Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,378,931 | C→G | 5.9% | A156A (GCC→GCG) | recN → | DNA repair/recombination protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,378,931 | 0 | C | G | 5.9% | 271.0 / 7.0 | 85 | A156A (GCC→GCG) | recN | DNA repair/recombination protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/39); new base G (3/2); total (44/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.54e-01 |
ATCAACGGCACGCCCTGCCCGCTCGGCGACCTCAAGGCGCTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGGAAGAACTGGACAACCTCGGCCTGGGCGAGCACGA > NC_002947/5378782‑5379080 | aTCAACGGCACGCCCTGCCCGCTCGGCGACCTCAAGGCGCTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGcc > 1:1484920/1‑150 (MQ=255) aTCAACGGCACGCCCTGCCCGCTCGGCGACCTCAAGGCGCTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACAGCCAAAGA‑ACGTCGTGTGGTTGACGAGTATCCCGGCGCCGTCGACCTGGcc > 2:1468654/1‑150 (MQ=255) tCAACGGCACGCCCTGCCCGCTCGGCGACCTCAAGGCGCTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGccc > 1:2157352/1‑150 (MQ=255) cGGCACGCCCTGCCCGCTCGGCGACCTCAAGGCGCTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCa < 2:1202638/150‑1 (MQ=255) ncACGCCCTGCCCGCTCGGCGACCTCAANGCGCTGGGCGAACTGCTGNTCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAgg > 1:391030/2‑150 (MQ=255) acacccTGCCCGCTCGGCGACCTCAAGGCGCTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTa > 1:2408757/4‑150 (MQ=255) aCGCCCTGCCCGCTCGGCGACCTCAAGGCGCTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACAGCCG‑GCGTAGCCTTCCTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTa < 1:1624805/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCCCGCTCGGCGACCTCAAGGCGCTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACa > 1:1991935/1‑150 (MQ=255) cccTGCCCGCTCGGCGACCTCAAGGCGCTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAg < 2:330152/150‑1 (MQ=255) cccTGCCCGCTCGGCGACCTCAAGGCGCTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCACTGCTCGA‑CCAGGCGGACATCGGACTCCCGCTTGACGGCTAGGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAg < 1:1854294/150‑1 (MQ=255) ccTGCCCGCTCGTCGACCTCAAGGCGCTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGc > 2:538468/1‑150 (MQ=255) tGCCCGCTCGGCGACCTCAAGGCGCTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCtt > 2:857808/1‑150 (MQ=255) cgtcTCGGCCACCTAAAGGTGCTGGGCGAATTGCTCATCCATCTCCACAGCCAGGACGAGCACCAGTCCCTGCTCACGACACTCACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGCCCTGGCCCGCCAGGTAGAGCTTGCa < 2:2309498/147‑1 (MQ=255) cGGCGACCTCAAGGCGCTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCaa < 1:207117/150‑1 (MQ=255) cGGCGACCTCAAGGCGCTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCaa < 2:1162119/150‑1 (MQ=255) aCCTCAAGGCGCTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCt < 2:2157352/150‑1 (MQ=255) aCCTCAAGGCGCTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCt < 1:1000783/150‑1 (MQ=255) cTCAAGGCGCTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTg‑g > 1:2376761/1‑150 (MQ=255) tCAAGGCGCTGGGCGAACTGCTGATCGATACCCACACCCAGCACGAGCACCAGTCCCTCCTCAAGACCGACCCCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑Ga < 1:1186761/150‑1 (MQ=255) aaGGCGCTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑At > 2:1910525/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAg < 1:241066/150‑1 (MQ=255) gcTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCTCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGAc < 1:1468654/150‑1 (MQ=255) ggggCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGAccc < 1:2230238/149‑1 (MQ=255) ggCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑c > 1:917135/1‑142 (MQ=255) ggCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑c < 2:917135/142‑1 (MQ=255) tgctgATAGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCctggagc < 1:1910525/150‑1 (MQ=255) gctgATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCctggagct < 1:339001/150‑1 (MQ=255) tgATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCctggagctgg > 1:1391340/1‑150 (MQ=255) tgATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCctggagctgg > 1:424014/1‑150 (MQ=255) aTCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCctggagctggag < 2:1604842/150‑1 (MQ=255) aTCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCctggagctggag > 2:300118/1‑150 (MQ=255) tcgacaGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCGGGCCAGGtc < 1:2408417/95‑2 (MQ=255) tcgacaGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCGGGCCAGGtc > 2:2408417/4‑97 (MQ=255) ccataggcagcACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCtctc > 2:2327423/8‑150 (MQ=255) ccACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCtctc < 1:1809513/150‑1 (MQ=255) ccACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCtctc > 2:1809513/1‑150 (MQ=255) cacaGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTcc > 1:28083/1‑150 (MQ=255) ccagcACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTc > 1:910925/1‑150 (MQ=255) cagcACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCg < 1:538468/150‑1 (MQ=255) cagcACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCg < 2:28083/150‑1 (MQ=255) gcACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCggg < 2:1383920/150‑1 (MQ=255) gcACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCggg > 1:1809631/1‑150 (MQ=255) gCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCaa > 2:611339/1‑138 (MQ=255) gCACCAGTCCCTGCCCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCaa < 1:611339/138‑1 (MQ=255) ccAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGagca > 1:333354/1‑150 (MQ=255) ccAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGagca > 1:842954/1‑150 (MQ=255) ccTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCGAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGa > 2:1626994/1‑101 (MQ=255) ccTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCGAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGa < 1:1626994/101‑1 (MQ=255) cTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCgg < 2:1423246/133‑1 (MQ=255) cTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCgg > 1:1423246/1‑133 (MQ=255) cTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGcgcc > 1:748962/1‑150 (MQ=255) cTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGcgcc > 1:1401669/1‑150 (MQ=255) tCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGcgcccgcc > 1:1947563/1‑150 (MQ=255) cGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGc < 1:1599294/124‑1 (MQ=255) cGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGc > 2:1599294/1‑124 (MQ=255) acacCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAgctgc < 2:1484920/150‑1 (MQ=255) acacCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAgctgc < 2:1809631/150‑1 (MQ=255) accca‑ccGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTc > 2:551169/1‑150 (MQ=255) ccca‑ccGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCa < 2:1368068/150‑1 (MQ=255) cca‑ccGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAg > 1:995152/1‑150 (MQ=255) a‑ccGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCctct > 2:746000/1‑105 (MQ=255) a‑ccGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCctct < 1:746000/105‑1 (MQ=255) a‑ccGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGcgacga < 1:1895696/121‑1 (MQ=255) a‑ccGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGcgacga > 2:1895696/1‑121 (MQ=255) a‑ccGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGtt < 2:1969511/150‑1 (MQ=255) tCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCa > 2:1921568/1‑150 (MQ=255) cTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACCAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTg < 2:1391340/150‑1 (MQ=255) tGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTgg < 2:2408757/150‑1 (MQ=255) ttGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGgaag > 2:1313465/1‑150 (MQ=255) tGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGgaaga > 2:765712/1‑150 (MQ=255) aCGAGTATGCCGGCGCCGTCGAACTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGGAAGAAc < 2:910925/150‑1 (MQ=255) cgcgtctGCCGGCCCCGGCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGGTGCGATATCCAGGTACG‑‑TGGTG‑GGGCGCGCCTCTCGACCTCGGGCGACGCACGGTCCGGCTGCGGCCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGGAAGAACt < 1:551169/144‑1 (MQ=255) gAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGGAAGAACTg > 2:785535/1‑150 (MQ=255) gTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGGAAGAACTGGa > 1:2258475/1‑150 (MQ=255) aTGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGGAAGAACTGGACa > 1:1874873/1‑150 (MQ=255) ggCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGGAAGAACTGGACAACCTc > 1:1651813/1‑150 (MQ=255) gTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGGAAGAACTGGACAACCTCGGCCTg > 1:1403898/1‑150 (MQ=255) tgtaCCTGGCGGGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGagc < 1:588629/87‑1 (MQ=255) tgtaCCTGGCGGGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGagc > 2:588629/4‑90 (MQ=255) taCCTGGCGGGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGGAAGAACTGGACAACCTCGGCCTGGGc > 1:1437812/2‑150 (MQ=255) aCCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGGAAGAACTGGACAACCTCGGCCTGGGCg > 1:853219/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGGAAGAACTGGACAACCTCGGCCTGGGCGa < 1:765712/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGGAAGAACTGGACAACCTCGGCCTGGGCGa < 2:1694959/150‑1 (MQ=255) ccTGCCCCGCCAGGTACAGCTCGCACCCAAGCGCTC‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACACGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCTGCTGCTCAGTTACCAGCTGTAAGAACTGGACAACCTCGGCCTGGGCGa < 2:522895/150‑1 (MQ=255) cTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGGAAGAACTGGACAACCTCGGCCTGGGCGAg < 1:2327423/150‑1 (MQ=255) cTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGGAAGAACTGGACAACCTCGGCCTGGGCGAg > 2:439462/1‑150 (MQ=255) tGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGGAAGAACTGGACAACCTCGGCCTGGGCGAGc > 2:173952/1‑150 (MQ=255) ggCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGGAAGAACTAGACAACCTCGGCCTGGGCGAGCa > 1:408733/1‑150 (MQ=255) ccGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGGAAGAACTGGACAACCTCGGCCTGGGCGAGCACGa > 2:645821/1‑150 (MQ=255) ccGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGGAAGAACTGGACAACCTCGGCCTGGGCGAGCACGa > 1:707066/1‑150 (MQ=255) ccGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGGAAGAACTGGACAACCTCGGCCTGGGCGAGCACGa > 1:1212115/1‑150 (MQ=255) | ATCAACGGCACGCCCTGCCCGCTCGGCGACCTCAAGGCGCTGGGCGAACTGCTGATCGATATCCACAGCCAGCACGAGCACCAGTCCCTGCTCAAGACCGACACCCA‑CCGTCGCCTGCTTGACGAGTATGCCGGCGCCGTCGACCTGGCCCGCCAGGTACAGCTTGCAGCCAAGCGCTG‑GA‑AT‑CAGACCCGCCTGGAGCTGGAGCGCCTCTCCAACTCGGGCGACGAGCAGCGCGCCCGCCACCAGCTGCTCAGTTACCAGCTGGAAGAACTGGACAACCTCGGCCTGGGCGAGCACGA > NC_002947/5378782‑5379080 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |