Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,021,409 | C→G | 8.0% | *314S (TGA→TCA) | PP_3547 ← | NAD(P)‑binding oxidoreductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,021,409 | 0 | C | G | 8.0% | 382.8 / 17.4 | 123 | *314S (TGA→TCA) | PP_3547 | NAD(P)‑binding oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (50/62); new base G (4/6); total (55/68) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
AAGGTGCTGTTGATCACCGGCTACGATGAGAGTGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCGGCCCATGGGCAAGCCAGGTTCGAGCTTGCTGACGCGGTCCGGGTC > NC_002947/4021263‑4021557 | aaGGTGCTGTTGATCACCGGCTACGATGAGAGTGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAgc > 2:1250438/1‑150 (MQ=255) gTGCTGTTGATCACCGGCTACGATGAGAGTGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGcgcc > 1:280919/1‑150 (MQ=255) tGCTGTTGATCACCGGCTACGATGAGAGTGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTGAGcgccc < 2:904827/150‑1 (MQ=255) tGTTGATCACCGGCTACGATGAGAGTGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGcgcccgcc > 2:1885308/1‑150 (MQ=255) ttGATCACCGGCTACGATGAGAGGGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGGAAGGTACGTTGGTGTTGAACAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGATGCTGGGAGCTTGACGGGGGCGTAGCGCcagccgt > 2:10185/1‑149 (MQ=255) tGATCACCGGCTACGATGAGAGTGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTGAGcgcccgtcaag < 1:538158/150‑6 (MQ=255) tGATCACCGGCTACGATGAGAGTGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCgccgcc < 2:280919/150‑1 (MQ=255) tGATCACCGGCTACGATGAGAGTGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCgccgcc < 2:1604672/150‑1 (MQ=255) tCACCGGCTACGATGAGAGTGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAg > 2:224366/1‑150 (MQ=255) gCTACGATGAGAGTGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGAt > 2:1685921/1‑150 (MQ=255) tACGATGAGAGTGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGa > 1:1117746/1‑150 (MQ=255) tACGATGAGAGTGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGa > 1:601036/1‑150 (MQ=255) tACGATGAGAGTGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGAGTCGAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGa < 1:1330872/150‑1 (MQ=255) cGATGAGAGTGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAgg < 1:1518210/150‑1 (MQ=255) gATGAGAGTGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTGAGcgcccgtcaagg > 1:1568221/1‑131 (MQ=255) gATGAGAGTGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTGAGcgcccgtcaagg < 2:1568221/137‑7 (MQ=255) gATGAGAGTGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGc > 2:1465478/1‑150 (MQ=255) agagTGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGcc < 1:168634/150‑1 (MQ=255) gagTGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCg > 1:1647065/1‑150 (MQ=255) gagTGCGGCGGTCAGCGACGGCCAACCGACGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCg < 2:752015/150‑1 (MQ=255) gTGCGTCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGt > 2:1310128/1‑134 (MQ=255) gTGCGTCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGt < 1:1310128/134‑1 (MQ=255) ttcgccgTTCAGCTACGTCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTg < 2:1117746/145‑1 (MQ=255) tGCGGCGTTCAGCGACCGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTg < 1:931647/150‑1 (MQ=255) gcggcgTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTgg < 2:482246/150‑1 (MQ=255) gcggcgTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTgg < 2:1265433/150‑1 (MQ=255) cgTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATa < 1:1885308/150‑1 (MQ=255) tCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCAGGTGGCATagga < 2:1300637/150‑1 (MQ=255) aaGCGACGGCCAACCTCTGCAATGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATaggag < 2:332248/149‑1 (MQ=255) aCGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCttt < 1:1844814/150‑1 (MQ=255) aCGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCttt < 2:1324047/150‑1 (MQ=255) gCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTc < 1:10185/150‑1 (MQ=255) gCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTc < 1:1431478/150‑1 (MQ=255) cAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAGCCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCCCTGAGGCTGCCGGTGGCATCGGAGGCTTTGTCCg > 2:203590/1‑150 (MQ=255) aCCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCATCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCGTTGTCCGac > 1:846215/1‑149 (MQ=255) aCCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGaa > 1:1858993/1‑150 (MQ=255) ccGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGaaa < 1:1076007/150‑1 (MQ=255) gCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGc > 2:333809/1‑150 (MQ=255) tGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCaa < 2:1858993/150‑1 (MQ=255) aGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCgccgcc > 2:1727848/1‑98 (MQ=255) tACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGcgccc > 2:2304552/1‑89 (MQ=255) tACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGcgccc < 1:2304552/89‑1 (MQ=255) tACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAgg > 1:514461/1‑150 (MQ=255) cGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGAt < 2:601036/150‑1 (MQ=255) tgtTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTc > 1:361691/1‑150 (MQ=255) gtTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAgg > 1:1276830/1‑99 (MQ=255) gtTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCg < 2:1965444/150‑1 (MQ=255) gACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCttt < 2:1457845/119‑1 (MQ=255) gACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCttt > 1:1457845/1‑119 (MQ=255) aCCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGATGGccgtg < 2:1784827/110‑5 (MQ=255) aCCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGATGGccgtg > 1:1784827/1‑106 (MQ=255) cAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACt > 1:1408128/1‑150 (MQ=255) aaGCCGTTTGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACtt > 2:1882668/1‑150 (MQ=255) gCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAgcg < 2:1964892/68‑1 (MQ=255) gCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAgcg > 1:1964892/1‑68 (MQ=255) gCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGc < 2:1124849/123‑1 (MQ=255) gCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGc > 1:1124849/1‑123 (MQ=255) ccGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCt < 2:749675/150‑1 (MQ=255) gTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCg < 2:827791/150‑1 (MQ=255) ttCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCgg > 1:2062327/1‑150 (MQ=255) ttCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCgg > 1:2008348/1‑150 (MQ=255) cGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGa < 1:1938804/150‑1 (MQ=255) aaCTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACg > 2:304565/1‑150 (MQ=255) aCTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGCTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGc < 1:1250438/150‑1 (MQ=255) tGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTc > 2:946098/1‑129 (MQ=255) tGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTc < 1:946098/129‑1 (MQ=255) tGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGccc > 1:165354/1‑150 (MQ=255) gAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAgg > 1:1482942/1‑68 (MQ=255) gCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATg < 1:1199948/119‑1 (MQ=255) gCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATg > 2:1199948/1‑119 (MQ=255) aCTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCgg < 1:960275/136‑1 (MQ=255) aCTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCgg < 2:165354/150‑1 (MQ=255) aCTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGATATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTAGGCCGCAAGCGCGGGACGCCCCCCTCgg > 1:532721/1‑150 (MQ=255) tGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGt < 1:1734995/95‑1 (MQ=255) tGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCGGcc < 2:1226602/150‑1 (MQ=255) agagCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCGGTCCATg < 2:1608885/150‑1 (MQ=255) gagCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCGGCCCATgg > 1:1056413/1‑150 (MQ=255) gagCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCGGCCCATgg < 1:1521609/150‑1 (MQ=255) agCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACt < 2:1789344/121‑1 (MQ=255) agCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACt > 1:1789344/1‑121 (MQ=255) gggTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCGGCCCATGGGCaa < 2:361691/150‑1 (MQ=255) ttCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCGGCCCATGGGCAAGcc < 2:2008348/150‑1 (MQ=255) cgAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCg < 2:1715186/117‑1 (MQ=255) cgAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCg > 1:1715186/1‑117 (MQ=255) gAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCGGCCCATgg < 2:2164965/138‑1 (MQ=255) gAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCGGCCCATgg > 1:2164965/1‑138 (MQ=255) gAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCGGCCCATGGGCAAGCCAGGtt < 2:1408128/150‑1 (MQ=255) ctgctgGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCAACAGCCACTACCTCGGGACGCCCCCCTCGGCCCATGGGCAAGCCAGGTTcta < 1:304565/150‑3 (MQ=255) ctgGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCGGCCCATGGGCAAGc > 2:1572369/1‑138 (MQ=255) tgGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCg < 2:1371267/123‑1 (MQ=255) tgGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCg > 1:1371267/1‑123 (MQ=255) gAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGaaa < 1:267684/75‑1 (MQ=255) cTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCGGCCCATGGGCAAGCCAGGTTCGAGCTTGCTGAc > 2:2360914/1‑150 (MQ=255) tGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGACTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCGGCCCATGGGCAAGCCAGGTTCGAGCTTGCTGAcgc < 1:2186754/150‑1 (MQ=255) ggcGGGCGCTGAGCGCCCGTCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCGGCCCATGGGCAAGCCAGGTTCGAGCTTGCTGAcgc > 1:812190/3‑149 (MQ=255) ggcGGGCGCTGAGCGCCCGTCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCGGCCCATGGGCAAGCCAGGTTCGAGCTTGCTGAcgc > 1:812253/3‑149 (MQ=255) ggcGGGCGCTGAGCGCCCGTCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCGGCCCATGGGCAAGCCAGGTTCGAGCTTGCTGAcgc < 2:812253/147‑1 (MQ=255) cgcTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCGGCCCATGGGCAAGCCAGGTTCGAGCTTGCTGACGCGGTCCgg < 1:1942006/150‑1 (MQ=255) gcTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCGGCCCATGGGCAAGCCAGGTTCGAGCTTGCTGACGCGGTCCggg > 2:1444698/1‑150 (MQ=255) tCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCGGCCCATGGGCAAGCCAGGTTCGAGCTTGCTGACGCGGTCCGGGTc > 2:1288477/1‑150 (MQ=255) | AAGGTGCTGTTGATCACCGGCTACGATGAGAGTGCGGCGTTCAGCGACGGCCAACCGCTGCAAGGTACGTTGGTGTTGACCAAGCCGTTCGAACTGGAAGCACTGGCAGAGCGGGTTCGCGAGCTGCTGGAACCTTGACGGGCGCTCAGCGCCCGCCGCCCAGGTCGATGAGGCTGCCGGTGGCATAGGAGGCTTTGTCCGAAAGCAACCAGAGGATGGCCTCGGCCACTTCCTCGGGACGCCCCCCTCGGCCCATGGGCAAGCCAGGTTCGAGCTTGCTGACGCGGTCCGGGTC > NC_002947/4021263‑4021557 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |