| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 503,595 | T→C | 7.5% | F208S (TTT→TCT) ‡ | PP_0414 → | polyamine ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 503,595 | 0 | T | C | 7.5% | 272.0 / 8.3 | 93 | F208S (TTT→TCT) ‡ | PP_0414 | polyamine ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (49/37); new base C (4/3); total (53/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.72e-01 | |||||||||||
TCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTG > NC_002947/503447‑503743 | tCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGttt < 2:569141/150‑1 (MQ=255) gCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑Ac < 1:1246881/150‑1 (MQ=255) gCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCGTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑Ac > 2:1565860/1‑150 (MQ=255) cGCTGCAGGGGTTCAACTACGATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAgg < 1:418657/150‑1 (MQ=255) tGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAggtgg > 1:348006/1‑150 (MQ=255) ggTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCCCCTCGTTTG‑TCGAGGTGGTGGTGa < 2:979015/150‑1 (MQ=255) aaCTACAGTCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGGTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTg < 2:841020/150‑1 (MQ=255) aaCTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGttt > 2:168229/1‑129 (MQ=255) aaCTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGttt < 1:168229/129‑1 (MQ=255) aaCTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTg > 2:431657/1‑150 (MQ=255) aCTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTCAA‑ACGAggtggcaaa < 2:2347391/142‑5 (MQ=255) aCTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTCAA‑ACGAggtggcaaa > 1:2347391/1‑138 (MQ=255) aCTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCATCCTTGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGt < 1:1643599/150‑1 (MQ=255) tACCATATGGTGCGCGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTTGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTc < 1:290048/150‑1 (MQ=255) aCAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTcc > 1:1505992/1‑150 (MQ=255) aaTCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGAc > 2:2236097/1‑140 (MQ=255) aaTCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGAc < 1:2236097/140‑1 (MQ=255) tCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGt < 1:1556949/143‑1 (MQ=255) tCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGt > 2:1556949/1‑143 (MQ=255) tCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTc < 2:1755796/145‑1 (MQ=255) tCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTc > 1:1755796/1‑145 (MQ=255) cTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCgcc > 1:1035739/1‑150 (MQ=255) ggTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCgccgg < 1:2272389/150‑1 (MQ=255) tgcgtgcgGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTAGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATCGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGGGGTGGTGACGCTGTTCCTCgccgggc > 1:1946948/1‑150 (MQ=255) gtgcgGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCgccgggccgg > 2:2369721/1‑150 (MQ=255) gcggcCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAg < 2:348006/150‑1 (MQ=255) gcggcCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAg < 1:60148/150‑1 (MQ=255) ccAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTc > 1:1094026/1‑131 (MQ=255) ccAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTc < 2:1094026/131‑1 (MQ=255) cAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAggtggtgg < 2:1444524/116‑1 (MQ=255) cAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAggtggtgg > 1:1444524/1‑116 (MQ=255) gggCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGGTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑Gcc > 1:1255334/1‑150 (MQ=255) gcgcTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCAGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCcgc > 2:884353/1‑150 (MQ=255) gttttaCCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCCCCTCGCTTG‑ACGGGGTGGTCGTCAGCCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCCACACT‑‑GCCGC‑gg < 2:84552/145‑1 (MQ=255) gcTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAg < 2:1138788/135‑1 (MQ=255) gcTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAg > 1:1138788/1‑135 (MQ=255) ttCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCa > 1:205219/1‑150 (MQ=255) aCCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGAt > 2:2350820/1‑150 (MQ=255) ctctGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGt > 1:568190/1‑150 (MQ=255) tctGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGtt > 1:407327/1‑150 (MQ=255) gctgGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAg < 2:1035739/150‑1 (MQ=255) ctgGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGc < 1:1407589/150‑1 (MQ=255) gCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCGTCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGTGCGAGG‑GGTGGTGACGCTGTTCGTCGCCGGGCCGGAGCCGGGAATACT‑‑GCTGC‑TGCAGATGTTCAGCGGt > 1:1852977/1‑150 (MQ=255) gCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTCAA‑ACGAggtgg > 1:226901/1‑88 (MQ=255) gCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTCAA‑ACGAggtgg < 2:226901/88‑1 (MQ=255) tttCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTAt > 1:867638/1‑150 (MQ=255) aCCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTg > 2:896983/1‑150 (MQ=255) cccTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGa < 1:2369721/150‑1 (MQ=255) ccGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCt > 1:2374331/1‑143 (MQ=255) ccGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCt < 2:2374331/143‑1 (MQ=255) cGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGa > 2:1665816/1‑150 (MQ=255) cGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGa > 1:468600/1‑150 (MQ=255) 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tttgccACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACt > 1:630617/1‑65 (MQ=255) gccACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGtgttg < 1:2359578/150‑1 (MQ=255) ccACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTTTGCCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTGCTCGGtgttgt > 1:633266/1‑150 (MQ=255) ccACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGc > 2:1929071/1‑129 (MQ=255) ccACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGc < 1:1929071/129‑1 (MQ=255) ccACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGtgttgt > 2:1145623/1‑150 (MQ=255) ccACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGtgttgt < 1:2058968/150‑1 (MQ=255) ccACCTCGTCAA‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGtgttgt < 1:1794889/150‑1 (MQ=255) cACCTCGTCAA‑ACGAGGTGGTGGTAACGGTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCGGCTGTTAAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGtgttgtg > 2:548442/1‑149 (MQ=255) aCCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAg < 1:573411/77‑1 (MQ=255) aCCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAg > 2:573411/1‑77 (MQ=255) ccTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTtgc > 1:293305/1‑150 (MQ=255) ccTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTtgc > 1:1779153/1‑150 (MQ=255) ccTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTtgc > 2:1475952/1‑150 (MQ=255) cTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTtgct > 2:2028404/1‑150 (MQ=255) cTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTtgct > 1:2047593/1‑150 (MQ=255) cGTTTG‑ACGCGGTGGTTGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACCCTAGGGTGCTGGC‑GAAG‑‑CTGGAGTAGTAGCGAGAACCGGAGAACGCCCATTGCCGCAGCGGCGGCATTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTtgctgc < 1:2350820/150‑1 (MQ=255) cGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTtgctgc < 1:2086356/150‑1 (MQ=255) cGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTtgctgc < 2:967996/150‑1 (MQ=255) gTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTgctgct > 2:424496/1‑150 (MQ=255) gTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCAGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTgctgct > 2:66260/1‑150 (MQ=255) tttG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGctgctg > 1:2165125/1‑150 (MQ=255) | TCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTG‑ACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACT‑‑GCCGC‑GGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGAGAACCTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTG > NC_002947/503447‑503743 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |