| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,507,063 | C→A | 5.9% | P92P (CCC→CCA) | cycA → | D‑alanine/beta‑alanine/D‑serine/glycine permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,507,063 | 0 | C | A | 5.9% | 279.7 / 2.7 | 91 | P92P (CCC→CCA) | cycA | D‑alanine/beta‑alanine/D‑serine/glycine permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/44); new base A (2/4); total (43/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.80e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
CATCAGCCTGGCCGGGCCATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGACCTGCGTAGGGCTGCTG > NC_002947/5506916‑5507210 | cATCAGCCTGGCCGGGCCATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTg < 2:44525/150‑1 (MQ=255)cATCAGCCTGGCCGGGCCATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCCTCACGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTg < 1:1131692/150‑1 (MQ=255) aTCAGCCTGGCCGGGCCATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTgg > 1:1874438/1‑150 (MQ=255) aTCAGCCTGGCCGGGCCATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTgg > 1:375421/1‑150 (MQ=255) cAGCCTGGCCGGGCCATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGc > 1:2252561/1‑150 (MQ=255) ccccTGGGCGCGCCATCGATCATCTTCATCGACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGcc < 1:1705667/148‑1 (MQ=255) cTGGCCGGGCCATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCTCCGACCTGCTCGGCCCAGGGGCCgag < 1:187308/150‑3 (MQ=255) tGGCCGGGCCATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCAGGGGCCgagc < 2:2151401/150‑4 (MQ=255) tGGCCGGGCCATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTCTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGcc > 2:2348648/1‑146 (MQ=255) tGGCCGGGCCATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTCTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGcc < 1:2348648/146‑1 (MQ=255) ggCCGGGCCATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCAGGGGCCgagca < 1:242328/150‑5 (MQ=255) gCCATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTAc > 2:1756379/1‑150 (MQ=255) gCCATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTAc < 2:2049501/150‑1 (MQ=255) ccATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTAct < 1:1366660/150‑1 (MQ=255) tCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAAAACCACCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTActggc < 1:1956963/150‑1 (MQ=255) gATCATCTTCGTCTCCATGAGTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTActggctg > 2:101795/1‑150 (MQ=255) gATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATTCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTActggctg > 2:1022282/1‑150 (MQ=255) ttCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTGTCCGCCGACCTGCTCGTCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTAc > 2:885227/1‑150 (MQ=255) aCATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTct > 1:386969/1‑150 (MQ=255) gATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTctgctg < 2:1721677/150‑1 (MQ=255) tATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGggt < 2:1073894/150‑1 (MQ=255) tCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGggtgg > 1:1407420/1‑150 (MQ=255) gCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCAGGGGCCgagc < 1:976135/111‑4 (MQ=255) gCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCAGGGGCCgagc > 2:976135/1‑108 (MQ=255) aTGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGc > 1:453325/1‑150 (MQ=255) aTGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGAATTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGc > 1:266694/1‑150 (MQ=255) gCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCAt < 2:2234690/150‑1 (MQ=255) cTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCAtt < 2:608361/150‑1 (MQ=255) tGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTg > 2:43224/1‑150 (MQ=255) ttcttcGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGcc > 1:1529096/1‑150 (MQ=255) ttcGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGAc < 1:318593/150‑1 (MQ=255) tcGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACg < 2:1309276/150‑1 (MQ=255) tCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGAc < 1:1693602/109‑1 (MQ=255) tCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGAc > 2:1693602/1‑109 (MQ=255) aTGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTc < 1:778814/150‑1 (MQ=255) 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tgctgTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGggt > 2:2358640/1‑103 (MQ=255) tgctgTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGggt < 1:2358640/103‑1 (MQ=255) tgTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCt < 1:1311772/150‑1 (MQ=255) gTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTg < 2:1529096/150‑1 (MQ=255) tCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTgg < 2:375421/150‑1 (MQ=255) gAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGtt > 1:1445896/1‑150 (MQ=255) aaCCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTc < 1:1754089/150‑1 (MQ=255) aaCCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTc > 1:1106136/1‑150 (MQ=255) aCCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTcc > 1:763646/1‑150 (MQ=255) cTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGACGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTcccc < 2:1874438/150‑1 (MQ=255) tGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCa > 1:2186465/1‑96 (MQ=255) tGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCa < 2:2186465/96‑1 (MQ=255) aaCTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGAc < 1:1124158/150‑1 (MQ=255) aCAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGc > 1:27348/1‑150 (MQ=255) cAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATcgc < 1:2294445/117‑1 (MQ=255) cAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATcgc > 2:2294445/1‑117 (MQ=255) cAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGCCCTGcc > 2:399437/1‑150 (MQ=255) aGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATcgccgc < 2:1901133/118‑1 (MQ=255) 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ttCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCt < 2:1445896/150‑1 (MQ=255) ccgccgACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGa < 2:453325/150‑1 (MQ=255) gccgACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGATGGATTTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGAcc > 1:561619/1‑150 (MQ=255) gACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATcgcc < 2:141484/93‑1 (MQ=255) gACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATcgcc > 1:141484/1‑93 (MQ=255) gACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGACCTGc < 1:751668/150‑1 (MQ=255) gACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGACCTGc < 1:101795/150‑1 (MQ=255) ctccTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGGTTGTTTTATTT‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGACCTGc < 2:2371556/148‑1 (MQ=255) atcttGCTCGGCCACTGGGCGGGCTCATCTACCGGCGCACCCGACTG‑GGGTTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACCCCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGACCTGc < 2:265161/146‑1 (MQ=255) ccTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGTATACCGGCGCTGACCTGCGt < 2:27348/150‑1 (MQ=255) cTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGAAAATCCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGACCTGCgag > 1:2371556/1‑148 (MQ=255) gCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGgcgc < 1:514075/137‑1 (MQ=255) gCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGgcgc > 2:514075/1‑137 (MQ=255) gCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGACCTGCgagat > 1:265161/1‑146 (MQ=255) gccGGCCCAGGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGACCTGCGTAggg > 1:1806126/3‑150 (MQ=255) cTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGACCTGCGTAggg < 1:536195/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGACCTGCGTAggg < 1:2228791/150‑1 (MQ=255) cccTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATcgccgc > 1:2098594/1‑83 (MQ=255) cccTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATcgccgc < 2:2098594/83‑1 (MQ=255) cccTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGc > 2:2368399/1‑112 (MQ=255) cccTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGc < 1:2368399/112‑1 (MQ=255) cccTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCATTTGATACCGGCGCTGACCTTCGTAGGgctgctg > 2:997866/1‑150 (MQ=255) | CATCAGCCTGGCCGGGCCATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTG‑GTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGACCTGCGTAGGGCTGCTG > NC_002947/5506916‑5507210 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |