| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,199,693 | G→C | 5.4% | intergenic (+20/+53) | PP_4579 → / ← PP_4580 | LysR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,199,693 | 0 | G | C | 5.4% | 229.2 / 3.9 | 76 | intergenic (+20/+53) | PP_4579/PP_4580 | LysR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/35); new base C (2/2); total (38/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.45e-01 | |||||||||||
AGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATCCCCAGCAACAGGCTTTCGACCACAAAGGCCAGCACAAAA > NC_002947/5199548‑5199842 | tgCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTAGCACAGGCAGCGGTCCTTGGGCAAGTAGGTGGTGGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGc < 2:1468709/149‑1 (MQ=255) ccTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGcca > 1:1468709/1‑149 (MQ=255) ttGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCtt > 2:2410011/1‑150 (MQ=255) gAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTc < 1:209093/150‑1 (MQ=255) tggtggtggCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCgg < 1:1129423/150‑1 (MQ=255) gcgtggcAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGc‑cc < 2:1129550/150‑1 (MQ=255) cgtggcAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑Ccg < 2:1743359/150‑1 (MQ=255) gcAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTACCGGCCCTTTCGCGGGCAt < 1:698275/141‑1 (MQ=255) gcAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTACCGGCCCTTTCGCGGGCAt > 2:698275/1‑141 (MQ=255) cAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCAt > 2:1583118/1‑140 (MQ=255) cAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCAt < 1:1583118/140‑1 (MQ=255) cAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGaaa < 2:1574234/150‑1 (MQ=255) aGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGCTCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCa < 1:1260355/138‑1 (MQ=255) aGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCa > 2:1260355/1‑138 (MQ=255) aGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAg < 2:2253835/150‑1 (MQ=255) gACCGGGGTGGCGTTGGTCGCTGAGGTGGTTGGAGGTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACGAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAgg > 2:528952/1‑150 (MQ=255) gACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCa < 2:256245/137‑1 (MQ=255) gACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCa > 1:256245/1‑137 (MQ=255) ccGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGc > 1:16278/1‑150 (MQ=255) cGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGAGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGcc > 1:2045106/1‑150 (MQ=255) ggggTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCg > 2:1252920/1‑150 (MQ=255) ggggTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCg < 1:1558174/150‑1 (MQ=255) ggggTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCg < 1:2086308/150‑1 (MQ=255) tGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGccc < 2:1869427/118‑1 (MQ=255) tGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGGAGGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGccc > 1:1869427/1‑118 (MQ=255) gCGTTGGTGGATGGGGGGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTAGGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCGTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCggtacag < 2:624010/150‑1 (MQ=39) gCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCggtacag > 1:1475338/1‑150 (MQ=255) ggTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGGCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCggtacaggtaca < 2:922882/150‑1 (MQ=255) tGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGaa < 1:2410011/150‑1 (MQ=255) ggAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGTACAACAGTCTCCGGCCGTGATGGCTGGCTGTCAGGGATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGac < 1:1252920/149‑2 (MQ=255) gtTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAgcg > 2:1555856/1‑150 (MQ=255) gtTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTACCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGaaa < 2:983850/120‑1 (MQ=255) gtTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTACCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGaaa > 1:983850/1‑120 (MQ=255) ttGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTAGGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAgcgc < 1:1720346/150‑1 (MQ=255) gTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGCAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAg > 2:2048327/1‑142 (MQ=255) gTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGCAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAg < 1:2048327/142‑1 (MQ=255) tGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGctctc < 1:1555856/150‑1 (MQ=255) gtgtTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTGCCCGCCTGCAGC‑GATGGCAGGGTGACAGGCTGCGCTATAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTATTTcaccac > 1:551077/1‑150 (MQ=255) gtgtTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCggtacagg > 2:1645872/1‑115 (MQ=255) gtgtTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCggtacagg < 1:1645872/115‑1 (MQ=255) gtgtTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTcaccac > 1:1521181/1‑150 (MQ=255) ttGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGgtacaggtacag < 2:1870069/117‑1 (MQ=255) ttGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGgtacaggtacag > 1:1870069/1‑117 (MQ=255) cgcgGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTgcgc > 2:1021683/1‑150 (MQ=255) ggATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGa < 2:16278/150‑1 (MQ=255) tgtgGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCACAggccca > 2:667187/1‑146 (MQ=255) gggtgggCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGctctc > 1:1639039/1‑115 (MQ=255) gggtgggCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGctctc < 2:1639039/115‑1 (MQ=255) ggtgggCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAg < 2:1148216/141‑1 (MQ=255) ggtgggCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAg > 1:1148216/1‑141 (MQ=255) ggtgggCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATcagcca > 1:1628676/1‑150 (MQ=255) cAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCaccacc > 2:2232446/1‑118 (MQ=255) cAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCaccacc < 1:2232446/118‑1 (MQ=255) cAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGAGCAGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAAt > 2:2375181/1‑150 (MQ=255) aGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGaa > 2:797731/1‑67 (MQ=255) aGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGaa < 1:797731/67‑1 (MQ=255) gCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATcc > 2:1136600/1‑150 (MQ=255) gCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTAAAGGAAAAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATcc > 1:1355966/1‑150 (MQ=255) ggATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATcccc > 1:1608300/1‑150 (MQ=255) ggATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATcccc < 2:551077/150‑1 (MQ=255) tGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCGCGACGTTGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTGCAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATCCCCAGCAAc > 1:63384/1‑150 (MQ=255) gCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATCCCCAGCAACa < 2:2045106/150‑1 (MQ=255) tGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATCCCCAGCAACAgg > 2:815628/1‑150 (MQ=255) ggTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCTCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATCCCCAGCAACAGGc < 1:1813505/150‑1 (MQ=255) ccAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATCCCCAGCAACAGGCTTTCGAc > 2:1571443/1‑150 (MQ=255) ccAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATCCCCAGCAACAGGCTTTCGAc < 1:1136600/150‑1 (MQ=255) cAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATCCCCAGCACCAGGCTTTCGACcaca > 1:721957/1‑150 (MQ=255) tctcCGCCTGTAGCGTCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCTCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACCTCACCAGATCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATCCCCAGCAACAGGCTTTCGACCACAAAg < 1:1021683/150‑1 (MQ=38) tctcCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTGCAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATCCTCAGCAACAGGCTTTCGACCACAAAg > 1:1295911/1‑150 (MQ=255) tctcCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGCTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATCCCCAGCAACAGGCTTTCGACCACAAAg < 1:528952/150‑1 (MQ=255) ccGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATCCCCAGCAACAGGCTTTCGAc < 2:1154711/140‑1 (MQ=255) ccGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATCCCCAGCAACAGGCTTTCGAc > 1:1154711/1‑140 (MQ=255) caccTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATCCCCAGCAACAGGCTTTCGACCACAAAGGCCa < 2:1492475/148‑1 (MQ=255) tGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATCCCCAGCAACAGGCTTTCGACCACAAAGGCCAGcac > 2:98944/1‑150 (MQ=255) gTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATc < 2:311798/102‑1 (MQ=255) gTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATc > 1:311798/1‑102 (MQ=255) gCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATCCCCAGCAACAGGCTTTCGACCACAAAGGCCAGCACaaaa < 2:1521181/150‑1 (MQ=255) | AGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGCCCTTTCGCGGGCATGC‑CCGCGAAAGGGCCGGTACAGGTACAGCAGAACTTAGCGCCAGCTCTCTTTCACCACCCTGCGCCGCCCGCCCAGGATCAGCCAGCCAATCCCCAGCAACAGGCTTTCGACCACAAAGGCCAGCACAAAA > NC_002947/5199548‑5199842 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |