| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,183,051 | A→T | 5.4% | I244N (ATC→AAC) | PP_4563 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,183,051 | 0 | A | T | 5.4% | 313.1 / 4.1 | 100 | I244N (ATC→AAC) | PP_4563 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (46/48); new base T (2/4); total (48/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GCGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCTTGCCGTCCTGGCGCACTTCCTT > NC_002947/5182902‑5183199 | gCGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGGCCTTGCTGACGTTGAACTTCTTGCTGa < 2:1297223/150‑1 (MQ=255) cGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGAt < 2:1361990/150‑1 (MQ=255) cGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGAt < 1:2231700/150‑1 (MQ=255) cagcTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAAc < 1:2370253/150‑1 (MQ=255) cTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAAAGCAGGGTc > 2:1692794/1‑150 (MQ=255) ttCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGATCAGCAAGCTGTTCAAc < 1:932282/141‑1 (MQ=255) ttCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGATCAGCAAGCTGTTCAAc > 2:932282/1‑141 (MQ=255) ttCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCa < 2:784777/150‑1 (MQ=255) cGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGATCAGCAAGCTGTTCAACgtca < 1:1093302/142‑4 (MQ=255) cGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGATCAGCAAGCTGTTCAACgtca > 2:1093302/1‑139 (MQ=255) cGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCActc > 1:692255/1‑150 (MQ=255) cTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTc < 1:871846/150‑1 (MQ=255) cTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTc < 1:1205085/150‑1 (MQ=255) cTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTc < 2:1496269/150‑1 (MQ=255) cAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAg > 2:924664/1‑130 (MQ=255) cAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAg < 1:924664/130‑1 (MQ=255) aaGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATc > 1:725394/1‑116 (MQ=255) aaGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATc < 2:725394/116‑1 (MQ=255) gCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACAccc > 2:2137896/1‑150 (MQ=255) gCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCg > 1:1775449/1‑150 (MQ=255) tttCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGc > 1:863716/1‑150 (MQ=255) tttCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGc > 1:462435/1‑150 (MQ=255) tGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCActct < 2:493910/111‑1 (MQ=255) tGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCActct > 1:493910/1‑111 (MQ=255) tgATCTTCATCCATGACGATCGGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGgcgc < 1:220689/149‑1 (MQ=255) tgATCGTCATCCATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGgcgc > 1:259077/2‑150 (MQ=255) gATCGTCATCCATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGgcgcg > 2:821919/1‑150 (MQ=255) aTCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGgcgcgc < 1:301545/150‑1 (MQ=255) aTCGTCATCCATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGgcgcgc > 1:159020/1‑150 (MQ=255) aTCGTCATCCATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGgcgcgc > 2:2160492/1‑150 (MQ=255) gTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCAt < 2:1078683/150‑1 (MQ=255) tCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCAct < 2:880781/101‑1 (MQ=255) tCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCAct > 1:880781/1‑101 (MQ=255) atccaTGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGAt < 1:821919/146‑1 (MQ=255) ggATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCt > 1:217967/1‑150 (MQ=255) gATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGGACAGCTTGCTGTTCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTg < 1:171787/150‑1 (MQ=255) aTGACGATCAGGCCCTGCTTTAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCaa > 1:1444271/1‑113 (MQ=255) aTGACGATCAGGCCCTGCTTTAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCaa < 2:1444271/113‑1 (MQ=255) cGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAAAGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCtt < 1:1692794/150‑1 (MQ=255) gATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTg < 2:222016/150‑1 (MQ=255) aGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAgg < 2:1775449/150‑1 (MQ=255) aGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAgg < 1:778842/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGgt > 1:906560/1‑150 (MQ=255) gCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGgt > 1:401366/1‑150 (MQ=255) ccTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGgtgt > 1:1099575/1‑150 (MQ=255) tGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTcc > 2:741462/1‑150 (MQ=255) ttGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCAGGGATCGGAGCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGcc > 1:150585/1‑150 (MQ=255) tGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTc > 1:2064103/1‑82 (MQ=255) tGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTc < 2:2064103/82‑1 (MQ=255) gAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAg > 1:185498/1‑114 (MQ=255) gAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAg < 2:185498/114‑1 (MQ=255) aacaacCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTTCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGCCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAgg > 1:901842/1‑150 (MQ=255) aacaacCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAgg > 2:1100681/1‑150 (MQ=255) acaacCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAggg > 2:477756/1‑150 (MQ=255) caacCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCa < 1:1695345/146‑1 (MQ=255) caacCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCa > 2:1695345/1‑146 (MQ=255) aacCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCa > 1:973918/1‑145 (MQ=255) aacCCGACAATGGACTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGggcg > 2:150419/1‑150 (MQ=255) cccGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGggcggc < 2:462435/150‑1 (MQ=255) ccGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTGCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGgcggcg > 1:2297230/1‑150 (MQ=255) cGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGgcgc > 1:2252549/1‑150 (MQ=255) cAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTa < 1:2137896/150‑1 (MQ=255) aTGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACA‑CCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCg > 1:2359983/1‑150 (MQ=255) gCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATc < 1:2052593/111‑1 (MQ=255) gCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATc > 2:2052593/1‑111 (MQ=255) gCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGc < 2:863716/150‑1 (MQ=255) gCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGc < 2:217967/150‑1 (MQ=255) gCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGGTTAACTGCGTGCTGATCAGCGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGc > 2:1726969/1‑150 (MQ=255) ccTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGgcggcg < 1:609707/140‑1 (MQ=255) ccTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGgcggcg > 2:609707/1‑140 (MQ=255) cttcttGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCgg < 2:618393/147‑1 (MQ=255) cttcttGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCgg > 1:618393/1‑147 (MQ=255) cttcttGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTg > 1:793675/1‑150 (MQ=255) tcttGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCa < 1:625657/150‑1 (MQ=255) tcttGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCa < 2:2297230/150‑1 (MQ=255) ttGACGTTGTGCTTGCTGATGTTGCACACCTTGCTGTTTAACGTAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACTCCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAgg < 2:1125032/150‑1 (MQ=255) aGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCa < 2:1099575/150‑1 (MQ=255) aGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCa < 2:692255/150‑1 (MQ=255) ttGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGt < 1:2160492/150‑1 (MQ=255) ttGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGt < 2:259077/150‑1 (MQ=255) ttGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGt < 2:610235/150‑1 (MQ=255) gCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCa < 2:1124385/119‑1 (MQ=255) gCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCa > 1:1124385/1‑119 (MQ=255) ccTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGAGACATGATCGGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGaaa > 2:2131897/1‑150 (MQ=255) cTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAAt > 2:1886444/1‑150 (MQ=255) gCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGAAAACCTGCTGCAGGCTCAGTGAAATCtt < 1:2131897/150‑1 (MQ=255) tGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCTTGc > 2:1973126/1‑150 (MQ=255) gACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAgg < 2:2179554/100‑1 (MQ=255) gACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAgg > 1:2179554/1‑100 (MQ=255) gACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCTTGcc < 2:906560/150‑1 (MQ=255) gAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACCCTCGCCCAACAACAACGGCACATGAGCTTCGGCTTCCAGGGGCGTCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCGCAGTGAAATCTTGCCGTCCTg > 1:420848/1‑150 (MQ=255) aaCAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACA‑CCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCTTGCCGTCCTGgc < 2:2359983/150‑1 (MQ=255) cTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCtt < 1:437390/135‑1 (MQ=255) cTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCtt > 2:437390/1‑135 (MQ=255) gCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCTACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGa > 1:191830/1‑71 (MQ=255) gCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGa < 2:191830/71‑1 (MQ=255) tGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCTTGCCGTCCTGGCGCACTTCCt < 1:1837681/150‑1 (MQ=255) gATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCTTGCCGTCCTGGCGCACTTCCtt < 1:741462/150‑1 (MQ=255) aTCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGt > 2:2468/1‑120 (MQ=255) aTCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGt < 1:2468/120‑1 (MQ=255) | GCGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCTTGCCGTCCTGGCGCACTTCCTT > NC_002947/5182902‑5183199 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |