Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,989,552 | C→G | 5.1% | P676A (CCC→GCC) | oplA → | 5‑oxoprolinase A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,989,552 | 0 | C | G | 5.1% | 260.4 / 3.6 | 79 | P676A (CCC→GCC) | oplA | 5‑oxoprolinase A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/40); new base G (2/2); total (37/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 |
CCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCGGGCGGTTCGTACAATAACAAGAGCTGC > NC_002947/3989403‑3989699 | ccACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCAc > 2:1482929/1‑150 (MQ=255) cACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCAcc > 1:2265993/1‑150 (MQ=255) ccGCGCACTCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACGCCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCg < 2:1810884/150‑1 (MQ=255) aaTCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGc < 1:1482929/150‑1 (MQ=255) ccgtccgCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAgg < 2:246377/150‑1 (MQ=255) cgtccgCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCAGCCGGGTGGCAgga < 1:2040807/150‑2 (MQ=255) ccGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTg < 2:1246882/150‑1 (MQ=255) tGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGc > 2:36879/1‑150 (MQ=255) tGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCtt > 1:870059/1‑150 (MQ=255) ttCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCg < 1:591844/150‑1 (MQ=255) aGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGcc > 1:2176373/1‑150 (MQ=255) gACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTAc < 1:970221/150‑1 (MQ=255) gACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTAc < 2:1133231/150‑1 (MQ=255) ggTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCgg > 1:2072419/1‑150 (MQ=255) tGAATGGAAGCAAACACAGGAGTTCAACGGCAACCACCTGTTGGCTGAGCAGACGGTGCATGGCCCCGGGGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGt > 2:25512/1‑150 (MQ=255) gAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTg > 1:1512772/1‑150 (MQ=255) tGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGaca > 2:1443787/1‑150 (MQ=255) ccACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAAAATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCgggg < 2:1384614/150‑1 (MQ=255) cacaCCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGa > 1:1455767/1‑140 (MQ=255) cacaCCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGa < 2:1455767/140‑1 (MQ=255) cacaCCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCggggg < 1:829875/150‑1 (MQ=255) acacCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGt > 2:1867339/1‑150 (MQ=255) cacCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGtt < 2:2176373/150‑1 (MQ=255) acCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTg > 1:2123801/1‑150 (MQ=255) gtgtTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGa > 1:546894/1‑133 (MQ=255) gtgtTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGa < 2:546894/133‑1 (MQ=255) gtTCAACGGCAACCACCTGCTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCTCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTg < 2:1587529/150‑1 (MQ=255) ttCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGc < 2:870059/150‑1 (MQ=255) tCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCg < 2:2194649/150‑1 (MQ=255) aCGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCACGCTCCCCTTGAGCCTTAGGCCACCTACTGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTc > 2:572179/1‑150 (MQ=255) ggCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCgg > 2:2241184/1‑150 (MQ=255) caccTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGgcgcgcg > 2:133574/1‑150 (MQ=255) ttGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATc > 1:2313445/1‑150 (MQ=255) ttGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATc > 2:2120169/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATg < 1:239723/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATg < 1:1867339/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATg < 1:1443787/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGAGCATg > 2:239723/1‑150 (MQ=255) cTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCAGCCGGGTGGCAgga < 2:1930744/76‑2 (MQ=39) cTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCAGCCGGGTGGCAgga > 1:1930744/1‑75 (MQ=255) cTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATg < 1:26592/149‑1 (MQ=255) cTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATg > 2:26592/1‑149 (MQ=255) tGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATggg > 1:1846365/1‑150 (MQ=255) tGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATggg > 2:1441826/1‑150 (MQ=255) gCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCt < 1:1441826/150‑1 (MQ=255) aCCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATa > 1:267419/1‑150 (MQ=255) ccGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGt > 1:916264/1‑110 (MQ=255) ccGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGt < 2:916264/110‑1 (MQ=255) ccGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATaa < 2:2265993/150‑1 (MQ=255) ccGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATaa < 1:2241184/150‑1 (MQ=255) cGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAAc < 2:1846365/150‑1 (MQ=255) cccTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCg > 1:1164384/1‑146 (MQ=255) cccTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCg < 2:1164384/146‑1 (MQ=255) cccTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAg > 2:1589669/1‑150 (MQ=255) cccTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAg > 2:603920/1‑150 (MQ=255) gtgtgATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGtttt < 2:2123801/150‑1 (MQ=255) gtgATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTgc < 1:36879/150‑1 (MQ=255) gtgATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTgc < 1:1589669/150‑1 (MQ=255) gATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATg < 1:2006889/121‑1 (MQ=255) gATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATg > 2:2006889/1‑121 (MQ=255) aTCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCt < 1:2120169/150‑1 (MQ=255) tCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTg > 1:1428023/1‑150 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accaATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGATCCCCTGGAGAACCAGGCCACCTACCGGGTGACAGGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCGGGCGGTTCGTa > 2:883168/1‑150 (MQ=255) ccaATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATg < 2:2023770/104‑1 (MQ=255) ccaATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATg > 1:2023770/1‑104 (MQ=255) tatTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCGGGCGGTTCGTACAATa > 1:400154/1‑150 (MQ=255) tCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGAt < 2:1752690/91‑1 (MQ=255) tCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGAt > 1:1752690/1‑91 (MQ=255) tCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCGGGCGGTTCGTACAATAACAag < 2:2110797/150‑1 (MQ=255) cTGCCAGCCGGGTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCGGGCGGTTCGTACAATAACAagag > 2:1187448/1‑150 (MQ=255) gCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCACGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCGGGCGGTTCGTACAATAACAAGAgct < 2:543788/150‑1 (MQ=255) cACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCGGGCGGTTCGTACAATAACAagag > 1:991633/1‑146 (MQ=255) cACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCGGGCGGTTCGTACAATAACAagag < 2:991633/146‑1 (MQ=255) cACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCGGGCGGTTCGTACAATAACAAGAgctgc < 1:133574/150‑1 (MQ=255) | CCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCGGGCGGTTCGTACAATAACAAGAGCTGC > NC_002947/3989403‑3989699 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |