| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,000,180 | A→G | 6.8% | Q274R (CAG→CGG) ‡ | PP_3528 → | ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,000,180 | 0 | A | G | 6.8% | 344.5 / 10.9 | 117 | Q274R (CAG→CGG) ‡ | PP_3528 | ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (55/54); new base G (4/4); total (59/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.77e-01 | |||||||||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
CTTCTACCTGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGAAGCGGTCTACCCGG > NC_002947/4000031‑4000329 | ttCTACCTGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAg > 1:1196368/1‑150 (MQ=255) cTACCTGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGt < 2:1952643/150‑1 (MQ=255) agcTGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCATGCCGAAGTGGCAGCGGTGGTGGCAACGCAGCTGGGGATAAGCAGACAGGTgg > 2:1169052/3‑149 (MQ=255) aCCTGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCCGTGGGCAAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGc > 2:685326/1‑150 (MQ=255) cTGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTg < 2:1506753/150‑1 (MQ=255) gTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGa > 2:654248/1‑150 (MQ=255) tCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCt > 1:771952/1‑146 (MQ=255) tCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCt < 2:771952/146‑1 (MQ=255) cacaGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGt < 2:1171830/150‑1 (MQ=255) acaGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAg < 2:2315491/138‑1 (MQ=255) acaGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAg > 1:2315491/1‑138 (MQ=255) cagccagcTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGGGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTgg < 1:654248/150‑1 (MQ=255) gccagcTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGc < 1:1603071/139‑1 (MQ=255) gccagcTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGc > 2:1603071/1‑139 (MQ=255) ccagcTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCGCCCAGGTGCTGGAAGTGGc > 2:1237942/1‑148 (MQ=255) ccagcTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGc < 1:1237942/148‑1 (MQ=255) gCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACgg < 2:2288917/150‑1 (MQ=255) ccGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGgc > 1:480913/1‑150 (MQ=255) gACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTgg > 2:2186595/1‑130 (MQ=255) gACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTgg < 1:2186595/130‑1 (MQ=255) cAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAAc > 2:1763699/1‑150 (MQ=255) cAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAAc < 2:862245/150‑1 (MQ=255) ctctGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCg > 2:2130200/1‑150 (MQ=255) tgctgAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCg < 2:661094/150‑1 (MQ=255) tgctgAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCg > 2:151507/1‑150 (MQ=255) tgctgAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCg < 1:558842/150‑1 (MQ=255) gAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTAt > 2:1941969/1‑150 (MQ=255) aaaaCCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCTGGGTGCTgat > 1:1753328/1‑108 (MQ=255) aaaaCCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCTGGGTGCTgat < 2:1753328/110‑3 (MQ=255) aaaCCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCTGGGTGCTga > 2:1976003/1‑107 (MQ=255) aaaCCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCTGGGTGCTga < 1:1976003/108‑2 (MQ=255) aaaCCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCa > 2:1838975/1‑150 (MQ=255) aaCCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCt > 1:144026/1‑105 (MQ=255) cttcttTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCAcccc > 1:482049/1‑150 (MQ=255) cttcttTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCAcccc > 2:232969/1‑150 (MQ=255) ttcttTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCg > 1:2366997/1‑150 (MQ=255) ttcttTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCg > 1:573689/1‑150 (MQ=255) ttcttTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGAGCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCg > 1:956572/1‑150 (MQ=255) tttGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTg < 1:591755/105‑1 (MQ=255) tttGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTg > 2:591755/1‑105 (MQ=255) cGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTg < 2:507341/100‑1 (MQ=255) cGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTg > 1:507341/1‑100 (MQ=255) cGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCa > 2:2123711/1‑104 (MQ=255) gCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCTTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGc < 1:2130200/150‑1 (MQ=255) ggCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGaa > 2:514906/1‑150 (MQ=255) ggCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCCGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGaa < 1:2106117/150‑1 (MQ=255) gCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGaac > 2:1041622/1‑150 (MQ=255) ggTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGCCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGAGCAACTAATGCGCCGTCACTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAacaaca > 1:634446/1‑150 (MQ=255) 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ccAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGaca < 1:1838975/150‑1 (MQ=255) ccAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGaca > 1:2031546/1‑150 (MQ=255) cAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTAc > 1:1752036/1‑94 (MQ=255) cAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTAc < 2:1752036/94‑1 (MQ=255) gCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCGAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGt < 2:1747108/98‑1 (MQ=255) gCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGt > 1:1747108/1‑98 (MQ=255) gCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTAGCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGGTGACACCTTc > 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cacttccAGCACCTGGGTGCTAGAAGTAGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAAGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGa > 2:1727034/7‑150 (MQ=255) gggATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATc < 2:853784/75‑1 (MQ=255) gggATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATc > 1:853784/1‑75 (MQ=255) gggATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGaa < 2:956572/150‑1 (MQ=255) ttccAGCACCTGGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTAc > 1:1532125/4‑137 (MQ=255) ttccAGCACCTGGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTAc < 2:1532125/134‑1 (MQ=255) gATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGAAGc < 2:2366997/150‑1 (MQ=255) aTCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGAAGCg < 1:2196184/150‑1 (MQ=255) gCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAgctgg > 1:612830/1‑90 (MQ=255) gCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGAAGCGGTCt > 1:2173429/1‑150 (MQ=255) ccAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAgggcctgg < 2:1422956/107‑1 (MQ=255) aGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGAAGCGGTCTACCCgg > 1:119698/1‑150 (MQ=255) | CTTCTACCTGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGAAGCGGTCTACCCGG > NC_002947/4000031‑4000329 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |