| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_002947 | 5,410,445 | G→C | 5.5% | A160G (GCC→GGC) | stcD ← | N‑methylproline demethylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,410,445 | 0 | G | C | 5.5% | 347.4 / 8.4 | 109 | A160G (GCC→GGC) | stcD | N‑methylproline demethylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (50/53); new base C (3/3); total (53/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.61e-01 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GCTTGCGAATGGCCGTGAGCACATCGAAGGTGAAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCGGGTTCCTGATTGTGGGAGGGCGACACCACCGGTAGCCAGTCGCCTTTGTCCC > NC_002947/5410296‑5410589 | gcTTGCGAATGGCCGTGAGCACATCGAAGGTGAAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCATTTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCcgg > 1:20914/1‑150 (MQ=255) gAATGGCCGTGAGCACATCGAAGGTGTAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCt < 2:660120/150‑1 (MQ=255) aaTGGCCGTGAGCACATCGAAGGTGAAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCtt > 1:2040322/1‑150 (MQ=255) aTGGCCGTGAGCACATCGAAGGTGAAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTc < 2:1165399/150‑1 (MQ=255) tGGCCGTGAGCACATCGAAGGTGAAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCa < 1:205622/150‑1 (MQ=255) tGGCCGTGAGCACATCGAAGGTGAAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGCCGGCCtgga < 2:1205242/150‑4 (MQ=255) ggCCGTGAGCACATCGAAGGTGAAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGCCGGCCtggat < 1:1458282/150‑5 (MQ=255) gCCGTGAGCACATCGAAGGTGAAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAGCTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATg < 2:516047/150‑1 (MQ=255) tCGAAGGTGAAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGcggca > 2:2192028/1‑150 (MQ=255) tCGAAGGTGAAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGcggca > 1:846160/1‑150 (MQ=255) tCGAAGGTGAAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGcggca < 2:2040322/150‑1 (MQ=255) gAAGGTGAAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGcggcatc < 2:358553/150‑1 (MQ=255) gAAGGTGAAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGcggcatc > 1:1195144/1‑150 (MQ=255) gAAGGTGAAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGcggcatc > 2:578125/1‑150 (MQ=255) gAAGGTGAAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGcggcatc > 1:1882065/1‑150 (MQ=255) aGGTGAAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTcggc < 1:965506/142‑1 (MQ=255) gTGAAGCGCCGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCTCTGCCAGTTCGTGGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGcggcatcagca < 1:1667425/150‑1 (MQ=255) gTGAAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGcggcatcggca > 1:152649/1‑150 (MQ=255) tGAAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGcggcatcggcat > 1:923472/1‑150 (MQ=255) gAAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATa > 1:986823/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATc > 2:1984250/1‑150 (MQ=255) ggCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGaa < 2:1114920/150‑1 (MQ=255) gCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAat > 2:403122/1‑150 (MQ=255) ggTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAatga > 1:721892/1‑150 (MQ=255) gTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAatgat < 1:1609959/150‑1 (MQ=255) ttGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCg > 2:823052/1‑150 (MQ=255) gCAGCTGGCCGCCGTACCGCCCTTCCAGTTGGTTGGTCAGTGGAGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGt < 2:387535/150‑1 (MQ=255) aGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCg > 2:1207080/1‑150 (MQ=255) ttcgccgTACGGCCCATCCAGATCGTTGGTACATGGCGCCCAGAACTGATCACTCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTAGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTc < 2:1109809/148‑1 (MQ=255) gccgccGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATcgc < 1:1295773/131‑1 (MQ=255) gccgccGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATcgc > 2:1295773/1‑131 (MQ=255) gccgccGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTc > 1:1004994/1‑150 (MQ=255) ccgccgTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTcc < 2:721892/150‑1 (MQ=255) gccgTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCa < 1:470451/150‑1 (MQ=255) tACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGcggcatcgg < 2:1391563/115‑1 (MQ=255) tACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGcggcatcgg > 1:1391563/1‑115 (MQ=255) tACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGt > 2:1548755/1‑150 (MQ=255) gCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCAt > 1:1756832/1‑94 (MQ=255) gCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCAt < 2:1756832/94‑1 (MQ=255) gCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCaa < 2:846160/150‑1 (MQ=255) cTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCAt > 2:1181395/1‑91 (MQ=255) cTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCAt < 1:1181395/91‑1 (MQ=255) cTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAgct < 1:578125/150‑1 (MQ=255) cAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCtt < 2:1668679/150‑1 (MQ=255) aGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTg > 2:786600/1‑150 (MQ=255) 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cAGTGGCCACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTTGATGCCATCCATGCCGGCGGCCTACCCGCGTGCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCTCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGTcgcg < 2:327364/150‑1 (MQ=255) tGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGgtg > 2:1785768/1‑150 (MQ=255) gCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGaa < 1:464644/99‑1 (MQ=255) gCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGaa > 2:464644/1‑99 (MQ=255) gACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCg < 1:1736921/150‑1 (MQ=255) gACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCg > 2:2057480/1‑150 (MQ=255) gACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCg > 2:1736921/1‑150 (MQ=255) aCCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCgg > 2:261784/1‑150 (MQ=255) aCCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCgg < 1:1207080/150‑1 (MQ=255) aCCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCgg < 1:578044/150‑1 (MQ=255) cAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAg > 2:2010909/1‑135 (MQ=255) 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cAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCGGGTTCCTGATTGTGGGa < 1:823052/150‑1 (MQ=255) gTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCgg < 2:847183/131‑1 (MQ=255) gTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCgg > 1:847183/1‑131 (MQ=255) tGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCGGGTTCCTGATTGTGGGAGGGc < 1:1548755/150‑1 (MQ=255) ggCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGAGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGTGGTGTCCGGGTTCCTGATTGTGCGAGGGCGAcaccac < 2:1091708/150‑1 (MQ=255) gCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTAATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCGGGTTCCTGATTGTGGGAGGGCGACACCACCGGTa < 2:1407325/150‑1 (MQ=255) aGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCGGGTTCCTGATTGTGGGAGGGCGACACCACCGGTAGc > 2:668463/1‑150 (MQ=255) aGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCGGGTTCCTGATTGTGGGAGGGCGACACCACCGGTAGc > 1:398800/1‑150 (MQ=255) gATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCGGGTTCCTGATTGTGGGAGGGCGACACCACCGGTAGCCAGTc > 1:106214/1‑150 (MQ=255) tGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCGGGTTCCTGATTGTGGGAGGGCGACACCACCGGTAGCCAGTCGc < 2:20914/150‑1 (MQ=255) gCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCGGGTTCCTGATTGTGGGAGGGCGacac > 2:1877360/1‑132 (MQ=255) gCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCGGGTTCCTGATTGTGGGAGGGCGacac < 1:1877360/132‑1 (MQ=255) catgaaGGCCGCCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCGGGTTCCTGATTGTGGGa > 1:2196873/6‑121 (MQ=255) catgaaGGCCGCCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCGGGTTCCTGATTGTGGGa < 2:2196873/116‑1 (MQ=255) atgaaGGCCGCCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCGGGTTCCTGATTGTGGGAGGGCGACACCACCGGTAGCCAGTCGCCttt > 1:1913040/5‑150 (MQ=255) aTCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCGGGTTCCTGATTGTGGGAGGGCGACACCACCGGTAGCCAGTCGCCttt > 1:1257137/1‑150 (MQ=255) aTCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCGGGTTCCTGATTGTGGGAGGGCGACACCACCGGTAGCCAGTCGCCttt < 1:281312/150‑1 (MQ=255) tCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCGGGTTCCTGATTGTGGGAGGGCGACACCACCGGTAGCCAGTCGCCTTTg < 1:1360942/150‑1 (MQ=255) gaaGGCCGCCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGTGGGTTCCTGATTGTGGGAGGGCGACACCACCGGTAGCCAGTCGCCTTTGt > 2:1777649/3‑150 (MQ=255) cAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCGGGTTCCTGATTGTGGGAGGGCGACACCACCGGTAGCCAGTCGCCTTTGTc > 2:310397/1‑150 (MQ=255) ggCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCGGGTTCCTGATTGTGGGAGGGCGACACCACCGGTAGCCAGTCGCCTTTGTccc > 1:1220584/1‑150 (MQ=255) | GCTTGCGAATGGCCGTGAGCACATCGAAGGTGAAGCGCAGGCGGTTTTGCAGCGAGCCGCCGTACGGCCCTTCCAGTTCGTTGGTCAGTGGCGACCAGAACTGGTCCATCAAGTGGCCGTAGGCTTGCAGCTCGATGCCATCCAGGCCGGCGGCCTTCATGCGTTCGGCGGCATCGGCATAATCGCGAATGATGCGGTCGATGTCCCACTGTTCAAGCTGCTTGGGGAAGGCGCGGTGTGCGGGTTCCTGATTGTGGGAGGGCGACACCACCGGTAGCCAGTCGCCTTTGTCCC > NC_002947/5410296‑5410589 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |