| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,630,662 | T→C | 5.3% | G47G (GGT→GGC) | putA → | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,630,662 | 0 | T | C | 5.3% | 226.8 / 2.3 | 76 | G47G (GGT→GGC) | putA | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/37); new base C (2/2); total (36/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.16e-01 | |||||||||||
GGATAAGAAATGGCGACTACCACCCTTGGGGTCAAACTCGACGACCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTA > NC_002947/5630513‑5630811 | ggATAAGAAATGGCGACTACCACCCTTGGGGTCAAACTCGACGACCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGggtggt < 2:1485553/150‑1 (MQ=255) aTAAGAAATGGCGACTACCACCCTTGGGGTCAAACTCGACGACCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACACCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGggtggt < 1:1803432/148‑1 (MQ=255) aTAAGAAATGGCGACTACCACCCTTGGGGTCAAACTCGACGACCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACACCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGggtggt > 2:1803432/1‑148 (MQ=255) gAAATGGCGACTACCACCCTTGGGGTCAAACTCGACGACCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCAcc < 1:952640/150‑1 (MQ=255) gAAATGGCGACTACCACCCTTGGGGTCAAACTCGACGACCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCAcc > 2:2169542/1‑150 (MQ=255) aaTGGCGACTACCACCCTTGGGGTCAAACTCGACGACCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCt < 2:1547017/150‑1 (MQ=255) tGGCGACTACCACCCTTGGGGTCAAACTCGACGACCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGa > 2:118305/1‑150 (MQ=255) tACCACCCTTGGGGCCAAACTCGACGACCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACt > 2:1295916/1‑150 (MQ=255) accaccCTTGGGGTCAAACTCGACGACCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTc < 2:746544/150‑1 (MQ=255) ccaccCTTGGGGTCAAACTCGACGACCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGCGGTGCCACCCTGACCGAACTCa > 1:1415197/1‑150 (MQ=255) ccTTGGGGTCAAACTCGACGACCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCTATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACgg < 2:1559484/150‑1 (MQ=255) ttGGGGTCAAACTCGACGACCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTc > 2:1048599/1‑150 (MQ=255) tGGGGTCAAACTCGACTACCCGACCCGTGAGCGCATCAAAGCAGCTGCGCAGTCAATCGCCCACACGCCTACCACGTTGATCAAGCGAACGATCGGCAGTTACCGTGAGGGGCACGAGGGTGGTTCCACCCTGACCGACCTCAACGATCa > 2:879893/1‑150 (MQ=255) ggTCAAACTCGACGACCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATga > 2:1261529/1‑149 (MQ=255) tCAAACTCGACGACCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCa < 1:1295916/150‑1 (MQ=255) aaaCTCGACGACCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGc > 2:1575404/1‑150 (MQ=255) aaaCTCGACGACCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGc > 2:623957/1‑150 (MQ=255) aaCTCGACGACCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCa < 1:623957/150‑1 (MQ=255) aCTCGACGACCCGCCCCGTGACCGACTCCAAGCCGCTGCGCCGTCCAACCACCGCCCGCATCCCTGGTTGATCAAGCAAGCGCACTTCAATTACCTGGAGAAGCCCGAGGGTGATACCACCCTAACCGAACTCAACGGACATGCCACCaa > 2:1543482/1‑150 (MQ=255) cgacgaCCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGTAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCCACCTGACCGAAGTCAACGGTCATGCCAGCAAccc < 1:1261529/150‑1 (MQ=255) gacgacCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCg > 1:461663/1‑150 (MQ=255) ccgacccgTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCcgac > 1:1813507/1‑150 (MQ=255) ccgacccgTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCcgac < 2:461663/150‑1 (MQ=255) gacccgTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCcgacga < 1:1048599/150‑1 (MQ=255) gacccgTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCcgacga < 1:118305/150‑1 (MQ=255) cGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGaa < 1:1864838/150‑1 (MQ=255) gACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAg > 1:1601716/1‑150 (MQ=255) gACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGACCGACGATGCCGGTGAAg > 2:2103915/1‑150 (MQ=255) cTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTc > 1:518407/1‑150 (MQ=255) cAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGCGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCa < 2:1415197/150‑1 (MQ=255) aaaGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAg > 2:2235111/1‑150 (MQ=255) cagcagcTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAgg > 2:1658131/2‑150 (MQ=255) aaGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAgg > 2:50906/1‑150 (MQ=255) gcagcTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGcc < 2:1441295/150‑1 (MQ=255) gcTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGAc < 1:2169542/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGCACCACCCtcga > 1:1040050/1‑87 (MQ=255) tGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGCACCACCCtcga < 2:1040050/90‑4 (MQ=255) cgcAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACcacg < 2:462868/150‑2 (MQ=255) cAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGc < 1:388218/150‑1 (MQ=255) aGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGcc > 2:2071468/1‑150 (MQ=255) tCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGccac < 1:273669/150‑1 (MQ=255) cGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGGCCACAGCCACCAGTg < 2:1601716/150‑1 (MQ=255) cGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTTGAGAATCTCGAGGGTGGTTCTACCCTGACCGATCTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCGTGCCACAGCCACCAGTGCTTc > 2:606128/1‑150 (MQ=255) cGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGCGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTc > 1:1499347/1‑150 (MQ=255) aCGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTc < 1:377208/150‑1 (MQ=255) aCGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGCGGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTc < 1:1234611/150‑1 (MQ=255) ccTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGaa < 1:131507/150‑1 (MQ=255) ccTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGaa > 2:1149043/1‑150 (MQ=255) cTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAAt < 2:2174022/150‑1 (MQ=255) tCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAAtt > 2:1500567/1‑150 (MQ=255) cACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAAccc < 2:1376598/92‑1 (MQ=255) cACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGCTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAAccc > 1:1376598/1‑92 (MQ=255) cTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGc > 1:2021614/1‑150 (MQ=255) gTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCGCAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCga < 1:1575404/150‑1 (MQ=255) gTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCga < 2:2021614/150‑1 (MQ=255) gTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGACCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCga < 1:2103915/150‑1 (MQ=255) tGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCgaga < 1:1658131/150‑1 (MQ=255) gATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGagag > 2:719577/1‑150 (MQ=255) gATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGagag > 2:874330/1‑150 (MQ=255) tCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCTAATTTGCCGAGATCa > 2:420208/1‑150 (MQ=255) aagcaagcGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATc < 1:719577/150‑1 (MQ=255) aagcGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGc > 2:1379459/1‑150 (MQ=255) agcGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCACCCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGcc < 1:1529040/150‑1 (MQ=255) agcGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGcc < 1:1149043/150‑1 (MQ=255) gATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGt > 2:277808/1‑116 (MQ=255) gATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGt < 1:277808/116‑1 (MQ=255) ttCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCg < 1:874330/150‑1 (MQ=255) tCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCgg < 1:2235111/150‑1 (MQ=255) aaTTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGc < 1:1439757/92‑1 (MQ=255) aaTTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGc > 2:1439757/1‑92 (MQ=255) cTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTgcgc > 2:1701932/1‑150 (MQ=255) gaAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCgg > 1:776436/1‑137 (MQ=255) gaAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCgg < 2:776436/137‑1 (MQ=255) gaAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGc < 2:1813507/150‑1 (MQ=255) gCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTcc < 1:983825/74‑1 (MQ=255) gCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTcc > 2:983825/1‑74 (MQ=255) tcaGGGTGGCACCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGTTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTgcg < 2:2072384/136‑1 (MQ=255) tcaGGGTGGCACCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGTTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTgcg > 1:2072384/3‑138 (MQ=255) aGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCAccg < 2:1499347/150‑1 (MQ=255) tgCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTa < 1:50906/150‑1 (MQ=255) | GGATAAGAAATGGCGACTACCACCCTTGGGGTCAAACTCGACGACCCGACCCGTGAGCGACTCAAAGCAGCTGCGCAGTCCATCGACCGCACGCCTCACTGGTTGATCAAGCAAGCGATCTTCAATTACCTGGAGAAGCTCGAGGGTGGTGCCACCCTGACCGAACTCAACGGTCATGCCAGCAACCCGGCCGACGATGCCGGTGAAGTCCAGGCCGACCACAGCCACCAGTGCTTCCTCGAATTTGCCGAGAGCATCTTGCCGCAGTCGGTACTGCGCTCGGCGATCACCGCCGCCTA > NC_002947/5630513‑5630811 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |