Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,974,081 | T→A | 7.5% | K523M (AAG→ATG) ‡ | flgK ← | flagellar hook‑associated protein FlgK |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,974,081 | 0 | T | A | 7.5% | 235.8 / 6.2 | 78 | K523M (AAG→ATG) ‡ | flgK | flagellar hook‑associated protein FlgK |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/34); new base A (3/3); total (41/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATCGAATCGCGAATCGACTGCTGGATCAGTGCGGT > NC_002947/4973936‑4974229 | gTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACttgtt < 2:87161/150‑1 (MQ=255) gTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACttgtt < 2:842905/150‑1 (MQ=255) tCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACttgttg > 1:752818/1‑150 (MQ=255) tCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACttgttg < 2:2111508/150‑1 (MQ=255) ggCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGTTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGTCATGGCGATGGACAACTTGTTGTc < 2:827872/150‑1 (MQ=255) ggCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACAAGTTGTc < 1:1193847/150‑1 (MQ=255) aTTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTg > 2:1674499/1‑150 (MQ=255) aTTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTg > 2:1412873/1‑150 (MQ=255) aTTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTg < 2:660771/150‑1 (MQ=255) gAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACttg > 1:1422204/1‑139 (MQ=255) gAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACttg < 2:1422204/139‑1 (MQ=255) aCGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAg < 2:390668/150‑1 (MQ=255) cGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAgg < 2:1163620/150‑1 (MQ=255) gTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTTTTGTCCTGCCCAGGCGCCACg > 2:78692/1‑150 (MQ=255) tAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCATAACTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGc > 1:1870805/1‑150 (MQ=255) tAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGc > 1:705993/1‑150 (MQ=255) aaaGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCt > 1:1547156/1‑150 (MQ=255) gCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGcc > 2:2065417/1‑150 (MQ=255) tGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTg < 2:2379642/146‑1 (MQ=255) tGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTg > 1:2379642/1‑146 (MQ=255) tGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCgg > 1:988996/1‑150 (MQ=255) ttGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCa > 2:2085438/1‑150 (MQ=255) ttGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCa > 1:1670250/1‑150 (MQ=255) cGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTg > 2:1449869/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTgg < 2:1852661/150‑1 (MQ=255) tGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCt < 2:988996/150‑1 (MQ=255) ccACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTg < 1:1399819/150‑1 (MQ=255) aCCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGc > 1:2338761/1‑150 (MQ=255) gATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTc < 1:132414/150‑1 (MQ=255) gATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGAAAGCGGGATACCGCTACCATCAAGCCTAGGGTCACCGCCCGCACCCCCAATAGGCCCAGGAACGCACAACTGGCATTCACGCCCCGGGACCAGCCTGCCGGTACCAATTTGGGTACCCATAGCGTc > 2:644246/1‑150 (MQ=255) gTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATAATGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGc < 1:262807/150‑1 (MQ=255) tctcGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCt > 2:1739538/1‑150 (MQ=255) tctcGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCt > 2:114621/1‑150 (MQ=255) 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ggTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGa < 1:2085438/150‑1 (MQ=255) ttACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTCGTCATGGGCAGGCACCACGCTGTTGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTg < 1:899635/150‑1 (MQ=255) ccGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCa > 2:257161/1‑150 (MQ=255) cGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAg > 1:1720481/1‑150 (MQ=255) cTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGc > 1:1787599/1‑120 (MQ=255) cTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGc < 2:1787599/120‑1 (MQ=255) cTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTgg > 2:639595/1‑132 (MQ=255) cTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTgg < 1:639595/132‑1 (MQ=255) tACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGt < 1:1674499/150‑1 (MQ=255) ccATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTAc > 2:799529/1‑100 (MQ=255) ccATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTAc < 1:799529/100‑1 (MQ=255) ccATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACAAGTTGTccatc < 2:1727830/66‑4 (MQ=39) ccATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACAAGTTGTccatc > 1:1727830/1‑63 (MQ=38) aTCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTAc < 1:495585/86‑1 (MQ=255) aTCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTAc > 2:495585/1‑86 (MQ=255) tCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAac > 1:724695/1‑150 (MQ=255) tCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAac > 1:21251/1‑150 (MQ=255) ccAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAAAAACCAGTTTCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAaca < 1:1171949/150‑1 (MQ=255) cAGAATCGGTGCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAacac > 2:705940/1‑150 (MQ=255) gAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGCAcccca < 2:2211172/150‑1 (MQ=255) gTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTAc < 2:21251/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTAcc < 2:1547156/150‑1 (MQ=255) cGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCCCGCTGCCGGCACTATAATGTGTACCCTTTTCGGCTAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCg < 1:1497611/150‑1 (MQ=255) ggccgCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCAt > 1:137543/1‑150 (MQ=255) gCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATcgaa < 1:705940/150‑1 (MQ=255) aTCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGTATcgaatc > 1:1278317/1‑150 (MQ=255) aTCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATcgaatc > 1:1439589/1‑150 (MQ=255) aTCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTGGTCGTCGAACAGCTTGTAGCCATGGGAGCCAACGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATcgaatc > 1:1738194/1‑150 (MQ=255) gCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGCCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCCATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATcgaatcgcgaa > 1:1123777/1‑150 (MQ=255) 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aCAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATCGAATCGCGAATCGACTGCTGGATCAGTg > 1:1127192/1‑150 (MQ=255) aaCTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCt > 1:1668686/1‑76 (MQ=255) aaCTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCt < 2:1668686/76‑1 (MQ=255) aCTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCTTACCGGCATCGAATCGCGAATCGACTGCTGGATCAGTGCgg > 2:1374036/1‑150 (MQ=255) aCTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATCGAATCGCGAATCGACTGCTGGATCAGTGCgg < 2:724695/150‑1 (MQ=255) cTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATCGAATCGCGAATCGACTGCTGGATCAGTGCGgt > 2:29047/1‑150 (MQ=255) | GTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATCGAATCGCGAATCGACTGCTGGATCAGTGCGGT > NC_002947/4973936‑4974229 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |