| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,273,087 | C→G | 8.8% | S62R (AGC→AGG) | rlmG → | ribosomal RNA large subunit methyltransferase G |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,273,087 | 0 | C | G | 8.8% | 318.4 / 15.1 | 102 | S62R (AGC→AGG) | rlmG | ribosomal RNA large subunit methyltransferase G |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (50/43); new base G (2/7); total (52/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.91e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGCCCGTTCGACCGGGT > NC_002947/5272938‑5273236 | cTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCAGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGCCAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGc > 1:236422/1‑150 (MQ=255) ccGGAGCAGGCCAAGGACCCGTTGCAGGCCTTGGATGTCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGGCGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCGGGCCTGCAAGGCTTGC‑GGCCAg < 2:2340780/150‑1 (MQ=255) ccGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCTGCAAGGCTTGC‑GGCCAg < 2:584128/150‑1 (MQ=255) ccGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCTGCAAGGCTTGC‑GGCCAg < 1:2229257/150‑1 (MQ=255) ccGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCTGCAAGGCTTGC‑GGCCAg < 2:463360/150‑1 (MQ=255) ccGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGACGCCCCCCTGACGGCCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCTGCAAGGCTTGC‑GGCCAg < 1:1022102/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGTGCGGGCCTGCAAGGCTTGC‑GGCCAgggc < 1:64128/150‑4 (MQ=255) aGCAGGCGAACGAACCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGGACCCTACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGc > 2:701374/1‑150 (MQ=255) cAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAg < 2:2296827/150‑1 (MQ=255) cAGGCCAACGACCCGCTGCAGGCTTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAg < 2:1345845/150‑1 (MQ=255) aGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAgg < 1:2273227/150‑1 (MQ=255) gCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAggtg < 1:2155320/150‑1 (MQ=255) cAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAggtggt > 2:2019602/1‑150 (MQ=255) cAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAggtggt > 1:1408506/1‑150 (MQ=255) cAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAggtggt > 1:518621/1‑150 (MQ=255) caaCCCTTCGCAGGCCTTCGAGGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTcag < 2:1714588/148‑1 (MQ=255) ccGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTca > 2:715933/1‑145 (MQ=255) ccGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTca < 1:715933/145‑1 (MQ=255) ttGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCT‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGCTCAGCAGCGGt > 1:451838/1‑150 (MQ=255) ggCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTc < 1:1521360/150‑1 (MQ=255) gCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCg > 2:1203224/1‑150 (MQ=255) gCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCg > 1:1957470/1‑150 (MQ=255) cTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCa > 2:554044/1‑115 (MQ=255) cTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCa < 1:554044/115‑1 (MQ=255) ttCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCAc > 2:168633/1‑150 (MQ=255) gATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGa < 1:208533/140‑1 (MQ=255) gATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGa > 2:208533/1‑140 (MQ=255) aTGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTgg < 1:659770/150‑1 (MQ=255) gccgACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCAc < 1:2019602/150‑1 (MQ=255) acgaGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTgg > 2:1878593/1‑150 (MQ=255) gaGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGcg < 2:110885/150‑2 (MQ=255) gTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCt < 1:1939107/150‑1 (MQ=255) cTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGt < 2:266325/120‑1 (MQ=255) cTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGt > 1:266325/1‑120 (MQ=255) gCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGaaaa < 1:806711/150‑1 (MQ=255) gcAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCt < 1:1258674/150‑1 (MQ=255) cAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTg < 2:1898223/150‑1 (MQ=255) aGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTgg > 2:2366267/1‑150 (MQ=255) gCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGgc < 1:1878593/150‑1 (MQ=255) acacGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGgcgcg > 1:179705/1‑150 (MQ=255) acGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCa > 1:2322017/1‑150 (MQ=255) gATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTcag < 2:1499633/95‑1 (MQ=255) gATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTgg > 1:2216070/1‑115 (MQ=255) gATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTgg < 2:2216070/115‑1 (MQ=255) gATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑ACAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAAt > 2:156830/1‑150 (MQ=255) gATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTAGGTGCTCTGGCC‑GCAAGCCTTTCAGGCCAGCTGCAGGTGGTcag > 1:1499633/1‑95 (MQ=255) tCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAg > 1:595334/1‑85 (MQ=255) tCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAg < 2:595334/85‑1 (MQ=255) ggCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGaa > 2:1649137/1‑132 (MQ=255) ggCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGaa < 1:1649137/132‑1 (MQ=255) gCACCCGACGCCAATTGCCTGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTg > 2:1148603/1‑150 (MQ=255) gCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTg > 1:2395522/1‑150 (MQ=255) gCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTg < 2:1957470/150‑1 (MQ=255) aCCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGcc > 1:1011481/1‑150 (MQ=255) aCCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGcc > 1:623225/1‑150 (MQ=255) aCCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCGGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCATTTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGcc > 1:738582/1‑150 (MQ=255) gACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGa < 2:607078/124‑1 (MQ=255) cGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTTGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGa < 2:1606070/150‑1 (MQ=255) cGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑ACAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGa < 1:156830/150‑1 (MQ=255) gCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGAc > 2:2285687/1‑150 (MQ=255) gCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGAc < 2:2282110/150‑1 (MQ=255) gCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGGTCGaa > 1:1095885/1‑149 (MQ=255) cAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAg < 2:806405/70‑1 (MQ=255) cAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAg > 1:806405/1‑70 (MQ=255) aaTTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAgt < 1:168633/150‑1 (MQ=255) aaTTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAgt > 2:1618958/1‑150 (MQ=255) ggTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGCCTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGtt < 1:1203224/150‑1 (MQ=255) tACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCAcc < 1:667180/93‑1 (MQ=255) tACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCAcc > 2:667180/1‑93 (MQ=255) cTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTa < 2:2197186/150‑1 (MQ=255) tGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGcc < 2:1893899/127‑1 (MQ=255) tGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGcc > 1:1893899/1‑127 (MQ=255) tGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACa > 1:2205978/1‑135 (MQ=255) tGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACa < 2:2205978/135‑1 (MQ=255) tCAATGACAGCTTCGGGGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCa < 1:701374/150‑1 (MQ=255) aaTGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGCACCCCAGCCCTGGGAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACATGGTTCCGTTCGTACCGGCCAGc > 1:43566/1‑150 (MQ=255) tGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGtt < 1:562310/120‑1 (MQ=255) tGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGtt > 2:562310/1‑120 (MQ=255) aCAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGcc > 1:36955/1‑111 (MQ=255) aCAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGcc < 2:36955/111‑1 (MQ=255) aCAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAac < 1:2285687/150‑1 (MQ=255) cTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTg > 2:424700/1‑150 (MQ=255) ttCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCTGCCAGCGAACACTgg > 1:118493/1‑150 (MQ=255) tCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGc < 1:835400/150‑1 (MQ=255) gTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAgtgt > 1:700506/1‑118 (MQ=255) gTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAgtgt < 2:700506/118‑1 (MQ=255) gCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGc < 1:141546/150‑1 (MQ=255) cTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGCCCg > 2:1581896/1‑150 (MQ=255) cTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGACCAGc > 2:1774915/1‑132 (MQ=255) cTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGCCAGGAGCGGTCTATCGCCCGTGGGGCACCTGGCCTGGGGAAAGAAATTGGCGCGCAATGGCCTGCCGGTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGCCCg > 1:1855493/1‑150 (MQ=255) tggcctgCAAGGCTTGC‑GGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAgg > 1:1586780/7‑145 (MQ=255) tggcctgCAAGGCTTGC‑GGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAgg < 2:1586780/139‑1 (MQ=255) tggcctgCAAGGCTTGC‑GGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGGGTACCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGCCCGt > 1:1230537/7‑150 (MQ=255) aaGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTc < 2:2326192/112‑1 (MQ=255) aaGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTc > 1:2326192/1‑112 (MQ=255) aaGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGCCCGTTCGACCg > 2:260192/1‑150 (MQ=255) ccTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCGCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGCCCGTTCGACCGGGt > 1:2102408/1‑150 (MQ=255) ccTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACt < 2:514835/128‑1 (MQ=255) ccTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACt > 1:514835/1‑128 (MQ=255) ccTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGCCCGTTCGACCGGGt > 2:1807992/1‑150 (MQ=255) | CTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGCCCGTTCGACCGGGT > NC_002947/5272938‑5273236 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |