| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,368,718 | G→T | 6.9% | R14S (CGC→AGC) | greA ← | transcription elongation factor GreA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,368,718 | 0 | G | T | 6.9% | 318.6 / 10.1 | 102 | R14S (CGC→AGC) | greA | transcription elongation factor GreA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (53/42); new base T (4/3); total (57/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.66e-01 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CGCGCTTCGACCATGCCCTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATGGTAGTGGTGCAGTAAAT > NC_002947/5368570‑5368867 | cgcgCTTCGACCATGCCCTGCTCCACACGGGCCGCCTGGTGTACTGGGCTTTCATTGGGGGCACCCAGCGCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGa < 2:529994/150‑1 (MQ=255) gcgcTTCGACCATGCCCTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAg > 2:1562230/1‑150 (MQ=255) gcTTCGACCATGCCCTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAgcg > 1:1195721/1‑150 (MQ=255) cTTCGACCATGCCCTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAgcgc < 1:1630099/150‑1 (MQ=255) ttCGACCATGCCCTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGcc > 2:1284526/1‑150 (MQ=255) tCGACCATGCCCTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGccc < 1:689292/150‑1 (MQ=255) cccTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTc > 2:363506/1‑150 (MQ=255) cTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCAt > 1:1125259/1‑150 (MQ=255) gCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCg > 2:170772/1‑150 (MQ=255) ctcctcACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCgg > 1:1089801/1‑150 (MQ=255) cACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCTCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTAtt < 1:1189578/150‑1 (MQ=255) gcggcATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTa < 2:1638899/150‑1 (MQ=255) ggTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACGGGTGCTCTTCTTCCAGGGTGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCa < 1:903327/150‑1 (MQ=255) ttCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCt > 1:1713812/1‑150 (MQ=255) tCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCtt < 1:363506/150‑1 (MQ=255) cGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCttt > 2:1285584/1‑150 (MQ=255) cGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCttt > 2:1812099/1‑150 (MQ=255) gTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGt > 2:1509719/1‑150 (MQ=255) ttCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCt < 1:1562230/150‑1 (MQ=255) cTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATTGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCtgca > 2:697287/1‑150 (MQ=255) ttGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTc > 1:814109/1‑140 (MQ=255) ttGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCtgcat > 2:1046949/1‑150 (MQ=255) aGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCtgcatgca < 1:219719/150‑1 (MQ=255) gTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGa > 2:503006/1‑150 (MQ=255) cACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATTGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATc < 1:697287/150‑1 (MQ=255) cACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATc < 1:1285584/150‑1 (MQ=255) aCCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTaa > 2:649870/1‑119 (MQ=255) aCCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATcc > 1:300982/1‑150 (MQ=255) cccAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCt < 2:1125259/150‑1 (MQ=255) ccAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTg > 1:548293/1‑150 (MQ=255) ccAGCTCACGCGCTTCACCAATGGACTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTg > 1:174096/1‑150 (MQ=255) aGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCGAGGGACTGACCGCCCTGGACGGTCATCGGTTATTTGGTAATGCTCATGCTCTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCa > 1:1852011/1‑150 (MQ=255) gcACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCTCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGc > 2:1648385/2‑150 (MQ=255) aCGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGcga > 1:1169096/1‑150 (MQ=255) aCGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGcga > 2:1393875/1‑150 (MQ=255) cgcTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGcgacga < 1:415353/150‑1 (MQ=255) cTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCGTCCAGGGCGCGAGACCCACGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAAc < 1:170772/150‑1 (MQ=255) ttCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCt > 2:1425095/1‑80 (MQ=255) ttCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCt < 1:1425095/80‑1 (MQ=255) cACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGt < 2:1713812/150‑1 (MQ=255) aCCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCgg < 2:1551978/90‑1 (MQ=255) aCCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCgg > 1:1551978/1‑90 (MQ=255) cAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCtt > 2:1296183/1‑150 (MQ=255) tGGACTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTc < 2:174096/150‑1 (MQ=255) ggCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGCTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTcc < 2:1733281/150‑1 (MQ=255) 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gcTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTc < 2:548293/150‑1 (MQ=255) cTCGGTCTTGATCAGGAAAAGGTGCTCTTCTGACATGGCGCGAGCTGCCTGGACGGTCAGCGGAGGTTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCg > 2:398251/1‑150 (MQ=255) tCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTACTCCGTGTGAGTCCTTCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGc > 2:1270644/1‑150 (MQ=255) cGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCa < 2:1089801/150‑1 (MQ=255) gTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTATTTCCCTGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGa < 1:1270644/150‑1 (MQ=255) 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tCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTc > 1:745701/1‑150 (MQ=255) ggAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCAcc > 1:986554/1‑150 (MQ=255) aaaGGTGATCTTATTCAAGGGCGCGGGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGc > 2:1955436/3‑150 (MQ=255) cAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGcc < 1:1046949/150‑1 (MQ=255) ggTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGc > 1:1514004/1‑150 (MQ=255) 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ctctTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCttt > 1:289299/1‑62 (MQ=255) cttcttCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTaa > 1:202355/1‑48 (MQ=255) cttcttCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTaa < 2:202355/48‑1 (MQ=255) ttcttcCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATGGTa > 1:346562/1‑150 (MQ=255) ttcttcCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATGGTa < 2:1427245/150‑1 (MQ=255) tcCAGGGCGCTCGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCtgc > 1:1264162/1‑64 (MQ=38) tcCAGGGCGCTCGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAAt > 1:321417/1‑107 (MQ=255) tcCAGGGCGCTCGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAAt < 2:321417/107‑1 (MQ=255) ccAGGGCGCTCGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCtttt > 1:1223086/1‑95 (MQ=255) ccAGGGCGCTCGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCtttt < 2:1223086/95‑1 (MQ=255) ccAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTg < 1:1613459/75‑1 (MQ=255) ccAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTg > 2:1613459/1‑75 (MQ=255) cAGGGCGCTCGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATGGTAgtggtg > 2:2266648/1‑150 (MQ=255) cAGGGCGCGAGCGCCCGCGACGGGCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCCACGAACGACCTTTTCCGAACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCACAATGGTAgtggtg > 2:1977870/1‑150 (MQ=255) aGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATGGTAGTGGTGc < 2:300982/150‑1 (MQ=255) 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CGCGCTTCGACCATGCCCTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATGGTAGTGGTGCAGTAAAT > NC_002947/5368570‑5368867 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |