| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,716,693 | G→C | 5.2% | Q626H (CAG→CAC) | PP_4173 → | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,716,693 | 0 | G | C | 5.2% | 373.3 / 7.3 | 116 | Q626H (CAG→CAC) | PP_4173 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (51/59); new base C (3/3); total (54/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.42e-01 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
ACCCGACGCATCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAGGTGCGCTGT > NC_002947/4716544‑4716841 | aCCCGACGCATCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGcagcag > 1:2014468/1‑150 (MQ=255) cccGACGCATCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGAAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAgg > 2:1476484/1‑150 (MQ=255) ccGACGCATCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGt > 1:2173432/1‑150 (MQ=255) ccGACGCATCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGAAGGGCGACAGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGGATGGACAAATCTCGGTGGTAGCCGTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGt > 2:194934/1‑150 (MQ=255) cGACGCATCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGtg < 2:2173432/150‑1 (MQ=255) cATCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCa > 1:1371041/1‑150 (MQ=255) aTCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAg > 1:459864/1‑150 (MQ=255) aTCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCACCTGCTGCaa < 1:256695/150‑2 (MQ=255) tCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAgc < 2:1512878/150‑1 (MQ=255) cGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACTCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCACCTGCTGCaattc < 2:1814833/150‑5 (MQ=255) gCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATAGAAATGAAGGTCAACCTGTCGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCt > 1:1253177/1‑150 (MQ=255) ccAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGTACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTg > 1:359600/1‑150 (MQ=255) cAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACTCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTgg < 1:1122755/150‑1 (MQ=255) aGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGTTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCAGCGAATTGCCGCAGGTGCTGCAgcggggtt > 2:1122755/1‑145 (MQ=255) aGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGt < 2:1253177/150‑1 (MQ=255) gTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCACCTGCTGCaattcg > 1:105003/1‑141 (MQ=255) gTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCACCTGCTGCaattcg < 2:105003/146‑6 (MQ=255) cccAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTAccc < 2:2373700/150‑1 (MQ=255) ccAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTg > 2:1680033/1‑142 (MQ=255) ccAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTg < 1:1680033/142‑1 (MQ=255) ccAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCg > 2:1085888/1‑150 (MQ=255) ccAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCg > 1:571529/1‑150 (MQ=255) ccAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCg > 2:774757/1‑150 (MQ=255) aaCGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGt > 1:1928371/1‑150 (MQ=255) cGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGAAACGCTGGTTACCCGGTCa < 1:83342/150‑1 (MQ=255) gcgcCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGa < 2:2186310/150‑1 (MQ=255) gcgcCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGa < 1:1566995/150‑1 (MQ=255) gggCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAAcc > 1:2105974/1‑150 (MQ=255) gggCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAAcc > 1:1052231/1‑150 (MQ=255) gggCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAAcc > 2:1030345/1‑150 (MQ=255) gCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACcgc < 1:359904/150‑1 (MQ=255) ccGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTAc > 1:1950308/1‑130 (MQ=255) ccGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTAc < 2:1950308/130‑1 (MQ=255) ccGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACt > 1:648933/1‑150 (MQ=255) atcatcGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGc < 1:885582/150‑1 (MQ=255) catcGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGa < 2:29367/150‑1 (MQ=255) tcGCCGTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACAGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCCGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATa > 2:890705/1‑150 (MQ=255) tcGCCCTGACCGCCAACGCGTGGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGTAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATa > 2:1908419/1‑150 (MQ=255) cGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATaa > 2:1200169/1‑150 (MQ=255) gCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATaaa < 2:70209/150‑1 (MQ=255) cccTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAAt < 1:1726789/150‑1 (MQ=255) cccTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAAt < 2:1311835/150‑1 (MQ=255) cccTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAAt > 2:441016/1‑150 (MQ=255) cTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGc < 2:459864/150‑1 (MQ=255) cGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAg > 2:1501102/1‑150 (MQ=255) cGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAg > 1:249812/1‑150 (MQ=255) ccAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTAccc < 1:911329/113‑1 (MQ=255) aCGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCgg < 2:2271431/150‑1 (MQ=255) aCGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCgg < 1:774757/150‑1 (MQ=255) cgTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAg 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cgcgAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGa < 1:1085888/150‑1 (MQ=255) gAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAg < 1:1501102/150‑1 (MQ=255) gAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAg > 1:700373/1‑150 (MQ=255) aaCGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAgg < 1:890705/150‑1 (MQ=255) aCGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGa < 1:91024/150‑1 (MQ=255) aCGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGAGATGGTTACCCGGAAAAACATCCGCGACTTGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGa < 1:1500209/150‑1 (MQ=255) cATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCa > 1:2207322/1‑150 (MQ=255) aaTGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACACTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGAAAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGAGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGCCCTTCa > 2:1101000/2‑150 (MQ=255) aTGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACa > 2:896605/1‑140 (MQ=255) ggCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCg < 1:441016/150‑1 (MQ=255) 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tGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGt > 1:1695813/1‑150 (MQ=255) ttGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCTACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTa < 1:970592/150‑1 (MQ=255) gccgtACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTActtc < 2:1577085/150‑1 (MQ=255) gccgcACCGCGGTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTActtc < 2:61824/150‑1 (MQ=255) gccgcACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCAAACCTGTActtc > 1:1573417/1‑150 (MQ=255) ccgcACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTActtct < 1:626090/150‑1 (MQ=255) cgcACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTActtctt < 2:2207322/150‑1 (MQ=255) cACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTc < 2:2370113/150‑1 (MQ=255) ccagcgctGCAGCACCTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCg > 2:183185/8‑150 (MQ=255) cGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCt < 2:245387/136‑1 (MQ=255) cGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCt > 1:245387/1‑136 (MQ=255) ttGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAGGt < 1:1030345/150‑1 (MQ=255) gcagGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGACTTATATACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATACACATTTCAGTGCACACCTTTACTTCTTTCGCCAGGTGCGCt < 1:194934/150‑1 (MQ=255) | ACCCGACGCATCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAGGTGCGCTGT > NC_002947/4716544‑4716841 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |