| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,981,210 | G→A | 5.1% | A179V (GCC→GTC) | cobW ← | adenosylcobalamin biosynthesis protein CobW |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,981,210 | 0 | G | A | 5.1% | 261.9 / 2.6 | 89 | A179V (GCC→GTC) | cobW | adenosylcobalamin biosynthesis protein CobW |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (42/42); new base A (3/2); total (45/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.70e-01 | |||||||||||
GCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACGGTAATGACCGCATCGACG > NC_002947/3981064‑3981359 | gcagcaCCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCa < 2:2050400/150‑1 (MQ=255)gcagcaCCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCa > 2:2208272/1‑150 (MQ=255) gcaCCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCCGCt > 2:845260/1‑150 (MQ=255) caCCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTg < 1:2080176/150‑1 (MQ=255) caCCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTg < 2:856539/150‑1 (MQ=255) cAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGAGGGACAGCGGGTGAGc > 2:1869946/1‑150 (MQ=255) gggCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGCTCACTTTCCCAGACGGGGGCAGGTCTTCGGGGGGGGCTGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGCCGGCCTTGTTCAACTCCACCCCGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCATCGaa < 2:1728317/149‑1 (MQ=255) cAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAg > 1:730533/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGc < 2:1336020/140‑1 (MQ=255) ttGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGc > 1:1336020/1‑140 (MQ=255) gCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTg > 2:1508491/1‑150 (MQ=255) tgctgGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAggg > 1:2273233/1‑150 (MQ=255) tgGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCg > 2:199830/1‑150 (MQ=255) tgGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCg > 2:1700397/1‑150 (MQ=255) ggCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACAACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGa > 2:58033/1‑150 (MQ=255) ggCCTCGAGCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTTCACCTGTACATCGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGa < 2:695242/150‑1 (MQ=255) cTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGACCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTc > 2:419301/1‑150 (MQ=255) tCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCa < 2:883890/150‑1 (MQ=255) tCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCACGTCACCCACCCTGGCCACGACCAGGTCGGCGCTGGCAAGATGGCCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCa > 1:1251448/1‑150 (MQ=255) tCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGt > 2:1227481/1‑150 (MQ=255) aCTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGACCAGCTGGCCAGCgccga > 2:226383/1‑120 (MQ=255) aCTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGACCAGCTGGCCAGCgccga < 1:226383/124‑5 (MQ=255) ccgccgGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAg < 1:1249386/150‑1 (MQ=255) cgccgGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAgg < 1:1554597/150‑1 (MQ=255) gccgGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAggg > 1:1155517/1‑150 (MQ=255) gcggcAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGa < 1:517957/150‑1 (MQ=255) gcggcAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTAAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGa > 1:915067/1‑150 (MQ=255) cggcAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAg < 1:199830/150‑1 (MQ=255) ttcGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGCTCAGGTCGTCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTg > 1:1254887/1‑150 (MQ=255) ttcGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTg > 2:1253545/1‑150 (MQ=255) gCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTa < 1:818284/129‑1 (MQ=255) gCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTa > 2:818284/1‑129 (MQ=255) gCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTgg < 1:2081960/147‑1 (MQ=255) gCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCATTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTgg > 2:2081960/1‑147 (MQ=255) ccACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCAt > 2:2181713/1‑150 (MQ=255) ccTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGa > 1:549302/1‑150 (MQ=255) cTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGAt > 1:1736437/1‑109 (MQ=255) cTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGAt > 1:1737758/1‑109 (MQ=255) cTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGAt < 2:1737758/109‑1 (MQ=255) cTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCtt < 2:893407/135‑1 (MQ=255) cTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCtt > 1:893407/1‑135 (MQ=255) cTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGAc < 1:2219286/150‑1 (MQ=255) cTCCGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGCCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGAt < 2:1736437/109‑1 (MQ=255) tCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAgg > 1:2107805/1‑125 (MQ=255) tCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAgg < 2:2107805/125‑1 (MQ=255) tCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGAcc < 1:871388/150‑1 (MQ=255) tCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGAcc < 1:2372495/150‑1 (MQ=255) tCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGAcc < 1:1508491/150‑1 (MQ=255) cacCTTGGGCCGCCCTTAAGCGTCGACTCTGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCATCACGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTGCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCgg < 1:419301/150‑1 (MQ=255) cacCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCgg < 1:464557/150‑1 (MQ=255) acCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCggg > 2:668154/1‑150 (MQ=255) acCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCggg > 1:270210/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTa > 2:2030476/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTa < 1:2030476/150‑1 (MQ=255) ttGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAg > 1:729249/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCCTTCGGCGTCGCTCAGGTCGACCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAggcg < 2:315478/150‑1 (MQ=255) ggCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCaa > 2:500391/1‑150 (MQ=255) ggCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTCGGGATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCaa > 2:1012846/1‑150 (MQ=255) gCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCaaa < 1:668154/150‑1 (MQ=255) ccTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAg < 1:2208272/150‑1 (MQ=255) cTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCGGGGTAGGCGGCAAAgg > 2:1434146/1‑150 (MQ=255) ttCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGNTCGAGCNTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGt < 1:1440295/150‑1 (MQ=255) ttCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGt < 2:549302/150‑1 (MQ=255) cGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGc < 2:270210/150‑1 (MQ=255) cGATCAGGTCGGCCTTGTACAGCACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGCTCCTGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCCACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCgg < 1:520822/150‑1 (MQ=255) tCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAggc > 2:475492/1‑130 (MQ=255) tCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAggc < 1:475492/130‑1 (MQ=255) tCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCa < 2:1820090/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGc > 2:209386/1‑150 (MQ=255) ggCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCgg < 1:2181713/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCgg < 1:209386/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGATAGGGTCGAGCTTGCGCGCCAGATCTACGTTGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCgg < 1:1253545/150‑1 (MQ=255) cTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCt > 1:1442817/1‑150 (MQ=255) ttCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTgg > 1:1196597/1‑93 (MQ=255) ttCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTgg < 2:1196597/93‑1 (MQ=255) ttCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCg > 1:1558170/1‑150 (MQ=255) tCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGAc > 2:899892/1‑100 (MQ=255) tCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGAc < 1:899892/100‑1 (MQ=255) cAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGAc < 1:1227481/150‑1 (MQ=255) aaCACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGAcc > 2:330963/1‑150 (MQ=255) acacCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCa < 1:330963/150‑1 (MQ=255) accaccGTGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGGCCACg > 2:1300220/1‑150 (MQ=255) accaccAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGAATCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACg > 2:823508/1‑150 (MQ=255) ccaccaGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACgg < 1:845260/150‑1 (MQ=255) caccaGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATTGACACAGTCCCGGAAGTCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACGGt > 2:1873384/1‑150 (MQ=255) tCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACGGTAATGAcc > 1:1837774/1‑150 (MQ=255) tCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACGGTAATGAcc < 2:915067/150‑1 (MQ=255) ttcgcTGACCAGCTGGCCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTc > 2:1926058/3‑132 (MQ=255) ttcgcTGACCAGCTGGCCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTc < 1:1926058/130‑1 (MQ=255) gCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACGGTAATGAcc < 1:822262/141‑1 (MQ=255) gCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACGGTAATGAcc > 2:822262/1‑141 (MQ=255) gCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACGGTAATGACCGCATCGACg < 2:1155517/150‑1 (MQ=255) | GCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACGGTAATGACCGCATCGACG > NC_002947/3981064‑3981359 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |