| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,240,280 | C→T | 6.1% | P18P (CCG→CCA) | PP_3717 ← | LuxR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,240,280 | 0 | C | T | 6.1% | 327.1 / 5.7 | 110 | P18P (CCG→CCA) | PP_3717 | LuxR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (54/49); new base T (2/5); total (56/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.66e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTGCGCATGGGTG > NC_002947/4240132‑4240429 | gCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCg > 1:2074454/1‑150 (MQ=255) cACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCgg > 1:1402585/1‑150 (MQ=255) aCCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGc > 1:1662865/1‑150 (MQ=255) gtatgtGGCCGCTGCCATCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCa > 2:802358/6‑150 (MQ=255) aaCTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGTGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGTGCATGCCCGGCAGt > 1:1101841/1‑150 (MQ=255) aaCTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGt > 1:1158911/1‑150 (MQ=255) tGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTa > 2:2251222/1‑150 (MQ=255) gggCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTa < 2:441344/149‑1 (MQ=255) ggCCGCTGCCATCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAAGCAGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAg > 1:22937/1‑150 (MQ=255) cGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCt > 1:2029256/1‑150 (MQ=255) cGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCt > 1:2174881/1‑150 (MQ=255) gCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCTGGCAGGCTAGACTGccgg < 2:1990704/150‑3 (MQ=255) gCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAg < 1:1850647/150‑1 (MQ=255) gCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAg < 2:2074454/150‑1 (MQ=255) cAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAgg < 1:2054920/150‑1 (MQ=255) aGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGc < 2:630482/150‑1 (MQ=255) gCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCa > 2:1262714/1‑150 (MQ=255) gCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACACCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCTGGCAGGCTAGACTGCCGGGCa < 2:718246/150‑1 (MQ=255) cacaTACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGccc > 1:566871/1‑150 (MQ=255) acaTACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCcg > 1:804884/1‑150 (MQ=255) caTACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCcgc > 1:1907455/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGc > 1:102288/1‑150 (MQ=255) cgcCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCt < 1:665254/150‑1 (MQ=255) ccTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCttt < 2:1642853/150‑1 (MQ=255) gggggTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTgcgc < 1:2184845/150‑1 (MQ=255) gggTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCa < 1:1965050/150‑1 (MQ=255) gggTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGAAGCAGTAGCCCCGGTTGCTGGCGCTACTTGCAGTCTTGGGTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCa < 1:1252502/150‑1 (MQ=255) ggTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAg < 2:2027074/150‑1 (MQ=255) aCCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCAt < 1:1262714/150‑1 (MQ=255) ccATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATc < 2:2033734/150‑1 (MQ=255) ccATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATc < 2:2029256/150‑1 (MQ=255) tGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCggt < 2:1907455/150‑2 (MQ=255) gCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCtt > 1:388137/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCTgg < 1:804552/91‑1 (MQ=255) ccAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTg < 1:146508/150‑1 (MQ=255) gcgcgcTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACa > 2:1222530/1‑150 (MQ=255) cgcgcTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAg < 2:2174881/150‑1 (MQ=255) gcTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGcc > 1:816231/1‑150 (MQ=255) cAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAgg > 2:748499/1‑144 (MQ=255) aaCGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCTGGCAGGCTAGACTGCCGGGCa < 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cACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTg > 2:1375874/1‑150 (MQ=255) cACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTCAATCGGCCTTGGAACGGTCCAAGCGCCGTg > 2:1343659/1‑150 (MQ=255) cACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCAc < 2:1608601/150‑1 (MQ=255) aCTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGcaca > 1:957198/1‑95 (MQ=255) aCTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCAcg > 1:1897447/1‑150 (MQ=255) gctgcAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCAcgcgc < 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ccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAgg < 2:1576817/115‑1 (MQ=255) ccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAgg > 1:1576817/1‑115 (MQ=255) ccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAatgat > 2:1215691/1‑150 (MQ=255) aTTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGc > 2:252293/1‑150 (MQ=255) ttGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCa < 2:1916781/150‑1 (MQ=255) gtgAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGTTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGcc > 1:1505452/1‑119 (MQ=255) 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ccTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCAc > 1:1883546/1‑150 (MQ=255) cTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTg > 2:1058464/1‑74 (MQ=255) cTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTg < 1:1058464/74‑1 (MQ=255) cTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCAcc > 1:2261951/1‑150 (MQ=255) ggTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTgc < 1:1222530/150‑1 (MQ=255) ggTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTgc < 1:1120262/150‑1 (MQ=255) tCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTgcgc > 2:1369018/1‑150 (MQ=255) tCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCACGGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTgcgc > 1:1956645/1‑150 (MQ=255) gCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTGCGCATgg < 2:1897447/150‑1 (MQ=255) gCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTGCGCATgg > 1:1508550/1‑150 (MQ=255) gCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTGCGCATgg < 2:388137/150‑1 (MQ=255) gCCCGGCAGTCTAGCCCGCCAGTCACGCCCGCGCACAGGCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTGCGCATgg < 2:53972/150‑1 (MQ=255) ccccGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTGCGCATgg < 1:277591/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTGCGCATGGGt > 2:1917777/1‑150 (MQ=255) ccGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTGCGCATGGGt > 1:1010126/1‑150 (MQ=255) ccGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCGTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGCAAGCCCCATCCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTGCGCATGGGt < 1:2223144/150‑1 (MQ=255) cGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGTCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTGCGCATGGGtg > 1:397128/1‑150 (MQ=255) cGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCAACTATCTCGTCCACCTGCGCATGGGtg > 1:1210271/1‑150 (MQ=255) | GCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTGCGCATGGGTG > NC_002947/4240132‑4240429 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |