| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,609,051 | G→C | 5.5% | P200A (CCT→GCT) | waaA ← | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonic acid transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,609,051 | 0 | G | C | 5.5% | 291.2 / 6.1 | 93 | P200A (CCT→GCT) | waaA | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonic acid transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (42/44); new base C (3/2); total (46/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.39e-01 | |||||||||||
GGCATCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTGGCCAGCGCCA > NC_002947/5608902‑5609200 | ggCATCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAgg < 2:1324770/150‑1 (MQ=255)ggCATCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAACGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCACGCCGCACTTGATCGAGGCGGTGACTTGCCCGCGCTCAgg > 2:2084453/1‑150 (MQ=255) gCATCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAggg > 2:465966/1‑150 (MQ=255) gCATCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAggg > 2:2345641/1‑150 (MQ=255) aTCTTCACCGTCGTGGGGGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCGCCCAACTGTTCACGAAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTTGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGGCTGTCAAGCGCGCAGGGCg > 2:1187893/1‑150 (MQ=255) tCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGt < 1:465966/150‑1 (MQ=255) ttCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGc > 2:859747/1‑150 (MQ=255) gtcgtGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCCCAGGGCGTGCACCCAg < 2:1621501/150‑1 (MQ=255) gtGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGAAGATAACGTGCGCGCGCGCAGGGCGTTCACCCAGGTc > 2:633181/1‑150 (MQ=255) gTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACgg < 2:1062459/150‑1 (MQ=255) ccTGTCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAAATGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGaa < 2:1600123/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCAcc < 2:511465/137‑1 (MQ=255) cTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCAcc > 1:511465/1‑137 (MQ=255) cTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAg < 1:1159845/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAgc > 1:31594/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAgc > 1:1858792/1‑150 (MQ=255) gcAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTgg < 2:166004/150‑1 (MQ=255) cacacaGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCg > 1:920219/1‑150 (MQ=255) cacacaGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCg > 2:1824881/1‑150 (MQ=255) acaGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGtt > 2:2180290/1‑150 (MQ=255) caGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGttt < 1:1842126/150‑1 (MQ=255) aGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGTCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTc > 1:1967628/1‑150 (MQ=255) aGGGCGCCCGCCGCCCCCCACCTGTTCCCGCACTCCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGCTCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCCTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTc < 1:1187893/150‑1 (MQ=255) gggCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCg < 1:1936192/150‑1 (MQ=255) gggCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCg > 1:1961069/1‑150 (MQ=255) gggCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGACGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCg < 1:1751403/150‑1 (MQ=255) cgcTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTc < 2:1858792/150‑1 (MQ=255) cgcTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTc < 1:395502/150‑1 (MQ=255) tGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGc < 1:1277708/150‑1 (MQ=255) tGGCCGCCCCCCAACAGGGCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGc > 1:2372841/1‑150 (MQ=255) ccAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCa > 2:1605166/1‑150 (MQ=255) ccAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCa > 2:2085554/1‑150 (MQ=255) ccAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCa < 2:1622906/150‑1 (MQ=255) cAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGTTCGAACTTGCTCGAGCGGGGTACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAg < 2:2372841/150‑1 (MQ=255) tGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGGAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTc > 2:1645742/1‑150 (MQ=255) gTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCa > 1:897150/1‑150 (MQ=255) aCGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCAtctc > 2:1940849/1‑150 (MQ=255) gCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTc < 2:1110918/97‑1 (MQ=255) gCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTc > 1:1110918/1‑97 (MQ=255) gCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCgg > 2:1784935/1‑150 (MQ=255) cAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGc < 1:239107/150‑1 (MQ=255) aTGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCa < 1:1645742/150‑1 (MQ=255) tGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAg > 1:1349722/1‑150 (MQ=255) cgTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCgg < 1:334439/150‑1 (MQ=255) cgTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCgg < 1:182290/150‑1 (MQ=255) tGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGt < 2:1961069/150‑1 (MQ=255) gcagcaGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCa > 2:289765/1‑150 (MQ=255) agcTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTg < 1:1784935/150‑1 (MQ=255) agcTGGTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTg < 1:410027/150‑1 (MQ=255) ttCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGTGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCaaa > 1:904406/1‑150 (MQ=255) ttCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCg > 1:1986196/1‑88 (MQ=255) ttCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCg < 2:1986196/88‑1 (MQ=255) ttCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCaaa < 1:2085554/150‑1 (MQ=255) ttCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCaaa < 2:1144827/150‑1 (MQ=255) tcgATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCg < 2:1165893/117‑1 (MQ=255) 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aCGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTg > 2:215261/1‑150 (MQ=255) aCGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTg > 2:1764571/1‑150 (MQ=255) aCGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTg < 1:2345641/150‑1 (MQ=255) gcgcTCAGGGCGTGCACGCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGCCTCATCTCAGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTGGc < 2:1203345/150‑1 (MQ=255) gcgcTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCt < 1:2047664/99‑1 (MQ=255) gcgcTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCt > 2:2047664/1‑99 (MQ=255) gcTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTGGCCa < 1:1824881/150‑1 (MQ=255) gcTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTGGCCa < 2:402715/150‑1 (MQ=255) tCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAgcgc > 1:489352/1‑105 (MQ=255) tCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAgcgc < 2:489352/105‑1 (MQ=255) tCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAgc > 2:277532/1‑103 (MQ=255) tCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAgc < 1:277532/103‑1 (MQ=255) aGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTGGCCAgcgc > 1:1768702/1‑150 (MQ=255) gggCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTGGCCAGCGcc > 1:1696728/1‑150 (MQ=255) ggCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTGGCCAGCGCCa < 1:1940849/150‑1 (MQ=255) ggCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTGGCCAGCGCCa > 2:1327794/1‑150 (MQ=255) | GGCATCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGATCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTGGCCAGCGCCA > NC_002947/5608902‑5609200 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |