| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_002947 | 5,121,321 | G→A | 8.9% | V306M (GTG→ATG) | trkH‑II → | potassium transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,121,321 | 0 | G | A | 8.9% | 286.7 / 11.9 | 100 | V306M (GTG→ATG) | trkH‑II | potassium transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (46/45); new base A (4/5); total (50/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTCGTTGGCGGCTGCTCCGGCTCGACCGCAGGCGGCATCAAGATT > NC_002947/5121173‑5121467 | cGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCAtgt > 2:2028335/1‑150 (MQ=255) cACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCt < 1:1072591/150‑1 (MQ=255) cACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCt < 1:2272570/150‑1 (MQ=255) cccTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGa > 1:1989619/1‑150 (MQ=255) cccTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGAAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCACATGgcgcagg < 2:273237/150‑4 (MQ=255) ccTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCACATGgcgcaggg < 2:197479/150‑5 (MQ=255) cTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAAc < 1:939353/150‑1 (MQ=255) cgGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGAc < 1:1762611/150‑1 (MQ=255) aaCCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGTACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCg < 1:913232/150‑1 (MQ=255) aCCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCgg < 1:850386/150‑1 (MQ=255) cGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCggtg < 1:624102/150‑1 (MQ=255) cGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCggtg < 1:584940/150‑1 (MQ=255) tGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTcaccacca > 1:1485205/1‑150 (MQ=255) tCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCggtg > 2:1553879/1‑137 (MQ=255) tCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCggtg < 1:1553879/137‑1 (MQ=255) tCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCg > 1:352918/1‑150 (MQ=255) gcgACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCggt > 1:867186/1‑133 (MQ=255) gcgACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCggt < 2:867186/133‑1 (MQ=255) gACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTtc < 2:718588/150‑1 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tGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATg < 1:2362379/110‑1 (MQ=255) tGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATg > 2:2362379/1‑110 (MQ=255) gCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTCGTTGGCGGCTGCTCCGGCTc > 1:1537527/1‑150 (MQ=255) aCTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTCGTTGGCGGCTGCTCCGGCTCGa < 2:371269/150‑1 (MQ=255) cTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTCGTTGGCGGCTGCTCCGGCTCGAc < 1:2174095/150‑1 (MQ=255) gATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTaa > 2:1840630/1‑86 (MQ=255) gATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTaa < 1:1840630/86‑1 (MQ=255) gATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTCGTTGGCGGCTGCTCCGGCTCGACCGCAggc > 1:1381576/1‑150 (MQ=255) acgttcagcgcCACATGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTCGTTGGCGGCTGCTCCGGCTCGACCGCAggcg > 2:826553/8‑150 (MQ=255) cccTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTCGTTGGCGGCTGCTCCGGCTCGACCGCAg < 1:1101774/144‑1 (MQ=255) cccTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTCGTTGGCGGCTGCTCCGGCTCGACCGCAg > 2:1101774/1‑144 (MQ=255) cTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCTGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTCGTTGGCGGCTGCTCCGGCTCGACCGCAGGCGGCATc < 2:1485205/150‑1 (MQ=255) cTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTCGTTGGCGGCTGCTCCGGCTCGACCGCAGGCGGCATc > 2:1527261/1‑150 (MQ=255) gcCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTCGTTGGCGGCTGCTCCGGCTCGACCGCAGGCGGCATCAAGa < 2:1381576/150‑1 (MQ=255) cATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTCGTTGGCGGCTGCTCCGGCTCGACCGCAGGCGGCATCAAGAtt > 1:576602/1‑150 (MQ=255) | CGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTCGTTGGCGGCTGCTCCGGCTCGACCGCAGGCGGCATCAAGATT > NC_002947/5121173‑5121467 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |