| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,377,749 | T→G | 8.8% | S175R (AGC→CGC) | grpE ← | heat shock protein GrpE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,377,749 | 0 | T | G | 8.8% | 408.4 / 25.9 | 148 | S175R (AGC→CGC) | grpE | heat shock protein GrpE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (79/56); new base G (6/7); total (85/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.98e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.78e-01 | |||||||||||
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
TTTACCCATGTTAACTCTCCCGAAACTTGAATTTGGTAGCAGCGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCTGCATGGCCATGGCCTGGTGGTGCTCAGGGTTGAACGGCT > NC_002947/5377604‑5377898 | aCCCATGTTAACTCTCCCGAAACTTGAATTTGGTAGCAGCGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGcc > 1:717183/1‑150 (MQ=255) cATGTTAACTCTCCCGAAACTTGCATTTGGTAGCAGCGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTg < 1:2308283/150‑1 (MQ=255) cATGTTAACTCTCCCGAAACTTGAATTTGGTAGCAGCGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGAGCGCGgcgcaacc < 1:2118634/150‑5 (MQ=255) aTGTTAACTCTCCCGAAACTTGAATTTGGTAGCAGCGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGc < 2:1340174/150‑1 (MQ=255) aTGTTAACTCTCCCGAAACCTGAATTTGGTAGCAGCGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGc > 1:188361/1‑150 (MQ=255) tctcCCGAAACTTGAATTTGGTAGCAGCGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGaccacc > 2:2281920/1‑150 (MQ=255) tctcCCGAAACTTGAATTTGGTAGCAGCGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGaccacc > 1:192806/1‑150 (MQ=255) tctcCCGAAACTTGAATTTGGTAGCAGCGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGaccacc > 1:989615/1‑150 (MQ=255) ccGAAACTTGAATTTGGTAGCAGCGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGacccccaccc > 2:2067119/1‑149 (MQ=255) ccGAAACTTGAATTTGGTAGCAGCGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGAccaccacca > 1:254619/1‑150 (MQ=255) cGAAACTTGAATTTGGTAGCAGCGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCAt > 1:176259/1‑150 (MQ=255) aaaCTTGAATTTGGTAGCAGCGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATgg < 2:157468/150‑1 (MQ=255) ttGAATTTGGTAGCAGCGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCggg > 1:1420308/1‑150 (MQ=255) tGAATTTGGTAGCAGCGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCgggg < 2:1273485/150‑1 (MQ=255) tttGGTAGCAGCGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGGAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCgca > 1:591346/1‑150 (MQ=255) gTAGCAGCGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGgcg < 2:1775150/144‑1 (MQ=255) gTAGCAGCGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGgcg > 1:1775150/1‑144 (MQ=255) tAGCAGCGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAgg > 2:883471/1‑150 (MQ=255) gcagcGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGAGCGCGgcgcaac > 1:1329699/1‑114 (MQ=255) gcagcGACTACTTTGGCCAACTGAGGTACTACTTGAAGACTTTACTCCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAggcg < 1:539460/150‑1 (MQ=255) cagcGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAggcgg > 2:911689/1‑150 (MQ=255) agcGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAggcggc < 2:1780767/150‑1 (MQ=255) gcGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGACTTGCTGACCACCACCATGCCGGGGCCCACCAggcggct > 2:465657/1‑149 (MQ=255) cGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCg < 2:989615/150‑1 (MQ=255) gACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCg > 2:1047521/1‑105 (MQ=255) gACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCg < 1:1047521/105‑1 (MQ=255) ctTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTcagc < 2:254619/150‑1 (MQ=255) ctTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTcagc > 1:1935800/1‑150 (MQ=255) tttGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGcc > 2:1564277/1‑142 (MQ=255) tttGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTcagca < 1:2281920/150‑1 (MQ=255) gCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGAAGGCGGCCGTTcagccgcta > 2:262545/1‑145 (MQ=255) ccAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCgca < 1:2345164/127‑1 (MQ=255) ccAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCgca > 2:2345164/1‑127 (MQ=255) ccAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTcagc < 2:547941/144‑1 (MQ=255) aaCTGCGGTAATAATTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGGAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAAcc > 1:1632596/1‑150 (MQ=255) cTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCt > 2:1472757/1‑150 (MQ=255) gCGGTAATACTTGAACGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTGAACCCAGGTGAGTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTc > 2:695633/1‑150 (MQ=255) cGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCt > 2:1972791/1‑150 (MQ=255) ggTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCGCCGATCGAGGGTTGCACCACGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTg < 1:781081/150‑1 (MQ=255) ggTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGAGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTg < 1:1059339/150‑1 (MQ=255) tAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTg < 1:694579/148‑1 (MQ=255) aaTACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGaa < 2:710533/150‑1 (MQ=255) tACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGacca > 1:1579832/1‑96 (MQ=255) aCTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTa < 2:608568/135‑1 (MQ=255) aCTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTa > 1:608568/1‑135 (MQ=255) aCTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAacac < 2:1975097/150‑1 (MQ=255) ttGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCgca < 2:1727385/111‑1 (MQ=255) ttGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCgca > 1:1727385/1‑111 (MQ=255) ttGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGt > 2:2276971/1‑150 (MQ=255) ttGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGt < 2:1935800/150‑1 (MQ=255) tGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGtt < 2:192806/150‑1 (MQ=255) aaGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGa > 1:39501/1‑87 (MQ=255) aaGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGa < 2:39501/87‑1 (MQ=255) gACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCt > 1:1238226/1‑150 (MQ=255) acCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGtt < 1:911689/150‑1 (MQ=255) cTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCACCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCt > 2:1627041/1‑126 (MQ=255) tAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGac > 1:1514416/1‑75 (MQ=255) aGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATg < 2:1004219/84‑1 (MQ=255) aGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATg > 1:1004219/1‑84 (MQ=255) aTGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTc < 2:2383708/150‑1 (MQ=255) gATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGt < 1:1658466/108‑1 (MQ=255) ccccGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGc > 1:2318222/1‑150 (MQ=255) cccGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCg > 1:386069/1‑150 (MQ=255) ccGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCgc > 2:793649/1‑149 (MQ=255) ccGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCg > 1:2370002/1‑149 (MQ=255) ccGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCg < 2:2370002/149‑1 (MQ=255) ccGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGt > 2:213825/1‑150 (MQ=255) cGAGGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGtt > 1:1778637/1‑150 (MQ=255) cGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGtt > 1:647542/1‑150 (MQ=255) gATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCt > 1:2139271/1‑150 (MQ=255) gATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTACCt > 1:846078/1‑150 (MQ=255) tttCAAGCCTTTTCATTGATCGAGATTTGCGCCGGGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCTGCGTTTTCCTGc > 2:1355031/1‑150 (MQ=255) ccTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGt < 2:1846195/117‑1 (MQ=255) ccTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGt > 1:1846195/1‑117 (MQ=255) cTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCt < 1:443486/122‑1 (MQ=255) cTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCt > 2:443486/1‑122 (MQ=255) ttCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCTGcatggccatggc < 2:1708847/150‑1 (MQ=255) aTTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGtt < 2:2096750/111‑1 (MQ=255) aTTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGtt > 1:2096750/1‑111 (MQ=255) aTTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCTGCATGGCCATGGCCtg < 1:883471/150‑1 (MQ=255) aTTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCTGCATGGCCATGGCCtg > 1:343187/1‑150 (MQ=255) aTTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCTGCATGGCCATGGCCtg > 2:1668820/1‑150 (MQ=255) ttGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCTGCATGGCCATGGCCtgg > 2:1490744/1‑150 (MQ=255) aTCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGt < 2:1249740/94‑1 (MQ=255) aTCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCTGcat > 1:185625/1‑134 (MQ=255) aTCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCTGcat < 2:185625/134‑1 (MQ=255) aTCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCTGCatggccatggcc < 2:1594815/144‑1 (MQ=255) aTCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCTGCatggccatggcc > 1:1594815/1‑144 (MQ=255) tCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCTGCATGGCCATGGCCTggtggt > 1:437554/1‑150 (MQ=255) gTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCt < 1:511837/78‑1 (MQ=255) gTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCt > 2:511837/1‑78 (MQ=255) aaggcgcCGAGCGCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTc < 2:433088/118‑1 (MQ=255) aaggcgcCGAGCGCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCTGCATGGCCATGGCCTGGTGGTGCTCAg > 1:1885679/4‑150 (MQ=255) aaggcgcCGAGCGCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCTGCATGGCCATGGCCTGGTGGTGCTCAg > 1:1084736/4‑150 (MQ=255) tGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCTGCATGGACATGGCCTGGTGGTGCTcccag < 2:644419/150‑5 (MQ=255) ccgcGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCTGCATGGCCATGGCCTGGTGGTGCTCAGGGTTGa > 2:2137179/1‑150 (MQ=255) cgcgCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCTGCATGGCCATGGCCTGGTGGTGCTCAGGGTTGaa < 2:2342577/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCTGCATGGCCATGGCCTGGTGGTGCTCAGGGTTGAAc > 2:1667768/1‑150 (MQ=255) cTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCTGCATGGCCATGGCCTggtggt < 2:1081024/133‑1 (MQ=255) tCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACGCGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCTGCATGGCCATGGCCTGGTGGTGCTCAGGGTTGAACGGCt < 1:1472757/150‑1 (MQ=255) | TTTACCCATGTTAACTCTCCCGAAACTTGAATTTGGTAGCAGCGACTACTTTGGCCAACTGCGGTAATACTTGAAGGCTTGACACCTAGATGGGGATGCCCCGAAGGATTTCAAGCCTTTTCATTGATCGAGGGTTGCGCCGCGCTCGGCGCCTTGCTGACCACCACCATGGCGGGGCGCAGCAGGCGGCCGTTCAGCAGGTAACCCTTCTGGAACACGTTCAACACGCTGTTTGGCTCGACCTCGGCGTTTTCCTGCATGGCCATGGCCTGGTGGTGCTCAGGGTTGAACGGCT > NC_002947/5377604‑5377898 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |