| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,000,179 | C→T | 6.9% | Q274* (CAG→TAG) ‡ | PP_3528 → | ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,000,179 | 0 | C | T | 6.9% | 340.5 / 9.2 | 116 | Q274* (CAG→TAG) ‡ | PP_3528 | ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (55/52); new base T (4/4); total (59/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
CTTCTACCTGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGAAGCGGTCT > NC_002947/4000031‑4000323 | cTTCTACCTGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCa > 2:22194/1‑150 (MQ=255) ttCTACCTGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAg > 1:1196368/1‑150 (MQ=255) cTACCTGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGt < 2:1952643/150‑1 (MQ=255) aCCTGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCCGTGGGCAAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGc > 2:685326/1‑150 (MQ=255) aCCTGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTACCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGc > 2:1177003/1‑150 (MQ=255) cTGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTg < 2:1506753/150‑1 (MQ=255) gTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCTGGGTGCTgat < 2:473902/150‑3 (MQ=255) gTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGa > 2:654248/1‑150 (MQ=255) tCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCt > 1:771952/1‑146 (MQ=255) tCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCt < 2:771952/146‑1 (MQ=255) cacaGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGt < 2:1171830/150‑1 (MQ=255) acaGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAg > 1:2315491/1‑138 (MQ=255) acaGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAg < 2:2315491/138‑1 (MQ=255) cagccagcTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGGGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTgg < 1:654248/150‑1 (MQ=255) gccagcTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGc > 2:1603071/1‑139 (MQ=255) gccagcTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGc < 1:1603071/139‑1 (MQ=255) ccagcTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCGCCCAGGTGCTGGAAGTGGc > 2:1237942/1‑148 (MQ=255) ccagcTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGc < 1:1237942/148‑1 (MQ=255) gCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACgg < 2:2288917/150‑1 (MQ=255) ccGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGgc > 1:480913/1‑150 (MQ=255) gACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTgg < 1:2186595/130‑1 (MQ=255) cAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAAc > 2:1763699/1‑150 (MQ=255) cAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAAc < 2:862245/150‑1 (MQ=255) cGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAAc < 2:105767/150‑1 (MQ=255) ctctGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCg > 2:2130200/1‑150 (MQ=255) tgctgAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCg > 2:151507/1‑150 (MQ=255) tgctgAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCg < 2:661094/150‑1 (MQ=255) tgctgAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCg < 1:558842/150‑1 (MQ=255) gAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTAt > 2:1941969/1‑150 (MQ=255) aaaaCCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCTGGGTGCTgat > 1:1753328/1‑108 (MQ=255) aaaCCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCTGGGTGCTga < 1:1976003/108‑2 (MQ=255) aaaCCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCa > 2:1838975/1‑150 (MQ=255) aaCCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCt < 2:144026/105‑1 (MQ=255) cttcttTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCAcccc > 1:482049/1‑150 (MQ=255) cttcttTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCAcccc > 2:232969/1‑150 (MQ=255) ttcttTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCg > 1:2366997/1‑150 (MQ=255) ttcttTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCg > 1:573689/1‑150 (MQ=255) tttGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTg < 1:591755/105‑1 (MQ=255) cGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTg < 2:507341/100‑1 (MQ=255) cGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCa < 1:2123711/104‑1 (MQ=255) cGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCa > 2:2123711/1‑104 (MQ=255) gCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCTTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGc < 1:2130200/150‑1 (MQ=255) ggCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGaa > 2:1990122/1‑150 (MQ=255) ggCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGaa > 2:514906/1‑150 (MQ=255) ggCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCCGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGaa < 1:2106117/150‑1 (MQ=255) gCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGaac > 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gCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAgc > 2:1098709/1‑150 (MQ=255) aGTGGCCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGCGGCCGCGCTGCTTGCACCGCAGCTGGGGATCCGCCCCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCCAACGCCGCAACTACAACGCGGTCGCTATCCCCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAgctgg < 2:1124800/150‑1 (MQ=255) gTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAgctggc < 2:482049/150‑1 (MQ=255) gTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAgctggc < 1:352981/150‑1 (MQ=255) ggCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGa < 2:1196368/150‑1 (MQ=255) 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tgGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGa > 1:732527/1‑138 (MQ=255) ccGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAg < 1:479161/150‑1 (MQ=255) gCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGt > 2:1879349/1‑150 (MQ=255) cAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTg < 1:984888/150‑1 (MQ=255) gCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCCGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGAGCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGc < 1:579951/150‑1 (MQ=255) cacttccAGCACCTGGGTGCTAGAAGTAGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAAGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGa > 2:1727034/7‑150 (MQ=255) gggATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATc > 1:853784/1‑75 (MQ=255) gggATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATc < 2:853784/75‑1 (MQ=255) gggATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGaa < 2:956572/150‑1 (MQ=255) ttccAGCACCTGGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTAc < 2:1532125/134‑1 (MQ=255) ttccAGCACCTGGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTAc > 1:1532125/4‑137 (MQ=255) gATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGAAGc < 2:2366997/150‑1 (MQ=255) aTCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGAAGCg < 1:2196184/150‑1 (MQ=255) tCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGAAGCgg < 1:1941969/150‑1 (MQ=255) gCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAgctgg > 1:612830/1‑90 (MQ=255) gCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAgctgg < 2:612830/90‑1 (MQ=255) ccAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAgggcctgg < 2:1422956/107‑1 (MQ=255) ccAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAgggcctgg > 1:1422956/1‑107 (MQ=255) | CTTCTACCTGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGAAGCGGTCT > NC_002947/4000031‑4000323 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |