| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,554,974 | 0 | C | T | 6.8% | 301.6 / 8.2 | 102 | intergenic (‑31/+140) | PP_4886/PP_4887 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (48/47); new base T (2/5); total (50/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.37e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CTTATCCAGTGCTTCGCCAGTGATTTCCGCGATATGAACATAAGCATCGAAAGCCATGCTTACCTCTCCCTGGTAAAGGTTCGGCTGATAACGACGATGTTCAGACATCGTCATCCTGAGGTTGCTCCCGAAGTAAAACGGCGGCCGGTACCGACCGCCTTCAGGCTCAATACAACACTAACCCCTATGTCAGCCCTTGCAACAGCAAACGCCCTATCAAGGAATATTTGGGAAATCTCCTACAGATTCGACGATGATGACGATTTGGTCAGTTTCGATGCTGCTTAAAGCTTC > NC_002947/5554830‑5555123 | cTTATCCAGTGCTTCGCCAGTGATTTCCGCGATATGAACATAAGCATCGAAAGCCATGCTTACCTCTCCCTGGTAAAGTTTCGGCTGATAACGACGATGTTCAGACATCGTCATCCTGAGGTTGCTCCCGAAGTAAAACGGCGGCCGGTa < 1:1565157/150‑1 (MQ=255) ttATCCAGTGCTTCGCCAGTGATTTCCGCGATATGAACATAAGCATCGAAAGCCATGCTTACCTCTCCCTGGTAAAGGTTCGGCTGATAACGACGATGTTCAGACATCGTCATCCTGAGGTTGCTCCCGAAGTAAAACGGCGGCCGGTac > 1:1163053/1‑150 (MQ=255) ttATCCAGTGCTTCGCCAGTGATTTCCGCGATATGAACATAAGCATCGAAAGCCATGCTTAACTCTCCCTGGTAAAGGTTCGGCTGATAACGACGATGTTCAGACATCGTCATCCTGAGGTTGCTCCCGAAGTAAAACGGCGGCCGGTac > 1:865182/1‑150 (MQ=255) 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CTTATCCAGTGCTTCGCCAGTGATTTCCGCGATATGAACATAAGCATCGAAAGCCATGCTTACCTCTCCCTGGTAAAGGTTCGGCTGATAACGACGATGTTCAGACATCGTCATCCTGAGGTTGCTCCCGAAGTAAAACGGCGGCCGGTACCGACCGCCTTCAGGCTCAATACAACACTAACCCCTATGTCAGCCCTTGCAACAGCAAACGCCCTATCAAGGAATATTTGGGAAATCTCCTACAGATTCGACGATGATGACGATTTGGTCAGTTTCGATGCTGCTTAAAGCTTC > NC_002947/5554830‑5555123 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |