Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,279,857 | T→G | 8.8% | L338R (CTG→CGG) | PP_3750 → | GntR family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,279,857 | 0 | T | G | 8.8% | 186.5 / 9.8 | 68 | L338R (CTG→CGG) | PP_3750 | GntR family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/31); new base G (3/3); total (34/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.33e-01 |
TACGACTGTGAGTTCCGCTACCACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCC > NC_002947/4279709‑4280006 | tacgactGTGAGTTCCGCTACCACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTg > 1:287699/1‑150 (MQ=255) tacgactGTGAGTTCCGCTACCACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTg > 1:1983038/1‑150 (MQ=255) tacgactGTGAGTTCCGCTACCACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTg > 1:1317159/1‑150 (MQ=255) acgagtGGGGGTTCCGCTACCACGGGCGTGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGc > 2:32856/1‑150 (MQ=255) ctGTGAGTTCCGCTACCACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGc > 1:1017489/1‑150 (MQ=255) ctGTGAGTTCCGCTACCACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGc < 1:904855/150‑1 (MQ=255) tgtgAGTTCCGCTACCACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGcc > 1:322703/1‑150 (MQ=255) gtgAGTTCCGCTACCACGGGACAGCATCGGAAGCGGTGCAGCCTCTGGAGCGACATGGGCTGGTTGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCAGTACGGCAGGcgg < 2:1129774/150‑3 (MQ=255) ccGCTACCACGGGCCCGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGTGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCCCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGt < 2:542488/150‑1 (MQ=255) ccGCTACCACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGt < 2:2354707/150‑1 (MQ=255) aCCACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCa < 2:1168173/150‑1 (MQ=255) ccACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCaa < 2:1965034/150‑1 (MQ=255) aCGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGc > 2:2391806/1‑150 (MQ=255) ggCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCAcc < 2:287699/150‑1 (MQ=255) gCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGc > 1:381343/1‑150 (MQ=255) cTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGc > 1:205403/1‑130 (MQ=255) cTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGc < 2:205403/130‑1 (MQ=255) cTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTGCTCCAAGACCTTGCTGCCTTTGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGa < 2:1771361/150‑1 (MQ=255) tCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGAc > 2:523071/1‑150 (MQ=255) cTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGc < 2:1017489/150‑1 (MQ=255) cTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGc < 1:523071/150‑1 (MQ=255) gCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTAc < 1:2391806/150‑1 (MQ=255) ggACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTCAGCGACTGGCACAGCCCTACCctgct < 1:1596570/150‑1 (MQ=255) gCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTg > 2:204128/1‑150 (MQ=255) cTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTg > 2:2399222/1‑150 (MQ=255) tGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTgg < 2:1983038/150‑1 (MQ=255) gTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGgcg > 1:1628565/1‑150 (MQ=255) gCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCAc < 2:1020662/102‑1 (MQ=255) gCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCAc > 1:1020662/1‑102 (MQ=255) cTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCtt > 1:307396/1‑150 (MQ=255) cTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCtt > 2:1026571/1‑150 (MQ=255) cTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCAGTACGGCAGGcgg > 2:298991/1‑81 (MQ=255) cTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCAGTACGGCAGGcgg < 1:298991/83‑3 (MQ=255) tACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCa > 1:1309318/1‑77 (MQ=255) tACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCa < 2:1309318/77‑1 (MQ=255) gTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCtt < 2:1628565/150‑1 (MQ=255) cGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTgg < 1:133044/150‑1 (MQ=255) ggACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTCTGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGcc > 2:590337/1‑149 (MQ=255) ggACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTgg > 2:2347585/1‑128 (MQ=255) ggACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTgg < 1:2347585/128‑1 (MQ=255) ccTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAg < 1:2016952/150‑1 (MQ=255) ttCCCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGc < 1:410396/150‑1 (MQ=255) tcCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCAc < 1:2399222/150‑1 (MQ=255) ccAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCAcc > 2:739935/1‑150 (MQ=255) cAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCt > 2:534907/1‑150 (MQ=255) cAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCATTGGCGAAgagatcgg > 1:404252/1‑143 (MQ=255) cTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACaa < 2:472592/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGGCCGATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAg > 1:674440/1‑150 (MQ=255) ttGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAg < 1:1026571/150‑1 (MQ=255) tgctgcCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCt > 2:1469189/1‑76 (MQ=255) tgctgcCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCt < 1:1469189/76‑1 (MQ=255) tgctgcCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGTCGAAGGCCACCTGAACAAGc < 2:1294218/150‑1 (MQ=255) cGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCGTCCTTGGCGAAGGCCACCTGCACAAGCACATccg > 2:180539/1‑150 (MQ=255) cTGGGCTATGCCGTATTACGGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCAc < 2:1584895/150‑1 (MQ=255) tGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACg > 2:855391/1‑150 (MQ=255) gggCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGa < 2:2252497/150‑1 (MQ=255) tATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTc > 1:1079832/1‑150 (MQ=255) tGCCGTATTACCGCCTGCCCTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTa < 1:534907/150‑1 (MQ=255) ccGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCCTAGCTAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACa < 1:1833435/150‑1 (MQ=255) ccGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTc > 1:1806424/1‑138 (MQ=255) ccGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTc < 2:1806424/138‑1 (MQ=255) ggCCTGCAGTACGGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGaa > 2:371441/2‑98 (MQ=255) ggCCTGCAGTACGGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGaa < 1:371441/97‑1 (MQ=255) ggCCTGCAGTACGGCAGGCCGCTTGCGTGGCAACGGACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCAcgcc > 1:2371181/2‑150 (MQ=255) tGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCa > 1:1036999/1‑142 (MQ=255) tGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCa < 2:1036999/142‑1 (MQ=255) ccGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCGCGCCGCGAgc > 1:1306840/1‑150 (MQ=255) cTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCGCAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTACTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATc > 1:2168748/1‑150 (MQ=255) tGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGATCGCATcc < 2:1079832/150‑1 (MQ=255) tGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATcc > 2:2108822/1‑150 (MQ=255) | TACGACTGTGAGTTCCGCTACCACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCC > NC_002947/4279709‑4280006 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |