Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 5,208,730 | G→A | 5.5% | D9D (GAC→GAT) ‡ | PP_4589 ← | D‑isomer specific 2‑hydroxyacid dehydrogenase family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,208,730 | 0 | G | A | 5.5% | 392.0 / 8.7 | 128 | D9D (GAC→GAT) ‡ | PP_4589 | D‑isomer specific 2‑hydroxyacid dehydrogenase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (62/59); new base A (5/2); total (67/61) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.44e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.20e-01 |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
CCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAGGTTCTCCAGCACCTTGGTGA > NC_002947/5208581‑5208877 | ccTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATgg > 1:1060786/1‑150 (MQ=255) cTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCGCGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGt > 1:676477/1‑150 (MQ=255) cTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGt > 1:694501/1‑150 (MQ=255) ggCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCAt < 1:2193981/150‑1 (MQ=255) gcagACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCACGGCGTATCGCGCCTGGTCCTGCTccg > 2:509127/1‑148 (MQ=255) cagACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGc > 2:1465767/1‑150 (MQ=255) tGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCa > 1:1436651/1‑150 (MQ=255) gCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGt > 2:2205439/1‑150 (MQ=255) gCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGt > 2:38973/1‑150 (MQ=255) ccAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCACGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTa > 1:2068407/1‑150 (MQ=255) cAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTAc > 1:579264/1‑150 (MQ=255) gTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCAt > 1:2019155/1‑150 (MQ=255) tCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATg < 1:251279/150‑1 (MQ=255) tCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAACGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATg > 1:1968572/1‑150 (MQ=255) ccGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATgg < 2:1961337/150‑1 (MQ=255) cGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGt < 1:474711/150‑1 (MQ=255) ggCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTc > 1:1677753/1‑150 (MQ=255) cccAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACgg > 2:1219518/1‑150 (MQ=255) ccAGCCACCCCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACggg < 1:694134/150‑1 (MQ=255) ccAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGAAGAGATTCTTCGCGGCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACggg < 2:676477/150‑1 (MQ=255) cAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACgggg > 1:121741/1‑150 (MQ=255) ccACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAATCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCg > 2:554839/1‑150 (MQ=255) acacCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGtt > 1:1765466/1‑150 (MQ=255) cacCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACgg > 2:1357605/1‑142 (MQ=255) cacCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACgg < 1:1357605/142‑1 (MQ=255) acCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATgg < 1:1974302/105‑1 (MQ=255) ggCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTgcggcg < 2:776433/150‑1 (MQ=255) cTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCgcagc < 2:1419847/150‑1 (MQ=255) tGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCgcagca < 2:1917334/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCtt < 2:1266043/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCg < 2:2141124/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCAAGTTGAGTCGTAGCTCCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCg < 2:63898/150‑1 (MQ=255) gggCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAg < 2:694501/150‑1 (MQ=255) gggCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAg < 1:2363708/150‑1 (MQ=255) gggCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAg > 2:1107499/1‑150 (MQ=255) ggCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAgg > 2:2406844/1‑150 (MQ=255) cAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGc > 2:1960940/1‑150 (MQ=255) aGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCt > 1:1044807/1‑150 (MQ=255) ttCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCg > 2:1004177/1‑150 (MQ=255) 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aaagTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGAGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCAATCAGTACACGCACCGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCCCAGCAGCTCTTCGGCCAGGTGCTCGATGtcc > 2:1103450/3‑148 (MQ=255) agTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTc < 2:2046523/150‑1 (MQ=255) gTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCa < 1:1436715/150‑1 (MQ=255) tCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGc > 1:1563924/1‑77 (MQ=255) tCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCAt > 2:1660320/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCAt < 1:226004/150‑1 (MQ=255) gccgcTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCt > 2:1254286/1‑150 (MQ=255) tcgcTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCtt > 2:1867576/2‑150 (MQ=255) cTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCa < 2:313359/150‑1 (MQ=255) gCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGcggcgg > 1:845377/1‑150 (MQ=255) cACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCggcggc > 2:837084/1‑150 (MQ=255) 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aGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCa > 1:525632/1‑150 (MQ=255) gtgcTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAg > 2:2213690/4‑150 (MQ=255) gTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAg > 2:408447/1‑150 (MQ=255) ttCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGCGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAgg < 1:509127/150‑1 (MQ=255) ttCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAgg < 1:1960940/150‑1 (MQ=255) 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aaaaGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGa < 1:2205439/150‑1 (MQ=255) aaaGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAg < 2:1060786/150‑1 (MQ=255) aaGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGTCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAgg < 1:803273/150‑1 (MQ=255) aaGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGacg < 2:1765466/150‑3 (MQ=255) gcggcgTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAg > 2:1313076/1‑145 (MQ=255) gcggcgTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAg < 1:1313076/145‑1 (MQ=255) gcgTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAGGTTCTCCa < 1:1465767/150‑1 (MQ=255) atcgctgAGCATGACCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAGGTTCTCCAg > 2:1381506/7‑150 (MQ=255) gctgAGCATGACCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAGGTTCTCCAGCAc > 2:249958/4‑150 (MQ=255) aTCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAg < 1:2156808/138‑1 (MQ=255) tCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGATGTTCTCCAGCAcc > 2:54021/1‑150 (MQ=255) tgAGCATGACCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAgg > 1:1614033/2‑137 (MQ=255) tgAGCATGACCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAgg < 2:1614033/136‑1 (MQ=255) tgAGCATGACCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAg < 2:147232/135‑1 (MQ=255) tgAGCATGACCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGAGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAg > 1:147232/2‑136 (MQ=255) tgAGCATGACCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCACTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAGGTTCTCCAGCACCt > 1:371187/2‑150 (MQ=255) gAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAg > 2:328010/1‑114 (MQ=255) gAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAg < 1:328010/114‑1 (MQ=255) aGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAGGTTCTCCAGCACCTTg < 2:1985532/150‑1 (MQ=255) cATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAGGTTCTCCAGCACCTTGGt < 1:38973/150‑1 (MQ=255) aTGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAgg > 1:83018/1‑132 (MQ=255) aTGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAgg < 2:83018/132‑1 (MQ=255) tGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGTAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAGGTTCTCCAGCACCTTGGTGa < 2:873613/150‑1 (MQ=255) tGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGTTATGCTTGGCGTTCGATGTTCGCCAGCACCTTGGTGa < 2:1480972/150‑1 (MQ=255) | CCTTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGCTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAGGTTCTCCAGCACCTTGGTGA > NC_002947/5208581‑5208877 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |