| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,973,318 | T→G | 7.0% | E92A (GAG→GCG) ‡ | flgL ← | flagellar hook‑associated protein FlgL |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,973,318 | 0 | T | G | 7.0% | 323.4 / 8.4 | 112 | E92A (GAG→GCG) ‡ | flgL | flagellar hook‑associated protein FlgL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (54/49); new base G (6/3); total (60/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
ACGACTTGGAGCCGCCAAACATGTAGTCGCCGTTGGCATCGCGCGAGTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCCAACAAGGCGCTCTGTTGCTGCAGCACCAGCAGGCGCGCAGCGCCGACCGGG > NC_002947/4973169‑4973467 | acgacTTGGAGCCGCCAAACATGTAGTCACAGTTACCAGGCCGCGTTTTCAGCATACATAACACGTTGGCTTCGACAT‑CAGCAGTACGGTCCAGAGTGGAGTGATGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTTGATGGCCAGCt > 1:551134/1‑150 (MQ=255) ttGGAGCCGCCAAACATGTAGTCGCCGTTGGCATCGCGCGAGTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTg < 2:1621104/150‑1 (MQ=255) aGCCGCCAAACATGTAGTCGCCGTTGGCATCGCGCGAGTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCGAGCTGGcga < 2:1092147/150‑3 (MQ=255) ccAAACATGTAGTCGCCGTTGGCATCGCGCGAGTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAACTCGCTGGCACGCTGc > 2:1152771/1‑150 (MQ=255) agacgtGTACTCGCCGTTGGCATCGCGCGATTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCATCATCGCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAg < 1:1731557/145‑1 (MQ=255) aaaCATGTAGTCGCCGTTGGCATCGCGCGAGTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAg < 2:697510/150‑1 (MQ=255) gTCGCCGTTGGCATCGCGCGAGTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGc < 1:1053072/128‑1 (MQ=255) gTCGCCGTTGGCATCGCGCGAGTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGc > 2:1053072/1‑128 (MQ=255) gCCGTTGGCATCGCGCGAGTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGTTTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCATCAGCTTCCGGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGAt < 1:1870297/150‑1 (MQ=255) gCCGTTGGCATCGCGCGAGTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTg > 1:148520/1‑127 (MQ=255) ccGTTGGCATCGCGCGAGTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATg < 1:832073/150‑1 (MQ=255) gTTGGCATCGCGCGAGTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGt > 1:100406/1‑150 (MQ=255) gTTGGCATCGCGCGAGTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGt > 1:1823148/1‑150 (MQ=255) aTCGCGCGAGTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTTGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATat < 2:2299979/150‑2 (MQ=255) aTCGCGCGAGTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAg > 2:1349602/1‑150 (MQ=255) gcgAGTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGtt > 1:1110409/1‑133 (MQ=255) gcgAGTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGc > 1:713161/1‑150 (MQ=255) gtgTTCAGCAGACCGAACAGGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTTGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGTCTGGATAGCCAGCTCGCAGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGttc < 2:535109/148‑1 (MQ=255) gAGTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGctc < 1:1349602/150‑1 (MQ=255) gAGTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGctc > 2:1228244/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGctctc > 2:2245400/1‑150 (MQ=255) gaagAACGAACACACTGGCTACGACTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCCCTCTTCCt < 2:752306/148‑1 (MQ=255) aCCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTTGCGA‑TCGAAGTACGGTCTGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCGCGCTGGCACGCTGCCGGGCACCGTGGATGGTCGATAGCACCCTCTCTTCCtcgag > 2:1104093/1‑146 (MQ=255) aCCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTgcag > 2:367719/1‑150 (MQ=255) ccGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTgcagc > 2:1304775/1‑150 (MQ=255) cGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTc < 2:2241574/125‑1 (MQ=255) cGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTc > 1:2241574/1‑125 (MQ=255) cGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTgcagca > 2:1978516/1‑150 (MQ=255) cGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTgcagca > 1:1160218/1‑150 (MQ=255) gAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCGCGCGGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGcagcag > 1:1132543/1‑150 (MQ=255) gAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTc < 1:1811446/124‑1 (MQ=255) gAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTc > 2:1811446/1‑124 (MQ=255) aaCACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCACCGCCCAGCCACCCCTCACCCGCCTGGAACCACTGTGATCTGTCACTCTGGATGTCTTCGTTGATTGTCGATAGCATGCTCTCTTCCTGCAGCAgg < 2:276233/150‑1 (MQ=255) gTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGGGAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGtt > 1:1354415/1‑150 (MQ=255) ttGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTg < 1:1889115/90‑1 (MQ=255) ttGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTg > 2:1889115/1‑90 (MQ=255) ttGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTc > 1:1850304/1‑150 (MQ=255) gCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTg > 1:1624997/1‑150 (MQ=255) gCTACGAGTTCCTTGATCTCGCTGGCGT‑TCGCGGTGCGGCCGTCATCGCTCAGGCCCACGTTACCCGCCGGGATCGCGATCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCCTTGTAGATCGGTAGCGCGCCCTCTTCCTTGAGCAGCGCGTGCTTg > 2:1062259/1‑150 (MQ=255) cTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGc > 2:1063660/1‑142 (MQ=255) cTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGc < 1:1063660/142‑1 (MQ=255) cTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAACTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGa < 1:1152771/150‑1 (MQ=255) cTTCGATTTCCTTGATATCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGa < 2:1933191/150‑1 (MQ=255) ttCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAgg > 2:340162/1‑139 (MQ=255) ttCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAgg < 1:340162/139‑1 (MQ=255) ttCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGAc > 2:347564/1‑150 (MQ=255) ttCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGAc < 1:347564/150‑1 (MQ=255) aTTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTg < 2:1823148/150‑1 (MQ=255) aTTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTg > 2:2199208/1‑150 (MQ=255) tCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTc < 2:551134/150‑1 (MQ=255) ttGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATg > 1:1603958/1‑150 (MQ=255) tGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGt < 2:1526242/150‑1 (MQ=255) tGAGCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGt < 1:1551226/150‑1 (MQ=255) gATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGtt > 1:2360797/1‑150 (MQ=255) gctggcgatccaggcgggtaacgggggcctgagcgatgccgaccgtacctcgatcgccagcTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCt > 1:1646742‑M2/62‑150 (MQ=255) GGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATTTTTCCGCTGTa > 2:1354415‑M1/1‑150 (MQ=255) gatccaggcgggtaacgggggcctgagcgatgccgaccgtacctcgatcgccagcTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGa < 1:1196210‑M2/28‑1 (MQ=255) gatccaggcgggtaacgggggcctgagcgatgccgaccgtacctcgatcgccagcTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGa > 2:1196210‑M2/56‑83 (MQ=255) atccaggcgggtaacgggggcctgagcgatgccgaccgtacctcgatcgccagcTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGc < 2:1646742‑M2/96‑1 (MQ=255) TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCt < 2:669618‑M1/150‑1 (MQ=255) CGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTc > 1:669618‑M1/1‑150 (MQ=255) cGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCCAACAAg < 2:1603958/150‑1 (MQ=255) cGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCCAACAAg < 2:1624997/150‑1 (MQ=255) cGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACGGTTCCAACAAg < 2:713161/150‑1 (MQ=255) gTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCCAACAAGgc < 2:160780/150‑1 (MQ=255) gTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCCAACAAGgc > 1:1135024/1‑150 (MQ=255) gCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGATCCTGTTGTACTGCTCCAACAAGGCGctc < 1:2245400/150‑1 (MQ=255) cATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCcaacaa < 2:1838509/142‑1 (MQ=255) cATCGCTCAGGCCCCCGTTACACGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCCAACAAGGCGctct > 2:577687/1‑150 (MQ=255) tCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCCAACAAGGCGCTCTGt < 1:1228244/150‑1 (MQ=255) gCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAgg < 1:994776/52‑1 (MQ=255) aGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCCAACAAGGCGCTCTGTtgctgc < 2:1850304/150‑1 (MQ=255) gCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCCAACAAGGCGCTCTGTTGCTgcag > 2:91730/1‑150 (MQ=255) cGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCtt > 1:400054/1‑91 (MQ=255) cGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCtt < 2:400054/91‑1 (MQ=255) ccGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGa < 2:2112344/45‑1 (MQ=255) ccGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGa > 1:2112344/1‑45 (MQ=255) ccGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGa > 1:465253/1‑87 (MQ=255) ccGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGa < 2:465253/87‑1 (MQ=255) ccGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCcaacaa > 2:681595/1‑121 (MQ=255) ccGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCcaacaa < 1:681595/121‑1 (MQ=255) ccGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCCAACAAGGCGCTCTGTTGCTGCAGCACCAGCAGgc > 2:979559/1‑150 (MQ=255) gCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTAc > 2:1190359/1‑108 (MQ=255) ccTGGATCGCCAGCTGGCTGGCACGCTGCAGGGCATAGTTGAAGGGCGAGAGCACGCAATCTACCTGCAACCGGGCGTACGTTATCGTGGGCATGTTTTCGCTGTACTGCTCCAACAAGGCGATCTGGTGCTGCCGCTCTCGCAGgcgcg > 2:934137/1‑150 (MQ=255) ccTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCCAACAAGGCGct < 1:1389308/124‑1 (MQ=255) ccTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCCAACAAGGCGct > 2:1389308/1‑124 (MQ=255) ggATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTa < 2:728837/103‑1 (MQ=255) ggATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTa > 1:728837/1‑103 (MQ=255) gatcgccagcTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCg < 1:582667‑M2/87‑1 (MQ=255) gatcgccagcTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCg > 2:582667‑M2/11‑97 (MQ=255) tcgccagcTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCCAACAAGGCGCTCTGTTGCTGCAGCACCAGCAGGCGCGCAgcgc < 1:979559‑M2/142‑1 (MQ=255) gtgccagcGAGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGt > 2:1709441‑M2/9‑85 (MQ=255) gtgccagcGAGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCCAACAAGGCGCTCTGTtgctg > 2:93945‑M2/9‑127 (MQ=255) gtgccagcGAGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCCAACAAGGCGCTCTGTTGCTGCAGCACCAGCAGGCGCGCAgcgc > 1:1370840‑M2/9‑150 (MQ=255) gtgccagcGAGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCCAACAAGGCGCTCTGTTGCTGCAGCACCAGCAGGCGCGCAgcgc > 2:353306‑M2/9‑150 (MQ=255) gtgccagcGAGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATAGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCCAACAAGGCGCTCTGTtgctgc > 1:2007679‑M2/9‑128 (MQ=255) gccagcTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTc < 1:411818‑M2/85‑1 (MQ=255) gccagcTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTc > 2:411818‑M2/7‑91 (MQ=255) cTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCCAACAAGGCGCTCTGTTGCTGCAGCACCAGCAGGCGCGCAGCGCCGACCgg > 1:483158‑M2/2‑150 (MQ=255) tCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCCAACAAGGCGCTCTGTTGCTGCAGCACCAGCAGGCGCGCAGCGCCGACCggg > 2:2075991/1‑150 (MQ=255) | ACGACTTGGAGCCGCCAAACATGTAGTCGCCGTTGGCATCGCGCGAGTTCAGCAGACCGAACACGTTGGCTTCGATTTCCTTGATCTCGCTGGCGA‑TCGAGGTACGGTCGGCATCGCTCAGGCCCCCGTTACCCGCCTGGATCGCCAGCTCGCTGGCACGCTGCAGGGCATCGTTGATGGTCGATAGCACGCTCTCTTCCTGCAGCAGGGCGTTCTTGACCGTGGTCATGTTTCCGCTGTACTGCTCCAACAAGGCGCTCTGTTGCTGCAGCACCAGCAGGCGCGCAGCGCCGACCGGG > NC_002947/4973169‑4973467 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |