAGGGTGTTGAGGCGCTCGTCAACGAACACGTCGCGGGTCTTGAGCATGGTCTTGACCATGTTCAACGCGGTGTTGGCGTCGATGCTGGTCAGGTAGAACGTGCGCATGACCAGTTCCTGGTAGTCCTTGGTCTTCTGCGGCGAATCGGGGTAGACCATGACGGTGTTGTCGTTGACGATCTTCTGGCGCAGCTGGTTTTGC > NC_002947/3942917‑3943211 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |