| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,005,361 | T→A | 8.2% | R242W (AGG→TGG) | PP_3534 ← | LysR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,005,361 | 0 | T | A | 8.2% | 450.1 / 22.9 | 144 | R242W (AGG→TGG) | PP_3534 | LysR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (73/59); new base A (6/6); total (79/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.58e-01 | |||||||||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
CGCCCGCCAGCAACTGCGTCATCACCTCAGCCAGCGCCTTGACCATCACATCCGCCGTCGGCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCGGCCCATGCCTTCGATGGCGTTGATCATGTCCTCGCGGTACAGGCCGCGTGGCGGAAAG > NC_002947/4005214‑4005509 | cccgccAGCAACTGCGTCATCACCTCAGCCAGCGCCTTGACCATCACATCCGCCGTCGGCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGTCGCCCTGggc < 2:176917/150‑1 (MQ=255) ccAGCAACTGCGTCATCACCTCAGCCAGCGCCTTGACCATCACATCCGCCGTCGGCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCAGggcggcc < 2:29235/150‑2 (MQ=255) aGCAACTGCGTCATCACCTCAGCCAGCGCCTTGACCATCACATCCGCCGTCGGCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGgcagc < 2:790281/150‑1 (MQ=255) cAACTGCGTCATCACCTCAGCCAGCGCCTTGACCATCACATCCGCCGTCGGCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCAGggcggccaccg < 2:198865/150‑6 (MQ=255) aaCTGCGTCATCACCTCAGCCAGCGCCTTGACCATCACATACGCCGAACGCCAAAGCACGATAACAATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCGCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAg > 2:275230/1‑150 (MQ=255) tGCGTCATCACCTCAGCCAGCGCCTTGACCATCACATCCGCCGTCGGCCGGTGCACGGTGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTg > 1:2101869/1‑150 (MQ=255) tcatcaCCTCAGCCAGCGCCTTGACCATCACATCCGCCGTCGGCCGTTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATAc < 1:883156/150‑1 (MQ=255) ccTCAGCCAGCGCCTTGACCATCACATCCGCCGTCGGCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGc > 1:1700955/1‑150 (MQ=255) ccTCAGCCAGCGCCTTGACCATCACATCCGCCGTCGGCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGc > 2:1852900/1‑150 (MQ=255) cTCAGCCAGCGCCTTGACCATCACATCCGCCGTCGGCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGgca < 1:927521/131‑1 (MQ=255) cTCAGCCAGCGCCTTGACCATCACATCCGCCGTCGGCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGcc < 2:816392/150‑1 (MQ=255) cTCAGCCAGCGCCTTGACCATCACATCCGCCGTCGGCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGcc > 1:1452423/1‑150 (MQ=255) cTCAGCCAGCGCCTTGACCATCACATCCGCCGTCGGCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCAGggcg > 2:1767367/1‑128 (MQ=255) ctccagcGCCTTGACCACCATATCCGCCGTCGGCCGGTGCAGTATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGNTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATc < 1:1120739/148‑1 (MQ=255) cagcGCCTTGACCATCACATCCGCCGTCGGCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCAt > 2:1465896/1‑141 (MQ=255) gcCTTGACCATCACATCCGCCGTCGGCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGAcc > 2:142312/1‑150 (MQ=255) ttGACCATCACATCCGCCGTCGGCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCa < 2:1074571/150‑1 (MQ=255) ttGACCATCACATCCGCCGTCGGCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCa > 1:344223/1‑150 (MQ=255) tGACCATCACATCCCGCGTCGGCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACCCCCTGTGCTCGCCCGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAg < 2:773242/150‑1 (MQ=255) aTCACATCCGCCGTCGGCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCg < 1:461574/135‑1 (MQ=255) acaTCCGCCGTCGGCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATg > 2:1448679/1‑150 (MQ=255) ggCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGa > 2:2215160/1‑136 (MQ=255) gCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTag > 2:706960/1‑150 (MQ=255) ggTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCGCCGTTTCGGTGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGc < 1:1852900/150‑1 (MQ=255) gTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCt < 1:58202/150‑1 (MQ=255) gTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCt < 1:457374/150‑1 (MQ=255) tGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTg < 1:706960/150‑1 (MQ=255) cACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTg < 2:1581869/148‑1 (MQ=255) aCGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTa > 2:504593/1‑150 (MQ=255) aCGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTa > 2:504733/1‑150 (MQ=255) aCGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTAGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTa > 2:1180750/1‑150 (MQ=255) cGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTaa > 2:1988743/1‑150 (MQ=255) aTGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAg < 1:504733/150‑1 (MQ=255) cGATCTCATAGATCTCCCCCTCCTTCATCCCTTTCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGa < 2:520039/150‑1 (MQ=255) gATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCt > 1:585100/1‑87 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tcATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATgcgc > 1:703724/1‑150 (MQ=255) cATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGcc > 2:811809/1‑150 (MQ=255) aTAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCGCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCa > 2:369806/1‑150 (MQ=255) tGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGcc < 2:1964997/150‑1 (MQ=255) tCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCgg < 1:1180750/150‑1 (MQ=255) cTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCGGCCCAt > 2:921769/1‑150 (MQ=255) cTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCGGCCCAt > 2:851785/1‑150 (MQ=255) cTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCGGCCCAt > 1:2360729/1‑150 (MQ=255) tCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCGGCCCATg < 2:1427339/150‑1 (MQ=255) ggCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCGGCCCATGCCt > 2:29997/1‑150 (MQ=255) 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ccTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCg < 1:920795/114‑1 (MQ=255) ccTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCGGCCCATGCCTTCGATGGCGTTGATCATGTCCTcgcg > 2:169785/1‑150 (MQ=255) ccTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCGGCCCATGCCTTCGATGGCGTTGATCATGTCCTcgcg < 1:1988743/150‑1 (MQ=255) ccTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCGGCCCATGCCTTCGATGGCGTTGATCATGTCCTcgcg > 1:922468/1‑150 (MQ=255) ccTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGAAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCGGCCCATGCCTTCGATGGCGTTGATCAt < 1:1073732/141‑1 (MQ=255) cTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCGGCCCATGCCTTCGATGGCGTTGATCATGTCCTCGCgg < 1:275230/150‑1 (MQ=255) cTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCGGGTAAAGCTGCTGCGCCAGCGCCAGCCCATGCCTTCGATAGCGTTGATCATGTCCTCGCgg > 2:319388/1‑150 (MQ=255) tgCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCGGCCCATGCCTTCGATGGCGTTGATCATGTCCTCGCGGTAc > 2:1366739/1‑150 (MQ=255) tCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCGGCCCATGCCTTCGATGGCGTTGATCATGTCCTCGCGGTACAgg > 2:1310483/1‑150 (MQ=255) tCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCGGCCCATGCCTTCGATGGCGTTGATCATGTCCTCGCGGTACAgg > 2:2152481/1‑150 (MQ=255) ggTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTaaa > 2:1247199/1‑84 (MQ=255) ggTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCGGCCCATGCCTTCGATGGCGTTGATCATGTCCTCGCGGTACAGGCcgcg < 1:2247991/150‑1 (MQ=255) gTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCGGCCCATGCCTTCGATGGCGTTGATCATGTCCTCGCGGTACAGGCCGCGt < 1:142312/150‑1 (MQ=255) ctgccgccCAGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTgg > 1:1215580/3‑78 (MQ=255) tgccgccCAGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCGGCCCATGCCTTCGATGGCGTTGATCATGTCCTCGCGGTACAGGCCGCGTgg > 2:1563800/2‑150 (MQ=255) ggCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCGGCCCATGCCTTCGATGGCGTTGATCATGTCCTCGCGGTACAGGCCGCGTgg < 1:851785/150‑1 (MQ=255) gccgccCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCGGCCCATGCCTTCGATGGCGTTGATCATGTCCTCGCGGTACAGGCCGCGTGGc < 1:1366739/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCACACTGGATAATA‑TGACGACAACATCTTAGATAGCGGATGCGCCAGCGCCGGCCCATGCCTTCGATGGCGTTGATCATGTCCTCGCGGTACAGGCCGCGTGGCGGAAAg < 1:1488696/150‑1 (MQ=255) | CGCCCGCCAGCAACTGCGTCATCACCTCAGCCAGCGCCTTGACCATCACATCCGCCGTCGGCCGGTGCACGATGACGATCTCATAGCTGTCGACCTCCGGCAGCCCTTGCCCGGCCCCCAACACCCTGTGCTCGCCGGTGGCCGCCCTGGGCGGCAGCAAGCTGATACCCATGCCATCGGCGACCGCAGCCTGGATGCCACTGA‑GGCTAGAGCTGGTAAAGCTGATGCGCCAGCGCCGGCCCATGCCTTCGATGGCGTTGATCATGTCCTCGCGGTACAGGCCGCGTGGCGGAAAG > NC_002947/4005214‑4005509 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |