| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,902,717 | T→C | 7.2% | V196A (GTG→GCG) ‡ | PP_4310 → | hydantoin racemase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,902,717 | 0 | T | C | 7.2% | 328.1 / 10.6 | 110 | V196A (GTG→GCG) ‡ | PP_4310 | hydantoin racemase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (42/60); new base C (4/4); total (46/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.18e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.18e-01 | |||||||||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
GCTGGAACTGGAAGCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAGTGGTGGGCTGGCCGATGCGCTTCGGCCGCTAGAGA > NC_002947/4902568‑4902862 | gCTGGAACTGGAAGCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGt < 2:1579857/150‑1 (MQ=255) tggaaGCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGc > 1:2096997/1‑144 (MQ=255) tggaaGCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGc < 2:2096997/144‑1 (MQ=255) tggaaGCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCggtgg < 2:2119951/150‑1 (MQ=255) tggaaGCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCggtgg > 1:1609847/1‑150 (MQ=255) ggaaGCGGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGTTTGTCGAGCAGGCCCAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATCGCAGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCggtggt < 1:1041912/150‑1 (MQ=255) ggaaGCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCggtggt < 2:321928/150‑1 (MQ=255) ggaaGCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCggtggt < 1:2240882/150‑1 (MQ=255) ggaaGCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTAAGCTGTCTGGGTTGTGGCGGCAGGGCCGGGCTGGAAGAGAAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCggtggt > 1:43892/1‑150 (MQ=255) gagcccGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGgtggtg < 1:505601/146‑1 (MQ=255) aaGCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCACGCCggtgcgtt < 2:1630890/150‑5 (MQ=255) aaGCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCACGCCggtgcgtt < 2:718135/150‑5 (MQ=255) aGCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGa < 1:1572259/150‑1 (MQ=255) gCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGAt > 1:603992/1‑150 (MQ=255) gCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGAt > 1:2080938/1‑150 (MQ=255) ccGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATg < 2:2181856/150‑1 (MQ=255) cGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATgg < 2:1609847/150‑1 (MQ=255) ccGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGtgtg > 1:763118/1‑150 (MQ=255) cGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGTCGGTGGTGGATGGTGTGa < 1:622406/150‑1 (MQ=255) cGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGa < 1:250510/150‑1 (MQ=255) cGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCa > 1:1593567/1‑150 (MQ=255) cGTGGAGGCGATGGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGt < 1:2011544/150‑1 (MQ=255) gagaCGATTGTCGAGCAGGCCGAACCCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAc‑c > 2:93459/1‑150 (MQ=255) ggCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CAt > 1:1370666/1‑150 (MQ=255) gCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CAtt < 1:1192657/150‑1 (MQ=255) gCGATTGTCGAGCAGGCCGAACCCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGCTGGTGTCAGTGCAGCGGTGAC‑CAtt < 2:96199/150‑1 (MQ=255) gATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGgtgt < 2:2251964/129‑1 (MQ=255) gATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGgtgt > 1:2251964/1‑129 (MQ=255) gATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAc < 2:1155761/144‑1 (MQ=255) gATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAc > 1:1155761/1‑144 (MQ=255) gATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGc < 2:765675/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCg > 2:1454581/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCg < 2:1593567/150‑1 (MQ=255) aGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGc < 1:2378888/150‑1 (MQ=255) cAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTg < 2:1386595/150‑1 (MQ=255) gCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGACGTAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTg > 1:1270683/1‑150 (MQ=255) ccGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGTAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTgc < 1:318115/150‑1 (MQ=255) cGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTgcg > 1:1903398/1‑150 (MQ=255) aaCGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCa < 2:1880844/150‑1 (MQ=255) aaCGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCa < 2:43892/150‑1 (MQ=255) gcgcCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATgg < 2:2111287/150‑1 (MQ=255) gcgcCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATgg < 1:2313904/150‑1 (MQ=255) gcgcCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCCCCGGTGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑TATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATgg < 1:1132851/150‑1 (MQ=255) gcCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGt < 2:603992/150‑1 (MQ=255) tGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGa < 2:736685/150‑1 (MQ=255) gacAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCTGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTcc > 1:46213/1‑150 (MQ=255) cAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCaa > 1:1124203/1‑150 (MQ=255) aaGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTg > 1:950962/1‑112 (MQ=255) aaGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTg < 2:950962/112‑1 (MQ=255) aaGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCaaa < 2:1542248/150‑1 (MQ=255) aaGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCaaa < 2:1370666/150‑1 (MQ=255) ggCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCTAATCGCTGGTGCGCATGTGTTTAAACACGTCCAACGt > 2:462677/1‑150 (MQ=255) gCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CAtt < 1:145908/108‑1 (MQ=255) gCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CAtt > 2:145908/1‑108 (MQ=255) tGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCt > 2:267991/1‑150 (MQ=255) aTCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑TATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGttt > 1:892467/1‑125 (MQ=255) aTCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGttt < 2:892467/125‑1 (MQ=255) aTCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGa > 2:1390687/1‑127 (MQ=255) aTCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTAt < 2:46213/150‑1 (MQ=255) tCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCgg < 2:1687555/90‑1 (MQ=255) tCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCgg > 1:1687555/1‑90 (MQ=255) ccTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGc > 2:2318986/1‑104 (MQ=255) ccTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGc < 1:2318986/104‑1 (MQ=255) ccTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTgc > 2:2409156/1‑110 (MQ=255) ccTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTgc < 1:2409156/110‑1 (MQ=255) ccTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGCGAGAAAACCGCTGACTCACT‑CGGATGCGCGCGCGCGCATGGGTGTGGGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGAc < 2:2080938/150‑1 (MQ=255) tGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGc > 2:176148/1‑150 (MQ=255) ggTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCa > 2:1450935/1‑150 (MQ=255) ggTTGTGGAGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCa < 2:1124203/150‑1 (MQ=255) ttGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACg > 1:434914/1‑150 (MQ=255) tgtgGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGGCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTCCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACgg < 2:1048347/150‑1 (MQ=255) ggcATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGc > 2:2035415/1‑83 (MQ=255) ggcATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGc < 1:2035415/83‑1 (MQ=255) ggCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGa < 1:1348921/59‑1 (MQ=255) gCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAgtg < 1:1785607/150‑1 (MQ=255) gggCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAgtggtg < 2:763118/150‑1 (MQ=255) gggCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAgtggtg < 2:2374329/150‑1 (MQ=255) gCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTgc < 2:471034/113‑1 (MQ=255) gCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTgc > 1:471034/1‑113 (MQ=255) gCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAGTGGTggg > 1:2087951/1‑150 (MQ=255) tGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTTAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAGTGGTGGGCt > 2:1591501/1‑150 (MQ=255) ggaGATGCGCCATCGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTTAGTGTAGCGGTGAC‑TATTGCCGAATCGCTGGTCCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCTACGCCACGGGCGAAGAAAGTGGTGGGCTGGCCGAt < 2:1068720/148‑1 (MQ=255) gCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAGTGGTggg > 1:1440073/1‑141 (MQ=255) gCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAGTGGTggg < 2:1440073/141‑1 (MQ=255) aTTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAGTGGTGGGCTGGCCGATgcgc < 1:597382/150‑1 (MQ=255) aTTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAGTGGTGGGCTGGCCGATgcgc > 1:850547/1‑150 (MQ=255) ccAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAgtg < 2:1188816/127‑1 (MQ=255) ccAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAgtg > 1:1188816/1‑127 (MQ=255) atccaccACCGGCACGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAg > 1:2021509/7‑125 (MQ=255) atccaccACCGGCACGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAg < 2:2021509/119‑1 (MQ=255) cAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAGTGGTGGGCTGGCCGATGTGATTCGGc > 1:1443177/1‑150 (MQ=255) accACCGGCACGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTTAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAgtggt < 1:1044233/123‑1 (MQ=255) accACCGGCACGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAgtggt > 2:1044233/3‑125 (MQ=255) accACCGGCACGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAGTGGTGGGCTGGCCGAt > 1:1591541/3‑137 (MQ=255) gCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCa < 2:371731/93‑1 (MQ=255) gCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCa > 1:371731/1‑93 (MQ=255) cACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTTAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAGTGGTGGGCTGGCCGATGCGCTTCGGCCGCTa < 1:1591501/150‑1 (MQ=255) ggCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAAAAAGTGGTGGGCTGGCCGATGCGCTTCGGCCGCTAgaga > 2:2284015/1‑150 (MQ=255) gCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCgaa > 1:206326/1‑109 (MQ=255) gCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCgaa < 2:206326/109‑1 (MQ=255) | GCTGGAACTGGAAGCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTGATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGCACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGAC‑CATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAGTGGTGGGCTGGCCGATGCGCTTCGGCCGCTAGAGA > NC_002947/4902568‑4902862 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |