| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,324,930 | A→C | 5.7% | M506L (ATG→CTG) | PP_4684 → | kinase‑like domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,324,930 | 0 | A | C | 5.7% | 326.7 / 6.8 | 104 | M506L (ATG→CTG) | PP_4684 | kinase‑like domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (46/52); new base C (3/3); total (49/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CCAGTTGGCTGGAGCAGCGCCAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGATGGCAAAAAGCCGCATATTTCCCAACGCCCGCTACACTC > NC_002947/5324781‑5325075 | ccAGTTGGCTGGAGCAGCGCCAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGgcagca < 1:1657994/150‑1 (MQ=255) ttGGCTGGAGCAGCGCCAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCAt > 2:1350270/1‑147 (MQ=255) ttGGCTGGAGCAGCGCCAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCAt < 1:1350270/147‑1 (MQ=255) ttGGCTGGAGCAGCGCCAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGa > 2:1128828/1‑150 (MQ=255) tGGCTGGAGCAGCGCCAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGAt < 2:495435/150‑1 (MQ=255) tGGCTGGAGCAGCGCCAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGAt < 1:1128828/150‑1 (MQ=255) gCTGGAGCAGCGCCAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCATGCTGCCGGCAGCCTgggt < 2:742163/148‑3 (MQ=255) gCTGGAGCAGCGCCAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCATGCTGCCGGCAGCCTgggt > 1:742163/1‑146 (MQ=255) cTGGAGCAGCGCCAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAg < 1:1087129/150‑1 (MQ=255) tGGAGCAGCGCCAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAgg > 1:764154/1‑150 (MQ=255) ggAGCAGCGCCAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGt < 1:2057265/150‑1 (MQ=255) agcagcGCCAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGa < 1:158398/150‑1 (MQ=255) gcagcGCCAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGAt < 1:1444681/150‑1 (MQ=255) gcagcGCCAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGAt > 1:1816667/1‑150 (MQ=255) cagcGCCAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATc < 2:1816667/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGa < 2:1817140/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCGGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCa < 1:2327230/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCa > 1:2191335/1‑150 (MQ=255) cAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAg > 2:2104797/1‑150 (MQ=255) aGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGTTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGa > 1:2036705/1‑150 (MQ=255) aGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGa < 2:1822720/150‑1 (MQ=255) aGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGa < 1:348205/150‑1 (MQ=255) aGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGa < 2:1020364/150‑1 (MQ=255) gCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGAtt > 1:792163/1‑150 (MQ=255) ccGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTc > 1:2316167/1‑150 (MQ=255) aaCAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCa < 2:258532/149‑1 (MQ=255) gCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCATCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCATGCTGCCGGCAGCCTgggtatc < 1:1488754/125‑6 (MQ=255) gACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTg > 2:2054679/1‑150 (MQ=255) cccGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTgcc > 1:1053527/1‑150 (MQ=255) ccGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTc < 1:1246163/136‑1 (MQ=255) ccGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTc > 2:1246163/1‑136 (MQ=255) ccGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTgcct < 1:1426965/150‑1 (MQ=255) gTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTgcctgg > 2:1474947/1‑150 (MQ=255) cACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGt > 1:696905/1‑150 (MQ=255) cACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGt > 1:1768269/1‑150 (MQ=255) cACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAAATTCGCTAGCGGTTGCCTGGCCTGGAAGt > 2:1124289/1‑150 (MQ=255) cACGCTGGAGGTGATAAAAACTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGt > 1:2373023/1‑150 (MQ=255) aCGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGtt > 1:33674/1‑150 (MQ=255) ggAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCa > 1:513423/1‑150 (MQ=255) gAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCAc < 2:792163/150‑1 (MQ=255) aGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAg < 2:41446/122‑1 (MQ=255) aGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAg > 1:41446/1‑122 (MQ=255) gATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGAt < 2:1795549/94‑1 (MQ=255) aacAAAGCGCAGCAGGCCAACCGTGACATGCCGGATTCCCAGAAGCTGGGGCACATCACCCGCTTCTATACCCATGCTGTCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCt < 2:419220/148‑1 (MQ=255) aTCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCt < 2:696905/150‑1 (MQ=255) cAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCttt < 2:405491/150‑3 (MQ=255) aGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGtgc < 2:513423/150‑1 (MQ=255) ggCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGtgcc > 2:386825/1‑150 (MQ=255) ggCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGtgcc > 1:1516400/1‑150 (MQ=255) gCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCATGCTGCCGGCAGCCTgg > 2:1590249/1‑85 (MQ=255) gCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCATGCTGCCGGCAGCCTgg < 1:1590249/85‑1 (MQ=255) gCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGGTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGtgcct < 1:1124289/150‑1 (MQ=255) tCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTACCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGtgcctgc > 2:1866510/1‑150 (MQ=255) agcagGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGccc > 2:2151085/1‑150 (MQ=255) agcagGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGccc < 2:2215050/150‑1 (MQ=255) agcagGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGccc < 1:1474947/150‑1 (MQ=255) cagGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGc > 2:1451961/1‑150 (MQ=255) ccAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAAt < 2:1303187/150‑1 (MQ=255) aGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATgg < 2:2373023/150‑1 (MQ=255) ccGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTACCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGggc < 1:1866510/150‑1 (MQ=255) cGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGggca < 2:1053527/150‑1 (MQ=255) cGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGggca > 2:1611572/1‑150 (MQ=255) ggATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTaa > 2:50177/1‑103 (MQ=255) ggATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTaa < 1:50177/103‑1 (MQ=255) gATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGc < 2:2299082/150‑1 (MQ=255) gcAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGtgcctgc > 2:1619325/1‑120 (MQ=255) gcAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGtgcctgc < 1:1619325/120‑1 (MQ=255) gcAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCAcc < 2:764154/150‑1 (MQ=255) gcAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCAcc < 1:2054679/150‑1 (MQ=255) gcAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGAGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCAcc > 2:1599193/1‑150 (MQ=255) cTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGAt < 2:1516400/150‑1 (MQ=255) ggTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGATgg < 1:2354552/150‑1 (MQ=255) aaaGCACACGCATCGATACCAAGGCTACCGGCAGTATGGATCATGTGATCTAGTGGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGACTGTAACTTCGTCACCTTCCCCTGCCAGCACGCCAATGGGCAGGTACAGGCCGCTCACCCTACGATGGCaaaa < 2:266478/148‑1 (MQ=255) caGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCTCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGATGGCaaaaa > 1:1121339/1‑150 (MQ=255) caGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGATGGCaaaaa < 1:1185298/150‑1 (MQ=255) gcgTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGATGGCAAAAAGCCGCata > 2:1389988/1‑150 (MQ=255) gATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGATGGCAAAAAGCCGCATATTTcc < 1:2151085/150‑1 (MQ=255) gATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGATGGCAAAAAGCCGCATATTTcc < 1:1686402/150‑1 (MQ=255) aTACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCt > 1:1225903/1‑83 (MQ=255) aTACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCt < 2:1225903/83‑1 (MQ=255) aTACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGATGGCAAAAAGCCGCATATTTccc > 1:2398832/1‑150 (MQ=255) tACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTcc < 1:1148255/81‑1 (MQ=255) tACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTcc > 2:1148255/1‑81 (MQ=255) aCCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTc < 2:146563/116‑1 (MQ=255) aCCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTc > 1:146563/1‑116 (MQ=255) aCCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGATGGCAAAAAGCCGCATATTTCCCaa < 2:1768269/150‑1 (MQ=255) cccAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGATGGCAAAAAGCCGCATATTTCCCAAc < 2:2191335/150‑1 (MQ=255) ccAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATggg < 1:847934/98‑1 (MQ=255) ccAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATggg > 2:847934/1‑98 (MQ=255) ccAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGATGGCAAAAAGCCGCATATTTCCCAACg > 2:312166/1‑150 (MQ=255) ccAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGATGGCAAAAAGCCGCATATTTCCCAACg > 1:752375/1‑150 (MQ=255) ccAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGATGGCAAAAAGCCGCATATTTCCCAACg > 1:668702/1‑150 (MQ=255) cAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGATGGCAAAAAGCCGCATATTTCCCaa > 2:157895/1‑147 (MQ=255) cAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGATGGCAAAAAGCCGCATATTTCCCaa < 1:157895/147‑1 (MQ=255) cTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGATGGCAAAAAGCCGCATATTTCCCAACGCCCGc < 1:1599193/150‑1 (MQ=255) cGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTcc > 2:2192342/1‑112 (MQ=255) cGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTcc < 1:2192342/112‑1 (MQ=255) cagcaTGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGATGGCAAAAAGCCGCATATTTCCCAACGCCCGCTACActc < 2:2036705/150‑1 (MQ=255) agcaTGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGATGGCaaaaa > 2:1564654/1‑119 (MQ=255) agcaTGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGATGGCaaaaa < 1:1564654/119‑1 (MQ=255) | CCAGTTGGCTGGAGCAGCGCCAGGCCGAAAACAGCGACCCGTCGGATGCCACGCTGGAGGTGATCAAGGCTCAGCAGGCCAGCCGTGAGGCGCTGGATGCGCAGGAGCTGGTGCACAGCACCCGCGTCGATACCCAGGCTGCCGGCAGCATGGATCAGGTGATCGAGCAGATTCGCCAGCGGTTGCCTGGCCTGTAAGTTCGTCACCTTCCTGTGCCTGCCCGCCAATGGGCAGGCACAGGCCGCTCACCCTCCGATGGCAAAAAGCCGCATATTTCCCAACGCCCGCTACACTC > NC_002947/5324781‑5325075 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |