Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,184,175 | G→T | 9.0% | Q88H (CAG→CAT) | PP_4564 → | lipoprotein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,184,175 | 0 | G | T | 9.0% | 372.0 / 15.0 | 122 | Q88H (CAG→CAT) | PP_4564 | lipoprotein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (56/55); new base T (5/6); total (61/61) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
GCTGAGCGACTACCTGGACATGAACCGCGAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAACTGCTGCGCGGCATGAGCGACAACCAGGTAGCGCAGATGCGTGAGGCCTTCCGCGAAGA > NC_002947/5184028‑5184324 | tGAGCGACTACCTGGACATGAACCGCGAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTTGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCa > 2:814688/1‑150 (MQ=255) tGAGCGACTACCTGGACATGAACCGCGAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAg < 1:626691/146‑1 (MQ=255) tGAGCGACTACCTGGACATGAACCGCGAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAg > 2:626691/1‑146 (MQ=255) tGAGCGACTACCTGGACATGAACCGCGAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCa > 1:186945/1‑150 (MQ=255) aGCGACTACCTGGACATGAACCGCGAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCAcc < 1:1671673/150‑1 (MQ=255) gCGACTACCTGGACATGAACCGCGAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCg > 1:315049/1‑150 (MQ=255) gACTACCTGGACATGAACCGCGAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGAc > 1:2160799/1‑150 (MQ=255) gACTACCTGGACATGAACCGCGAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGAc < 1:1040989/150‑1 (MQ=255) cTGGACATGAACCGCGAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACGGGCTACGTGACATGGTCGCCGCCGACCAGGTCACCGagattgga > 2:1271993/1‑143 (MQ=255) cTGGACATGAACCGCGAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGcc > 2:28287/1‑150 (MQ=255) ggACATGAACCGCGAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCt < 2:716167/150‑1 (MQ=255) gACATGAACCGCGAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGTCGGCGACCATGt < 1:154346/134‑1 (MQ=255) gACATGAACCGCGAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGTCGGCGACCATGt > 2:154346/1‑134 (MQ=255) gAACCGCGAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAg > 1:51260/1‑139 (MQ=255) gAACCGCGAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAg < 2:51260/139‑1 (MQ=255) aCCGCGAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCaaa < 2:2382043/150‑1 (MQ=255) cgcgAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGCCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGc > 1:556770/1‑150 (MQ=255) gcgAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAgg < 1:1162896/123‑1 (MQ=255) gcgAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAgg > 2:1162896/1‑123 (MQ=255) gcgAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCa > 2:743193/1‑150 (MQ=255) gcgAGCAAAGGGCGATGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCa > 2:566089/1‑150 (MQ=255) cAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCcgc < 2:659676/150‑1 (MQ=255) aaaGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACCTGGTCGTCGGCGACCATGt < 2:706640/118‑1 (MQ=255) aaaGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGACGACGACCAGGAAACCGACCAGTCCCTACAACAAAGCACCcgcg > 1:1134706/1‑150 (MQ=255) aGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTACAGGTAAGCACCCGCGAg < 2:1909139/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGa < 1:328506/146‑1 (MQ=255) gcgcTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACAGGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGa > 2:328506/1‑146 (MQ=255) gctgGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGa < 1:1790989/150‑1 (MQ=255) ctgGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGTTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAg < 2:1533140/150‑1 (MQ=255) ctgGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAg > 2:205982/1‑150 (MQ=255) gatgatCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACCTGGTCGTCGGCGACCATGt < 2:506053/104‑1 (MQ=255) gatgatCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAg > 2:2033428/1‑147 (MQ=255) tgatCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAAt < 1:1056293/150‑1 (MQ=255) tgatCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAAt < 1:28287/150‑1 (MQ=255) tgatCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCGCGACCGGCTGCGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCCGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAAt < 1:571470/150‑1 (MQ=255) ggTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTc < 1:1916163/150‑1 (MQ=255) gTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCg > 1:1385659/1‑150 (MQ=255) ttGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGa > 1:369968/1‑150 (MQ=255) gcgAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTgg > 2:2367092/1‑150 (MQ=255) gcgAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTgg > 2:1560806/1‑150 (MQ=255) gAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGcc > 2:2175803/1‑150 (MQ=255) gCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGa < 2:1802028/150‑1 (MQ=255) gCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGa < 2:315049/150‑1 (MQ=255) gCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGa < 1:205982/150‑1 (MQ=255) ctggcctggcATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACAGACCAGGCCCTGCAGCaaa > 1:1346668/1‑106 (MQ=255) ctggcctggcATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACAGACCAGGCCCTGCAGCaaa < 2:1346668/106‑1 (MQ=255) tggcctggcATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGaaa < 1:232924/150‑1 (MQ=255) cctggcATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCa < 2:1781918/150‑1 (MQ=255) tggcATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATGAcc > 2:1624364/1‑150 (MQ=255) aTTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCaaa < 1:2152291/96‑1 (MQ=255) aTTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTAGCCGAGGAAATCACCCCtt > 2:1577596/1‑150 (MQ=255) tGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCg < 1:743193/150‑1 (MQ=255) gCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACCTGGTCGTCGGCGACCATGTCAc < 2:1334214/73‑1 (MQ=25) gCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACCTGGTCGTCGGCGACCATGTCAc > 1:1334214/1‑73 (MQ=37) gCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCgg > 2:815296/1‑150 (MQ=255) aaGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCATGTCCGTCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGcc > 1:2372278/1‑150 (MQ=255) gACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCgg < 2:1445561/146‑1 (MQ=255) gACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCgg > 1:1445561/1‑146 (MQ=255) gACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCAc > 1:472766/1‑150 (MQ=255) tCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGcc < 1:2051701/124‑1 (MQ=255) tCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGcc > 2:2051701/1‑124 (MQ=255) tCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGa > 2:1756007/1‑150 (MQ=255) cAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGaa < 2:2239431/150‑1 (MQ=255) aCTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAAct > 2:1668325/1‑150 (MQ=255) ccGGCTACGTCGACTGTCTTGACTGTCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTAACCGACCAGGCCCTTCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAActgctgt < 2:57393/150‑2 (MQ=255) ccGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAACtgctgc > 2:2336857/1‑150 (MQ=255) ccGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGCGACGCAATTGGTCGATTTGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAACtgctgc > 2:1771125/1‑150 (MQ=255) cGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTGGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAACTCACCCCTTCGGCCACCGAACTGCTgcg > 2:865668/1‑150 (MQ=255) gCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAACTGCTGcgcg < 2:369968/150‑1 (MQ=255) aCCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAACTGCTGCGCGGCa < 2:1385659/150‑1 (MQ=255) gCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCcgc < 2:715927/70‑1 (MQ=255) gCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCagc > 1:715927/1‑70 (MQ=255) gCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAACTGCTGCGCGGCATGAGCGACaa > 1:692939/1‑150 (MQ=255) gCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAACTGCTGCGCGGCATGAGCGACaa < 1:2175803/150‑1 (MQ=255) gcccGGCTACGTGTCATGGTCCCCGACCACCAGGTCAACGACCAGGCTCTGCAGGAAAGTACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTAGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAACTGCTGCGCGGCATGAGCGACAACCAg < 2:1134706/148‑1 (MQ=255) aCCGGCTAGGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAACTGCTGCGCGGCATGAGCGACAACCAgg < 1:879473/150‑1 (MQ=255) ggCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAACTGCTGCGCGGCATGAGCGACAACCAGGTAg > 1:2190462/1‑150 (MQ=255) gTGACCTGGTCGTCGGCGACCATGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAACTGCTGCGCGGCATGAGCGACAACCAGGTAGCGCAGa > 1:626146/1‑150 (MQ=255) gTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCAcccc > 1:382676/1‑100 (MQ=255) gTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCAcccc < 2:382676/100‑1 (MQ=255) gTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAACTGCTGCGCGGCATGAGCGACAACCAGGTAGCGCAGa < 1:2367092/150‑1 (MQ=255) gTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAACTGCTGCGCGGCATGAGCGACAACCAGGTAGCGCAGa < 1:1784563/150‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAACTGCTGCGCGGCATGAGCGACAACCAGGTAGCGCAGATGCGt > 2:1847926/1‑150 (MQ=255) ggTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTCAGACCACCGCACTGCTGCGCGGCATGAGCGACGACCAGGTAGCGCAGATGCGTGa < 1:303637/150‑1 (MQ=255) gTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAACTGCTGCGCGGCATGAGCGACAACCAGGTAGCGCAGATGCGTGAg < 2:472766/150‑1 (MQ=255) tcgtcggcgacCATGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAACTGCTGCGCGGCATGAGCGACAACCAGGTAGCGCAGATGCGTGAgg < 1:522347/143‑1 (MQ=255) tCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCAcccc < 1:196901/91‑1 (MQ=255) tCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAACTGCTGCGCGGCATGAGCGACAACCAGGTAGCGCAGATGCGTGAgg > 1:1804874/1‑150 (MQ=255) tCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGATCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAACTGCTGCGCGGCATGAGCGACAACCAGGTAGCGCAGATGCGTGAgg > 2:1191376/1‑150 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GCTGAGCGACTACCTGGACATGAACCGCGAGCAAAGGGCGCTGCTGGATGATCGGTTGCGCGAGCACCTGGCCTGGCATTGCAAGACTCAACTGCCCGGCTACCTCGACTGGCTCGACCGGCTACGTGACATGGTCGCCGACGACCAGGTCACCGACCAGGCCCTGCAGCAAAGCACCCGCGAGGTCCGTGAGGCAATTGGTCGATTGGCCGAGGAAATCACCCCTTCGGCCACCGAACTGCTGCGCGGCATGAGCGACAACCAGGTAGCGCAGATGCGTGAGGCCTTCCGCGAAGA > NC_002947/5184028‑5184324 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |