Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,931,240 | A→G | 8.1% | S59P (TCC→CCC) | cheY ← | two‑component system response regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,931,240 | 0 | A | G | 8.1% | 321.3 / 13.3 | 113 | S59P (TCC→CCC) | cheY | two‑component system response regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (51/52); new base G (5/4); total (56/57) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.71e-01 |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
CGGTGAACGGCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATCCGCCGCATCGTCGAAA > NC_002947/4931093‑4931389 | cGGTGAACGGCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACa < 2:1160385/150‑1 (MQ=255) ggTGAACGGCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACAt > 1:1983276/1‑150 (MQ=255) ggTGAACGGCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTGCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACAt > 1:1182226/1‑150 (MQ=255) gTGAACGGCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATg > 2:2241135/1‑150 (MQ=255) tGAACGGCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGACACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGc > 1:1362924/1‑150 (MQ=255) aaCGGCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGccc < 1:2337274/150‑1 (MQ=255) aaCGGCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGccc > 2:491436/1‑150 (MQ=255) gCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCa > 1:408524/1‑150 (MQ=255) ttGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATg > 1:2136268/1‑150 (MQ=255) gACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGtt > 2:2237382/1‑150 (MQ=255) aCCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGGCATGTCCGGCAtcgac < 1:2196528/150‑5 (MQ=255) aCCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTc < 1:1105555/150‑1 (MQ=255) cacaTAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCa < 1:2237382/150‑1 (MQ=255) acaTAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAg < 1:1063591/150‑1 (MQ=255) acaTAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAg > 2:1826459/1‑150 (MQ=255) acaTAACCATTGACGCCAGCCTGGGCAGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAg > 1:66182/1‑150 (MQ=255) caTAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGt < 1:638731/150‑1 (MQ=255) tAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCg < 1:192987/150‑1 (MQ=255) aaCCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCgg > 2:187576/1‑150 (MQ=255) ccATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTc > 2:1175527/1‑150 (MQ=255) aTTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCNTGGCTTNAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCAc > 1:1567449/1‑150 (MQ=255) ttGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGt < 2:1838337/136‑1 (MQ=255) tGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCAATTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCa < 1:1296277/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGaa > 2:1503776/1‑150 (MQ=255) gCCAGCCTGGGCCGCATCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCCTCAAGACCGGGATGCTTTAGAACTTTTCGCTGACACGGAATTTAGGCAGAAGGTAGATGCCGAACATGCCCGGCATATTCCAGTCAGTCAcgaataa > 2:466753/1‑144 (MQ=255) cAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGt > 1:425861/1‑150 (MQ=255) cTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTGCGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTa < 1:1861956/150‑1 (MQ=255) ggCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCg > 1:196922/1‑130 (MQ=255) gCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCATCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGa > 2:2274722/1‑150 (MQ=255) ccGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCCTCAAATACGATATGCTGTTCTGTTGGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGAc < 1:1741313/150‑1 (MQ=255) ttCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGtt > 2:248795/1‑150 (MQ=255) cAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGa < 2:228664/100‑1 (MQ=255) cAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGa > 1:228664/1‑100 (MQ=255) aaaTGACCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCCGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGtttt < 1:113431/149‑1 (MQ=255) aaTGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTc > 2:1567251/1‑150 (MQ=255) tGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTc > 1:2919/1‑113 (MQ=255) tGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTc < 2:2919/113‑1 (MQ=255) tGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCa < 1:248795/150‑1 (MQ=255) tGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCa > 2:1105566/1‑150 (MQ=255) cTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCg < 2:1320593/115‑1 (MQ=255) tGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATc < 1:118690/150‑1 (MQ=255) tGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATc < 2:408524/150‑1 (MQ=255) tCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGc < 2:1128169/150‑1 (MQ=255) gcTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGa > 1:412370/1‑128 (MQ=255) gcTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGa < 2:412370/128‑1 (MQ=255) gcTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACg > 1:1766416/1‑150 (MQ=255) tcTTCAGCGGTCATCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCCTCGGCAACGCCgtg < 1:4997/149‑1 (MQ=255) gCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGGCATGTCCg < 1:1312380/88‑1 (MQ=255) gCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGGCATGTCCg > 2:1312380/1‑88 (MQ=255) cTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGGCgtgg > 2:2302395/1‑150 (MQ=255) cTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCgtgg < 2:2136268/150‑1 (MQ=255) cTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCgtgg > 2:621191/1‑150 (MQ=255) cTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCgtgg > 1:1536805/1‑150 (MQ=255) cGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGt > 1:563119/1‑150 (MQ=255) gTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCgtgg < 1:1804267/142‑1 (MQ=255) gTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCgtgg > 2:1804267/1‑142 (MQ=255) cATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCg > 2:894448/1‑125 (MQ=255) cATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCg < 1:894448/125‑1 (MQ=255) cATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGc < 1:1567251/150‑1 (MQ=255) aTCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCt > 1:2409194/1‑150 (MQ=255) aGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTtcgt < 1:621191/150‑1 (MQ=255) cGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGgt < 2:66182/150‑1 (MQ=255) cATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGATTCGCCGGtttt > 2:746703/1‑150 (MQ=255) aTGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTg < 2:1567449/150‑1 (MQ=255) gCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCgtggtg > 1:997350/1‑124 (MQ=255) ttCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGaaa < 1:1503776/150‑1 (MQ=255) cAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAAcc < 2:425861/150‑1 (MQ=255) aGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAAccc < 2:563119/150‑1 (MQ=255) cTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAg < 2:1362924/150‑1 (MQ=255) ttGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCa < 1:1262054/59‑1 (MQ=255) ttGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCa > 2:1262054/1‑59 (MQ=255) tGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCa > 1:936189/1‑150 (MQ=255) gcacgcacTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAAc > 1:2055460/1‑150 (MQ=255) gcacgcacTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAAc < 1:1105566/150‑1 (MQ=255) gcacgcacTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCAACAGGAAGTCGTAGTGCCCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTGGGTGAAACCCAGGTCACGCAAc > 1:1703284/1‑150 (MQ=255) acgcacTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAg > 1:2202756/1‑150 (MQ=255) acgcacTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGACAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAg > 1:1235480/1‑150 (MQ=255) cgcacTTTACGCATCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAgg < 1:2274722/150‑1 (MQ=255) acTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTc < 1:1037407/150‑1 (MQ=255) acTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTc > 1:1795934/1‑150 (MQ=255) acTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGGTc > 1:469289/1‑150 (MQ=255) tttACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTa > 2:1057337/1‑63 (MQ=255) tttACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTa < 1:1057337/63‑1 (MQ=255) tttACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCtt > 1:1061966/1‑150 (MQ=255) tACGCAGCCGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGGCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCACCGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTtga < 2:2313723/150‑1 (MQ=255) tACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTtga < 1:2241135/150‑1 (MQ=255) tACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCAAGGTCACGCCTCAGGTTCTtgt < 2:645354/150‑2 (MQ=255) aCGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTtgat > 1:1395470/1‑150 (MQ=255) gcagtaGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCTGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTtgatga > 2:131684/1‑150 (MQ=255) cagcagGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTgatgat < 2:1061966/150‑1 (MQ=255) gcagGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATcc < 2:2409194/150‑1 (MQ=255) ggTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCCTGGTGCGGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATccgcc < 1:2302395/150‑1 (MQ=255) aacaTGCCGGGCATGTCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTtcgtcgc > 1:2034003/4‑102 (MQ=255) aacaTGCCGGGCATGTCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTtcgtcgc < 2:2034003/100‑2 (MQ=255) aTGCCGGGCATGTCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTTGAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATCCGCCGCAtc > 2:2134050/1‑150 (MQ=255) aTGCCGGGCATGTCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGgt > 2:303641/1‑101 (MQ=255) aTGCCGGGCATGTCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGgt < 1:303641/101‑1 (MQ=255) tGCCGGGCATGTCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATCCGCCGCAtcg > 1:1795333/1‑150 (MQ=255) ccGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATCCGCCGCAtcgtc < 1:491436/150‑1 (MQ=255) aCATCCCCCGTATGTTCCAGTCTGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCTGCTTCTTCTGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATCCGCCGCATCGTCGaaa < 2:469289/150‑1 (MQ=255) | CGGTGAACGGCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTCCAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATCCGCCGCATCGTCGAAA > NC_002947/4931093‑4931389 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |