Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 5,115,751 | T→G | 5.6% | H28P (CAC→CCC) | PP_4500 ← | TrpH family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,115,751 | 0 | T | G | 5.6% | 381.2 / 8.9 | 124 | H28P (CAC→CCC) | PP_4500 | TrpH family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (65/52); new base G (4/3); total (69/55) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
AACCCAGCACATGGATGGTCGCGCCGCCCCACGTGCAGGACAGCTCCACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATAGAGGAGCGCTTTCGCTGGATTCGATGTTTGTTATTATGCCGTCACATCCCGATTCTGGCTGCCATT > NC_002947/5115602‑5115900 | aaCCCAGCACATGGATGGTCGCGCCGCCCCACGTGCAGGACAGCTCCACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGt < 2:1638018/150‑1 (MQ=255) ccAGCACATGGATGGTCGCGCCGCCCCACGTGCAGGACAGCTCCACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCt > 2:1876322/1‑150 (MQ=255) gCACATGGATGGTCGCGCCGCCCCACGTGCAGGACAGCTCCACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCAt < 2:740273/150‑1 (MQ=255) atggTCGCGCCGCCCCACGTGCAGGACAGCTCCACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCgg < 1:1517503/150‑1 (MQ=255) atggTCGCGCCGCCCCACGTGCAGGACAGCTCCACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCAACTCCAGTAAGCCTTCTAGGGTTGCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCgg > 1:1853109/1‑150 (MQ=255) tggTCGCGCCGCCCCACGTGCAGGACAGCTCCACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGGGCTCATGAGCACggg < 1:160179/150‑1 (MQ=255) tggTCGCGCCGCCCCACGTGCAGGACAGCTCCACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCGGGTTGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCCGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCggg > 1:419357/1‑150 (MQ=255) tCGCGCCGCCCCACGTGCAGGACAGCTCCACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCaa > 2:1621994/1‑150 (MQ=255) cgccgcCCCACGTGCAGGACAGCTCCACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGGGCTCATGAGCACggggtgcaa < 2:230513/150‑7 (MQ=255) ccACGTGCAGGACAGCTCCACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAAc < 2:597049/141‑1 (MQ=255) ccACGTGCAGGACAGCTCCACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAAc > 1:597049/1‑141 (MQ=255) aGGACAGCTCCACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACa > 2:1669549/1‑150 (MQ=255) ggACAGCTCCACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAg < 1:2014350/150‑1 (MQ=255) cAGCTCCACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGgc < 2:714588/150‑1 (MQ=255) cAGCTCCACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGgc > 1:714588/1‑150 (MQ=255) aGCTCCACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGAc < 2:591181/144‑1 (MQ=255) cTCCACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGTAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGcc > 2:230974/1‑150 (MQ=255) tCCACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCg > 2:198929/1‑150 (MQ=255) cACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGCAAGAGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTc > 1:151943/1‑150 (MQ=255) cACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGCTAAGTTACAACCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGCGACTGCGGCGCTAGTACCGGAGGGGACAGGGCGCCGTc > 1:419746/1‑150 (MQ=255) aCCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCg > 1:1506624/1‑150 (MQ=255) aCCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCg < 1:2150979/150‑1 (MQ=255) ccccGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGa > 1:102086/1‑136 (MQ=255) cccGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCa < 2:773835/106‑1 (MQ=255) cccGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGa > 1:289744/1‑150 (MQ=255) cccGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGa > 1:829260/1‑150 (MQ=255) cccGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGa > 1:2083926/1‑150 (MQ=255) ccGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAg < 1:27710/150‑1 (MQ=255) tGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCAt > 2:1603999/1‑102 (MQ=255) tGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCAt < 1:1603999/102‑1 (MQ=255) acctaGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAAc < 2:235530/109‑1 (MQ=255) ccAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTTCACCCCGGGCTCATGAGCACggggt > 2:1481646/1‑107 (MQ=255) cAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTTTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGGCAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCtg > 1:1036023/1‑150 (MQ=255) cAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACa > 2:516578/1‑127 (MQ=255) cAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACa < 1:516578/127‑1 (MQ=255) cAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGATTCGGGCAGGCTTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCATTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCtg > 1:1253607/1‑150 (MQ=255) aGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCtgt > 1:916140/1‑150 (MQ=255) aTACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAg > 1:1471103/1‑150 (MQ=255) tACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGt < 2:1853109/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAAc < 1:2219781/100‑1 (MQ=255) ccAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAAc > 2:2219781/1‑100 (MQ=255) ccAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAg < 2:1068857/111‑1 (MQ=255) ccAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAg > 1:1068857/1‑111 (MQ=255) ccAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGa > 1:1303854/1‑130 (MQ=255) ccAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGa < 2:1303854/130‑1 (MQ=255) ccAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCa > 2:503238/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCa > 2:1258241/1‑150 (MQ=255) ggTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGAt < 2:1471103/150‑1 (MQ=255) gTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATc > 2:1819491/1‑150 (MQ=255) gTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATc > 1:1274135/1‑150 (MQ=255) cAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCaa > 2:866759/1‑150 (MQ=255) aaCGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAAc < 2:419357/150‑1 (MQ=255) aaCGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAAc > 2:1281585/1‑150 (MQ=255) 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ggTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATAGAGGAGCGCTTTCGCTGGATTCGAtgttt < 1:2235987/150‑1 (MQ=255) ggTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATAGAGGAGCGCTTTCGCTGGATTCGAtgttt < 1:909486/150‑1 (MQ=255) tgtCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTCGACGTTAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATAGAGGAGCGCTTTCGCTGGATTCGAtgtttgt < 1:126340/150‑1 (MQ=255) cATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATAGAGGAGCGCTTTCGCTGGATTCGATGTTTGttat > 1:245109/1‑150 (MQ=255) aTGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGt < 2:2391073/98‑1 (MQ=255) aTGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGt > 1:2391073/1‑98 (MQ=255) tGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATAGAGGAGCGCTTTCGCTGGATTCGATGTTTGttatta < 1:527687/150‑1 (MQ=255) tGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATAGAGGAGCGCTTTCGCTGGATTCGATGTTTGttatta < 1:233996/150‑1 (MQ=255) tcggtcAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATAGAGTAGCGCTTTCGCTGGATTCGATGTTTGTTATTATGc < 2:2082403/150‑1 (MQ=255) tcggtcAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATAGAGGAGCGCTTTCGCTGGATTCGATGTTTGTTATTATGc > 2:326614/1‑150 (MQ=255) tcAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATAGAGGAGCGCTTTCGCTGGATTCGATGTTTGTTATTATGCCGTc > 1:1005847/1‑150 (MQ=255) tcAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATAGAGGAGCGCTTTCGCTGGATTCGATGTTTGTTATTATGCCGTc > 1:1845931/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGc > 1:1849688/1‑75 (MQ=255) ccAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGc < 2:1849688/75‑1 (MQ=255) ccAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAAc > 1:391580/1‑94 (MQ=255) ccAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAAc < 2:391580/94‑1 (MQ=255) cAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATAGAGGAGCGCTTTCGCTGGATTCGATGTTTGTTATTATGCCGTCACATccc > 1:2255354/1‑150 (MQ=255) aGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTg > 1:1837658/1‑72 (MQ=255) aGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTg < 2:1837658/72‑1 (MQ=255) gcgcTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATaga < 2:626311/100‑1 (MQ=255) gcgcTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATaga > 1:626311/1‑100 (MQ=255) tGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATAGAGGAGCGCTTTCGCTGGATTCGATGTTTGTTATTATGCCGTCACATCCCGATTCTg < 1:503238/150‑1 (MQ=255) gCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATAGAGGAGCGCTTTCGCTGGATTCGATGTTTGTTATTATGCCGTCACATCCCGATTCTgg < 2:419746/150‑1 (MQ=255) cACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATAGAGGAGCGCTTTCGCTGGATTCGATGTTTGTTATTATGCCGTCACATCCCGATTCTGGc > 2:896565/1‑150 (MQ=255) aCCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAATCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATAGAGGAGCGCTTTCGCTGGATTCGATGGTTGTTATTATGCCGTCACATCCCGATTCTGGCt > 1:352868/1‑150 (MQ=255) aCCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGTAGATCAACATTCATAGAGGAGCGCTTTCGCTGGATTCGATGTTTGTTATTATGCCGTCACATCCCGATTCTGGCt < 1:792426/150‑1 (MQ=255) aCCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATAGAGGAGCGCTTTCGCTGGATTCGATGTTTGTTATTATGCCGTCACATCCCGATTCTGGCt < 1:2241807/150‑1 (MQ=255) cccGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATAGAGGAGCGCTTTCGCTGGATTCGATGTTTGTTATTATGCCGTCACATCCCGATTCTGGCTGc > 2:2110572/1‑150 (MQ=255) ccGGGCTCATGAGCACGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCtgt > 1:1596255/1‑64 (MQ=39) ccGGGCTCATGAGCACGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATAGAGGAGCGCTTTCGCTGGATTCGATGTTTGTTATTATGCCGTca > 2:1405021/1‑131 (MQ=255) | AACCCAGCACATGGATGGTCGCGCCGCCCCACGTGCAGGACAGCTCCACCCCGCTGACCCAGCGCATACCCAGGTCAACGCAGGCCTGGCGCGCTTCGGGCAGGCCTTCGAGGGTGTCATGGTCGGTCAGTGCCAGCGCTTGCACCCCGTGCTCATGAGCCCGGGCAACCAGTACCGAAGGCGACAGGGCGCCGTCGGAGGCCGTGCTGTGACAGTGCAGATCAACATTCATAGAGGAGCGCTTTCGCTGGATTCGATGTTTGTTATTATGCCGTCACATCCCGATTCTGGCTGCCATT > NC_002947/5115602‑5115900 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |