| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,982,021 | A→T | 7.2% | noncoding (28/207 nt) | PP_mr43 ← | Cobalamin regulatory region |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,982,021 | 0 | A | T | 7.2% | 250.1 / 8.7 | 83 | noncoding (28/207 nt) | PP_mr43 | Cobalamin regulatory region |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (44/33); new base T (2/4); total (46/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.86e-01 | |||||||||||
CTGGCTTGCACCGTTCCATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCATGCCCCTCGCCCCCG > NC_002947/3981873‑3982167 | cTGGCTTGCACCGTTCCATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCAGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAg > 2:2141656/1‑150 (MQ=255) tGGCTTGCACCGTTCCATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAgg > 1:1437773/1‑150 (MQ=255) gCTTGCACCGTTCCATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGcc > 2:423601/1‑150 (MQ=255) ttGCACCGTTCCATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCga > 2:1812219/1‑150 (MQ=255) gCACCGTTCCATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCTGGCCgaag < 2:2083981/150‑1 (MQ=255) gCACCGTTCCATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCTGGCCgaag < 1:1015511/150‑1 (MQ=255) gCACCGTTCCATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCgaag > 2:1057907/1‑150 (MQ=255) aCCGTTCCATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCgaagaa > 1:555333/1‑150 (MQ=255) cGTTCCATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCTGGCCgaagctaa < 2:370195/150‑5 (MQ=255) ttCCATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTc > 2:1064919/1‑150 (MQ=255) tCCATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCg < 2:2348025/150‑1 (MQ=255) cATGTCCTCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGCACCGCTTCCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGaa < 2:1668043/150‑1 (MQ=255) cATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGaa < 1:1056565/150‑1 (MQ=255) aTGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTTTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAg > 2:823092/1‑150 (MQ=255) tCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTgg > 1:870716/1‑150 (MQ=255) tCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTgg < 1:131111/150‑1 (MQ=255) ccccGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGc > 1:1728738/1‑150 (MQ=255) cccGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGCAGTGGCa > 1:1119063/1‑150 (MQ=255) gCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGtg < 2:768076/150‑1 (MQ=255) cGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCggg > 2:1400216/1‑150 (MQ=255) gCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCaa > 2:416597/1‑128 (MQ=255) gCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCaa < 1:416597/128‑1 (MQ=255) gCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGggt > 1:381547/1‑150 (MQ=255) ccTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGggtg < 2:919661/150‑1 (MQ=255) ccTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGggtg < 2:381547/150‑1 (MQ=255) cTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCACGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGggtgg > 2:805506/1‑150 (MQ=255) tCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTc < 1:1064919/150‑1 (MQ=255) ccGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCaa > 1:1573018/1‑150 (MQ=255) ccGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCaa > 1:1092930/1‑150 (MQ=255) ccGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCaa > 1:2250785/1‑150 (MQ=255) cgcgcgTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAAc < 1:311074/150‑1 (MQ=255) cgTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCAtt < 1:1997016/150‑1 (MQ=255) gcgcAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGtggctgg > 1:2284038/1‑129 (MQ=255) gcgcAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGtggctgg < 2:2284038/129‑1 (MQ=255) gcAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCgg < 1:423601/150‑1 (MQ=255) gcAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCgg > 2:1326653/1‑150 (MQ=255) cAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCTGGCCgaagc < 1:1701536/94‑2 (MQ=255) cAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCTGGCCgaagc > 2:1701536/1‑93 (MQ=255) aGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCgggg > 1:454201/1‑150 (MQ=255) gCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCgg > 1:1793520/1‑150 (MQ=255) cTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGt < 1:974162/114‑1 (MQ=255) cTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGt > 2:974162/1‑114 (MQ=255) tgtCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGa < 2:1437773/150‑1 (MQ=255) tgtCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGa < 2:1573018/150‑1 (MQ=255) gATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAAc > 2:2257199/1‑83 (MQ=255) gATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAAc < 1:2257199/83‑1 (MQ=255) gATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAAc > 1:7006/1‑150 (MQ=255) tacGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGTCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGCAGCTGCGAAACAACGCAGAACCGTCCGAGGGGCCAACCATTGCGTCGGGGCCGGTCTACAACGc > 2:2330200/3‑150 (MQ=255) cGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTg < 2:2250785/150‑1 (MQ=255) gTTGTCGGTGCTTCCACATGCAGTTGCGGCCGCGGCTTGTAGCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTgg > 2:594039/1‑150 (MQ=255) ttGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGggtg > 2:1857252/1‑113 (MQ=255) ttGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGggtg < 1:1857252/113‑1 (MQ=255) ggTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCaa > 1:1765626/1‑150 (MQ=255) gTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAg > 1:680508/1‑150 (MQ=255) tACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGt < 2:680508/150‑1 (MQ=255) gTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACa < 1:1400216/150‑1 (MQ=255) gTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACa < 2:1350487/150‑1 (MQ=255) gggggCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGt < 2:409408/147‑1 (MQ=255) gggggCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGt > 1:409408/1‑147 (MQ=255) cgGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCAc < 1:1057907/150‑1 (MQ=255) cgGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCAc < 2:1092930/150‑1 (MQ=255) cTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTGTCCACGGt > 1:833367/1‑150 (MQ=255) tACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAg > 2:1248266/1‑150 (MQ=255) aCCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAgg > 2:458305/1‑150 (MQ=255) ccGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCgg > 2:1641040/1‑90 (MQ=255) ccGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCaa > 1:1348998/1‑147 (MQ=255) ccGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCaa < 2:1348998/147‑1 (MQ=255) ccGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAAACTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCgg < 1:1641040/90‑1 (MQ=255) cgcgTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGAc > 1:843387/1‑150 (MQ=255) cgcgTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGAc < 1:823092/150‑1 (MQ=255) cgTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGc < 1:2330200/150‑1 (MQ=255) gTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCAAGAAGTGGGCGGGCTACGCGGTCTCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGAGCACGAGCGTTACAGTGGCGCTTTATCTACTGTCAAggtctca < 2:1728738/150‑6 (MQ=255) ccGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCAt > 1:2179395/1‑150 (MQ=255) ccGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCAt > 1:527743/1‑150 (MQ=255) cGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACACTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCATg > 1:2109586/1‑150 (MQ=255) ttAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCATGcccc < 2:1765626/150‑1 (MQ=255) ttcTTCGGCCTGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCATGCCCCTc > 2:2029746/3‑150 (MQ=255) aGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCATGCCCCTc > 1:429354/1‑150 (MQ=255) aGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCATGCCCCTc < 2:843387/150‑1 (MQ=255) cTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCATGCCCCTCGc > 1:1276847/1‑150 (MQ=255) ggCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAATGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCATGCCCCTCGccccc < 1:1812219/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCATGCCCCTCGCCCCCg > 1:395950/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCATGCCCCTCGCCCCCg > 1:937792/1‑150 (MQ=255) | CTGGCTTGCACCGTTCCATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCATGCCCCTCGCCCCCG > NC_002947/3981873‑3982167 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |