Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,025,169 | C→T | 9.7% | V192M (GTG→ATG) ‡ | emrA ← | multidrug transporter membrane fusion protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,025,169 | 0 | C | T | 9.7% | 195.6 / 10.7 | 73 | V192M (GTG→ATG) ‡ | emrA | multidrug transporter membrane fusion protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/29); new base T (2/5); total (39/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.43e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.21e-01 |
CCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAA > NC_002947/4025024‑4025316 | cccGGCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGgtg < 1:1336388/150‑1 (MQ=255) cccGGCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGgtg > 2:1993467/1‑150 (MQ=255) cGGCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTgtc < 1:1356744/150‑1 (MQ=255) ggCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGATTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGCAACCACGGTgtcg > 1:2175229/1‑150 (MQ=255) cTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCGTGGTgtcctc < 1:605992/150‑1 (MQ=255) cTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGACGACACCGTGGTgtcctc < 2:2274490/150‑1 (MQ=255) cTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTCACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGCTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTgtcgtc < 2:1817711/150‑1 (MQ=255) cTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGAAGTGGAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGACGACACCGTGGTgtcctc < 1:1331467/150‑1 (MQ=255) gCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGa < 2:1986809/150‑1 (MQ=255) aGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGACGCCGTAGCCGGTGACCCGCGCGACTAACGTCGGACGGGCGAGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGGCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTTTCGTTGAcc > 1:973925/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGGACCTACTGGAGGTTACGCGTGGCTACGTAGCCGTTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGGGGTTGGCTTGGCGCTTGTCGGCCGCTGCAGCCATGACAGCGGTGTGCGTGGACTCCACGGTGTCGTAGCCCa < 2:969460/150‑1 (MQ=255) tGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAgcgcg > 1:1190476/1‑150 (MQ=255) cTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGt < 1:2052161/150‑1 (MQ=255) gACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGt < 2:2346320/147‑1 (MQ=255) gACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGt > 1:2346320/1‑147 (MQ=255) gACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGGCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCt < 1:1644803/150‑1 (MQ=255) ggTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCATCGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAg > 2:1391522/1‑150 (MQ=255) cGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGt < 1:523040/150‑1 (MQ=255) gCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGtt > 1:583324/1‑150 (MQ=255) gCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGtt > 1:137045/1‑150 (MQ=255) ggCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCcg < 1:2143351/150‑1 (MQ=255) gCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCcgc < 2:1781521/150‑1 (MQ=255) gACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCcgcgc > 1:1653860/1‑150 (MQ=255) gACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGACGACACCGTGGTgtcctc < 2:1997899/114‑1 (MQ=255) gACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGACGACACCGTGGTgtcctc > 1:1997899/1‑111 (MQ=255) gCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGtt < 2:2251354/150‑1 (MQ=255) ccGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTg > 1:1713226/1‑150 (MQ=255) cGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGa > 1:893807/1‑150 (MQ=255) cGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTACGGGCGAGGTCGAGGTAGGACTGGCGGAGGGCGGCAGCGGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGa > 2:276869/1‑150 (MQ=255) gACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGACGACACCGTGGTgtcctc > 1:2337837/1‑99 (MQ=255) gACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGACGACACCGTGGTgtcctc < 2:2337837/102‑1 (MQ=255) gcgcGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCt > 1:1129290/1‑150 (MQ=255) cgcgACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTg < 1:1993467/150‑1 (MQ=255) cgACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTggg < 2:1190476/150‑1 (MQ=255) aaCGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACg > 2:2359799/1‑150 (MQ=255) aaCGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGAGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACg > 1:483760/1‑150 (MQ=255) gtggtgCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTc > 2:254343/1‑150 (MQ=255) gCGTGGTCGAGGTCGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCa > 1:709535/1‑150 (MQ=255) cGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCAc < 2:1129290/150‑1 (MQ=255) aGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGACATGACATCGGGGTTCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTgg < 1:771367/150‑1 (MQ=255) gTAGGCCTGGCGCAGCTCGGCAGCTGCAGTCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGa < 2:1675788/150‑1 (MQ=255) aGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACa < 1:710022/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAggctgccg > 1:2000321/1‑127 (MQ=255) cTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAggctgccg < 2:2000321/133‑7 (MQ=255) tGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGttct > 2:2409423/1‑150 (MQ=255) cgcAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTtcttct < 2:1884915/150‑1 (MQ=255) gcAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTg > 2:98206/1‑150 (MQ=255) gCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATc > 1:1405268/1‑150 (MQ=255) aGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGc > 1:431416/1‑150 (MQ=255) tGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACa > 1:35095/1‑128 (MQ=255) tGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACa < 2:35095/128‑1 (MQ=255) tGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCAcc > 1:1752177/1‑150 (MQ=255) gCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCg > 2:1661532/1‑150 (MQ=255) cAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGtt > 2:1400955/1‑82 (MQ=255) cAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGtt < 1:1400955/82‑1 (MQ=255) ccATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGt > 2:1253812/1‑55 (MQ=255) ccATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGt < 1:1253812/55‑1 (MQ=255) ccATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTtcttct > 2:2184777/1‑131 (MQ=255) ccATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTtcttct < 1:2184777/131‑1 (MQ=255) ccATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGt > 2:392831/1‑150 (MQ=255) aTGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTca > 1:1322296/1‑150 (MQ=255) tGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTcag > 2:462860/1‑150 (MQ=255) gACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTcagc > 2:998077/1‑150 (MQ=255) cATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTcagcca < 2:431416/150‑1 (MQ=255) aTCGGGGTGAGAGGACCCCCGGTTGGCGTGGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTcagccag > 2:215840/1‑150 (MQ=255) gCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGAAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTgc < 1:2246093/150‑1 (MQ=255) cGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTg > 2:2371842/1‑61 (MQ=255) cGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTg < 1:2371842/61‑1 (MQ=255) gAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCAAGCACCTTgcgc > 2:1220126/1‑150 (MQ=255) gAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCATAAACAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTgcgc > 1:2097921/1‑150 (MQ=255) aGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGcc > 1:1178549/1‑150 (MQ=255) gACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTgcttcgg < 2:973925/150‑6 (MQ=255) acacCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGt < 1:2359799/150‑1 (MQ=255) caccacGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGtt < 2:1322296/150‑1 (MQ=255) accacGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGttcttc < 2:1982636/107‑1 (MQ=255) accacGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGttcttc > 1:1982636/1‑107 (MQ=255) accacGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTg > 1:522952/1‑150 (MQ=255) accacGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTg > 1:2179478/1‑150 (MQ=255) accacGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTg > 2:2251273/1‑150 (MQ=255) ccacGCTTTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGa > 2:645301/1‑150 (MQ=255) cacGGTGTGGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGGGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGaa > 1:1342788/1‑150 (MQ=255) cacGGTGTCGTCGACCAGCGGGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCTCGCGGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGaa < 2:483760/150‑1 (MQ=255) cacGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGaa < 1:254343/150‑1 (MQ=255) cacGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGaa < 2:709535/150‑1 (MQ=255) cacGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGaa < 2:893807/150‑1 (MQ=255) | CCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAA > NC_002947/4025024‑4025316 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |