| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,237,681 | C→A | 6.7% | E205* (GAG→TAG) ‡ | catB ← | muconate cycloisomerase 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,237,681 | 0 | C | A | 6.7% | 228.7 / 4.6 | 74 | E205* (GAG→TAG) ‡ | catB | muconate cycloisomerase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/28); new base A (2/3); total (43/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.53e-01 | |||||||||||
TTCGATCGACTCATCGGCCATGATCGGAGCCGGACTGCGCTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAGCTTGAACACGCGGTGCCGGCGAATGTCCAGCAT > NC_002947/4237535‑4237825 | ttCGATCGACTCATCGGCCATGATCGGAGCCGGACTGCGCTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTc < 1:1469714/150‑1 (MQ=255) tcgatcgaCTCATCGGCCATGATCGGAGCCGGACTGCGCTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTcc < 1:988203/150‑1 (MQ=255) atcgaCTCATCGGCCATGATCGGAGCCGGACTGCGCTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAg > 2:1877303/1‑150 (MQ=255) atcgaCTCATCGGCCATGATCGGAGCCGGACTGCGCTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACGAGTCCCAg < 1:816836/150‑1 (MQ=255) atcgaCTCATCGGCCATGATCGGAGCCGGACTGCGCTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCCCCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACGAGTCCCAg < 1:169925/150‑1 (MQ=255) cATCGGCCATGATCGGAGCCGGACTGCGCTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGt > 1:837809/1‑150 (MQ=255) tCGGCCATGATCGGAGCCGGACTGCGCTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTg > 1:1912556/1‑150 (MQ=255) ggCCATGATCGGAGCCGGACTGCGCTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGAc < 2:1888352/150‑1 (MQ=255) cATGATCGGAGCCGGACTGCGCTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTc > 2:1177077/1‑150 (MQ=255) tGATCGGAGCCGGACTGCGCTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGa < 1:604671/150‑1 (MQ=255) ggAGCCCGACTGCGCTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGc > 2:1297157/1‑150 (MQ=255) aGCCGGACTGCGCTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTAGATGCCGGTGTCGCACAATACAAGAC‑CACACGTCTGAACTATGGTCTCTGCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCAc > 1:1142197/1‑150 (MQ=255) gCCGGACTGCGCTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAg < 2:296231/126‑1 (MQ=255) gCCGGACTGCGCTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAg > 1:296231/1‑126 (MQ=255) ggACTGCGCTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTg < 2:1912556/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGGCGTTGTCGCAACATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCTCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCt < 1:1374363/150‑1 (MQ=255) cgcTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTg > 1:2155585/1‑150 (MQ=255) gcTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGACTTTGGTTGATGAACCAGGTCGATGCCGTTGTGCCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGt > 1:1854911/1‑150 (MQ=255) gcTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGt > 2:1372950/1‑150 (MQ=255) gcACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTcgc < 1:348620/150‑1 (MQ=255) gcACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTcgc > 2:439717/1‑150 (MQ=255) aCCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACAGCTACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCgcgc > 2:1999424/1‑150 (MQ=255) cagcgtgcgGGTTATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGAt > 2:602750/7‑150 (MQ=255) ccAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATc > 1:449093/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATc < 2:1854911/150‑1 (MQ=255) gcgcGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCAATTGATcgcg > 1:2214289/1‑150 (MQ=255) gATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTg < 2:2155585/150‑1 (MQ=255) aTGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGc < 1:2264764/150‑1 (MQ=255) cgcgAAATCGGCTGCCCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGGCCAATACCTGGCAGCCGCGAATGGCCT‑GGGGCTCGTCACAGTACTAGTTGACATCGACCCGCACGCCTGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTg > 2:318873/1‑150 (MQ=255) gcgAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGa > 1:2218022/1‑150 (MQ=255) tCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGAc > 1:1745577/1‑125 (MQ=255) tCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGAc < 2:1745577/125‑1 (MQ=255) tCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCAcc > 2:1058252/1‑150 (MQ=255) gTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGCTGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAg > 1:1953165/1‑129 (MQ=255) gTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAg < 2:1953165/129‑1 (MQ=255) gATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCggg < 2:2314037/142‑1 (MQ=255) gATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCggg > 1:2314037/1‑142 (MQ=255) gATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACGAGTCCCAgg < 1:748379/56‑2 (MQ=255) gATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACGAGTCCCAgg > 2:748379/1‑55 (MQ=255) aTGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCg < 1:1297157/150‑1 (MQ=255) tGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCCGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGa > 2:1318571/1‑150 (MQ=255) gTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGAtttt > 2:301539/1‑150 (MQ=255) gTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGAtttt > 2:1980326/1‑150 (MQ=255) gTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAg < 2:837809/150‑1 (MQ=255) gTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAg > 2:817853/1‑150 (MQ=255) tCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTgc < 2:423651/123‑1 (MQ=255) tCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTgc > 1:423651/1‑123 (MQ=255) tCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAga > 1:2211200/1‑149 (MQ=255) gCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAGCtt < 1:1478688/150‑1 (MQ=255) gCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAGCtt > 1:1556582/1‑150 (MQ=255) gCCCAAAACCTGGCAGGCGCGGAGGGCCG‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAGCtt > 2:1843142/1‑150 (MQ=255) ccAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAGCTTGa > 2:2046127/1‑150 (MQ=255) cAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAGCTTGaa < 1:817853/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTcgcg > 2:29016/1‑81 (MQ=255) cTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTcgcg < 1:29016/81‑1 (MQ=255) cTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTgg < 2:808138/125‑1 (MQ=255) cTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTgg > 1:808138/1‑125 (MQ=255) cTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAGCTTGAACAcgcg > 2:821240/1‑150 (MQ=255) cTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCAGATTTTGAGTGGGAACAtgcg > 2:518940/1‑150 (MQ=255) gCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAGCTTGAACACGCGGTg > 2:1619666/1‑150 (MQ=255) aGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAGCTTGAACACGCGGTGcc < 1:602750/150‑1 (MQ=255) gATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAGCTTGAACACGCGGTGCCGGCGAAt < 1:1619666/150‑1 (MQ=255) cagtacT‑GGGACGAGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAGCTTGAACACGCGGTGCCGGCGAATg > 2:983097/6‑150 (MQ=255) ccT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAGCTTGAACACGCGGTGCCGGCGAATGTCCa > 2:558261/1‑150 (MQ=255) ccT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAGCTTGAACACGCGGTGCCGGCGAATGTCCa < 2:2353792/150‑1 (MQ=255) ccT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCCGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAGCTTGAACACGCGGTGCCGGCGAATGTCCa < 1:1318571/150‑1 (MQ=255) cT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGCCCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAGCTTGAACACGCGGTGCCGGCGAAt > 2:694998/1‑144 (MQ=255) cT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTcc < 1:136723/91‑1 (MQ=255) cT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTcc > 2:136723/1‑91 (MQ=255) cT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAGCTTGACGACGCGGTGCCGGCGAAt < 1:694998/144‑1 (MQ=255) cT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCCTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAGCTTGAACACGCGGTGCCGGCGAATGTCCAg > 2:2151647/1‑150 (MQ=255) ggACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAGCTTGAACACGCGGTGCCGGCGAATGTCCAGCAt > 1:1422420/1‑150 (MQ=255) gACTCGTCCCAGTACTGTGTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCAcc > 1:83242/1‑50 (MQ=255) gACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCAcc < 2:83242/50‑1 (MQ=255) | TTCGATCGACTCATCGGCCATGATCGGAGCCGGACTGCGCTGGTTCAGGCGCACCTGGCCAGCGCGGTTGATGCGCGAAATCGGCTGCTCGATCAGGTCGATGCCGTTGTCGCCCAATACCTGGCAGGCGCGGATGGCCT‑GGGACTCGTCCCAGTACTGGTTGACGTCGACCCGCACGCTGGCGCTGTCACCCAGCTCGCGCTTGATCGCGACCACGTGCTTGAGGTCCTGCGCCACCGGGTTGGCGCCGATTTTCAGCTTGAACACGCGGTGCCGGCGAATGTCCAGCAT > NC_002947/4237535‑4237825 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |