| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,026,800 | A→T | 6.7% | D21V (GAC→GTC) | ocd → | ornithine cyclodeaminase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,026,800 | 0 | A | T | 6.7% | 277.2 / 8.9 | 89 | D21V (GAC→GTC) | ocd | ornithine cyclodeaminase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (40/43); new base T (2/4); total (42/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.80e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.60e-01 | |||||||||||
GTGGGAATGTCGACATGGCTCAACACCAACGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTGGACGTCAAAACCGCTTACCTGCCAGACCTTGAGAATTTCGCTATCA > NC_002947/5026651‑5026949 | gTGGGAATGTCGACATGGCTCAACACCAACGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCTTATCGCTGGATacaga < 2:102066/150‑1 (MQ=255)gTGGGAATGTCGACATGGCTCAACACCAACGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATacaga > 2:504335/1‑150 (MQ=255) tGGGAATGTCGACATGGCTCAACACCAACGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATacagac > 2:313952/1‑150 (MQ=255) tCGACATGGCTCAACACCAACGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGa < 2:782637/150‑1 (MQ=255) tCGACATGGCTCAACACCAACGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGa < 1:850627/150‑1 (MQ=255) cGACATGGCTCAACACCAACGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTAAGTGCGTAACGCTCGATACTGTCTGTATCGag < 1:1770418/150‑2 (MQ=255) gACATGGCTCAACACCAACGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCCTGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACTGTCTGTATCGagc < 2:466334/150‑3 (MQ=255) gACATGGCTCAACACCAACGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCCTGAACTGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATg > 1:1833705/1‑150 (MQ=255) aCATGGCTCAACACCAACGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACTGTCTGTATCGa > 2:442247/1‑147 (MQ=255) aCATGGCTCAACACCAACGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACTGTCTGTATCGa < 1:442247/147‑1 (MQ=255) aCATGGCTCAACACCAACGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGt > 2:1216503/1‑150 (MQ=255) aTGGCTCAACACCAACGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAg < 1:2349034/150‑1 (MQ=255) ggCTCAACACCAACGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAACACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTg > 2:1073045/1‑150 (MQ=255) gCTCAACACCAACGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTgg < 1:711712/150‑1 (MQ=255) aaCACCAACGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGaaaa < 1:504335/150‑1 (MQ=255) acCAACGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACTGTCTGTATCGa < 1:90394/135‑1 (MQ=255) acCAACGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACTGTCTGTATCGa > 2:90394/1‑135 (MQ=255) cAACGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCAt > 2:617286/1‑150 (MQ=255) aCGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATAAGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGCTGTACTGGTTAACTCAttt < 2:703315/150‑1 (MQ=255) catcatCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCa > 1:1664237/1‑150 (MQ=255) tcCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAACACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCt < 1:1073045/150‑1 (MQ=255) ccTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTg < 1:236167/150‑1 (MQ=255) tGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGc < 1:1216503/150‑1 (MQ=255) aGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCaga < 1:2145521/150‑1 (MQ=255) gCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCagag < 1:313952/150‑1 (MQ=255) gCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCagag < 2:2058041/150‑1 (MQ=255) tgtgCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTAt > 2:1606887/1‑110 (MQ=255) tgtgCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTAt < 1:1606887/110‑1 (MQ=255) tgtgCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTCAGCGAAGT‑CCTCACGCTAACCCAACACGACATTCTTCCGTTCTTAACGGTGGACACGGACAGTATCGTGGTAGTGTAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGc < 2:274907/150‑1 (MQ=255) gACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTgg > 1:2075877/1‑150 (MQ=255) ccgccgCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTc < 2:801935/150‑1 (MQ=255) cagccgccCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGAAAAGTGGTc > 2:2337981/3‑150 (MQ=255) gccgccCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGt < 1:113598/144‑1 (MQ=255) gccgccCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGt > 2:113598/1‑144 (MQ=255) gccCCGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCCTGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGcc > 2:2220216/1‑150 (MQ=255) ccAGCACGTGCTTAAAGATGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAAAGCGAGATCCGTGAGTGCGCAACGCGCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGt > 1:1499198/1‑150 (MQ=255) ccAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTGACGCGCGATacaga > 1:2098120/1‑88 (MQ=255) ccAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATacaga < 2:2098120/88‑1 (MQ=255) gCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAGCGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCaa > 2:596051/1‑150 (MQ=255) gTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAAtcct > 2:112338/1‑150 (MQ=255) gTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAAtcct > 2:1013120/1‑150 (MQ=255) gCTTAAAGAGGTGCCATGTAAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAAAGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAAtactcc > 2:495151/1‑150 (MQ=255) gCTTAAAGAGGTGCAATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCACCGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAAtcctcc < 1:951607/150‑1 (MQ=255) cTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCg < 1:617286/150‑1 (MQ=255) ttAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATATTGACAGTATCGATGTAGTGGGAAACCCATTTGCATCGCTGGCCAGACGCACAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCgg > 2:1389823/1‑150 (MQ=255) ttAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCgg < 1:112338/150‑1 (MQ=255) tAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAAACAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGt > 1:440850/1‑150 (MQ=255) aaGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTa > 1:2067544/1‑150 (MQ=255) aaGAGGTGCCATGTGA‑CCAAGTGTTTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTa < 1:1328582/150‑1 (MQ=255) ccATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCaa > 1:1974836/1‑131 (MQ=255) ccATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCaa < 2:1974836/131‑1 (MQ=255) tgtgAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGa < 2:1664237/150‑1 (MQ=255) tgtgAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGa > 1:524864/1‑150 (MQ=255) tgtgAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAAACAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGa < 2:440850/150‑1 (MQ=255) gtgAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCaga < 1:1122437/105‑1 (MQ=255) gtgAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCaga > 2:1122437/1‑105 (MQ=255) tgAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGc > 2:315221/1‑150 (MQ=255) gCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCg > 1:1909792/1‑130 (MQ=255) gCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCg < 2:1909792/130‑1 (MQ=255) cGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACaa < 2:1499198/150‑1 (MQ=255) gT‑CCTTCTTCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGt > 2:1047241/1‑115 (MQ=255) gT‑CCTTCTTCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGt < 1:1047241/115‑1 (MQ=255) t‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGtt < 2:835236/127‑1 (MQ=255) t‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGtt > 1:835236/1‑127 (MQ=255) t‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGa < 1:734339/130‑1 (MQ=255) t‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGa > 2:734339/1‑130 (MQ=255) cTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTg < 2:524864/150‑1 (MQ=255) tGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTACGAGCACAATGGCGAGGTgg > 2:1097213/1‑150 (MQ=255) gCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTGGa < 2:1277340/150‑1 (MQ=255) cTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTa < 2:206520/120‑1 (MQ=255) cTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTa > 1:206520/1‑120 (MQ=255) cTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTGGAc < 2:2067544/150‑1 (MQ=255) cTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTGGAc < 1:596051/150‑1 (MQ=255) ccAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAg > 1:109339/1‑89 (MQ=255) ccAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAg < 2:109339/89‑1 (MQ=255) cAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTGGACGTCaaa > 2:816877/1‑150 (MQ=255) cAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTGGACGTCaaa > 2:1349386/1‑150 (MQ=255) aaCGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTGGACGTCaaaa > 1:1579918/1‑150 (MQ=255) gAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTGGACGTCAAAACCGCt < 1:1013120/150‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGTAACGGTCAAGACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCGTTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTGGACGTCAAAACCGATTACCTGc > 1:695122/1‑150 (MQ=255) gTGAGTGCATAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTGGACGTCAAAACCGCTTACCTGc < 1:816877/150‑1 (MQ=255) aGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGt > 2:1486977/1‑84 (MQ=255) aGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGt < 1:1486977/84‑1 (MQ=255) gTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTGGACGTCAAAACCGCTTACCTGCCAGACCtt > 2:1818040/1‑150 (MQ=255) gTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTGGACGTCAAAACCGCTTACCTGCCAGACCtt > 2:1608634/1‑150 (MQ=255) gTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCAAACTTGCGAGGTGGACGTCAAAACCGCTTACCTGCCAGACCtt > 1:634691/1‑150 (MQ=255) aaCGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTGGACGTCAAAACCGCTTACCTGCCAGACCTTga < 1:1349386/150‑1 (MQ=255) tCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCaa < 2:1840567/75‑1 (MQ=255) tCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCaa > 1:1840567/1‑75 (MQ=255) tCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGCTCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTGGACGTCAAAACCGCTTACCTGCCAGACCTTGAGAAtt > 1:658982/1‑150 (MQ=255) gctACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGCCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTGGACGTCAACAAGGCGTACCTGCCAGACCACGGGAATTTc > 1:506680/3‑150 (MQ=255) gATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTGGACGTCAAAACCGCTTACCTGCCAGACCTTGAGAATTTc < 2:1579918/150‑1 (MQ=255) aTACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTGGACGTCAAAACCGCTTACCTGCCAGACCTTGAGAATTTCg < 2:2075877/150‑1 (MQ=255) aTACACACAGTACCGATGTAGTGGAAAACGCATTTCCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGCTCATGTCGCCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTGCACGTCAAAACCGCTTACATGCCAGACCTAGAGACTTTCg < 2:506680/150‑1 (MQ=255) acagTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTGGACGTCAAAACCGCTTACCTGCCAGACCTTGAGAATTTCGCTATCa > 1:1194060/1‑150 (MQ=255) | GTGGGAATGTCGACATGGCTCAACACCAACGCATCATCCTGGAAGCTGTGCGCGACCGCCGCCCAGCACGTGCTTAAAGAGGTGCCATGTGAGCGAAGT‑CCTTCTGCTTAACCAACGCGAAATCCGTGAGTGCGTAACGCTCGATACAGACAGTATCGATGTAGTGGAAAACGCATTTGCATCGCTGGCCAGAGGCAAAGTGGTCATGCCGTCAATCCTCCGGTTAGACATCTCCGAGCACAATGGCGAGGTGGACGTCAAAACCGCTTACCTGCCAGACCTTGAGAATTTCGCTATCA > NC_002947/5026651‑5026949 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |