| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,661,466 | T→G | 8.3% | V347G (GTC→GGC) | ligB → | DNA ligase B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,661,466 | 0 | T | G | 8.3% | 286.0 / 17.1 | 110 | V347G (GTC→GGC) | ligB | DNA ligase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (54/46); new base G (5/4); total (59/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.87e-01 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
ATACTGGATCGCGGCCTGGAAGTACCCCTATGCACAAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGTAGAGCGCCAACCGATAACCGCACCAGC > NC_002947/5661320‑5661610 | aTACTGGATCGCGGCCTGGAAGTACCCCTATGCACAAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCACCCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCCAGTCAg > 2:814766/1‑150 (MQ=255) tACTGGATCGCGGCCTGGAAGTACCCCTATGCACAAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGc < 2:1498618/150‑1 (MQ=255) tGGATCGCGGCCTGGAAGTACCCCTATGCACAAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCtt < 2:505278/150‑1 (MQ=255) ggATCGCGGCCTGGAAGTACCCCTATGCACAAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTg < 1:1283201/150‑1 (MQ=255) gATCGCGGCCTGGAAGTACCCCTATGCACAAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTgg < 1:731811/150‑1 (MQ=255) gcgGCCTGGAAGTACCCCTATGCACAAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCACATTACCCAAGGCTGACTTGGGtaa < 1:60882/150‑3 (MQ=255) cgGCCCGGAAGTACCCCTATGCACAAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCAAGATCCTTATGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGGCTGACTCGGGtaat < 1:2222677/150‑4 (MQ=255) cTGGAAGTACCCCTATGCACAAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGgc < 1:2162845/150‑1 (MQ=255) tGGAAGTACCCCTATGCACAAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGgcg > 2:1452157/1‑150 (MQ=255) tGGAAGTACCCCTATGCACAAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGgcg > 1:639539/1‑150 (MQ=255) gAAGTACCCCTATGCACAAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGgcgcg > 1:1719363/1‑150 (MQ=255) gTACCCCTATGCACAAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTg > 1:1863984/1‑150 (MQ=255) tACCCCTATGCACAAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTAACCAAGTAAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTgg < 2:149805/150‑1 (MQ=255) ccccTATGCACAAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTCGCGCGCTGGCa > 2:1036622/1‑150 (MQ=255) cTATGCACAAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACg > 2:2163959/1‑150 (MQ=255) tATGCACAAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGc < 1:977591/150‑1 (MQ=255) gCACAAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTg < 1:1036622/150‑1 (MQ=255) gCACAAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTg < 1:140118/150‑1 (MQ=255) acgaGCCTGGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGAGCGGCGCATTACCCAGGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGa < 2:333223/147‑1 (MQ=255) acaAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGa > 2:2377689/1‑150 (MQ=255) gCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATAtt > 1:2345176/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCCCGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCt > 2:1734839/1‑141 (MQ=255) cTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCt < 1:1734839/141‑1 (MQ=255) cGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGAACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTgg > 1:1435425/1‑150 (MQ=255) cGAAGGACTCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTgg > 2:410166/1‑150 (MQ=255) tACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATc > 1:1218072/1‑150 (MQ=255) cgcgACGTGCGCTTTCTGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAg > 1:2013118/1‑150 (MQ=255) gACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTg > 2:469872/1‑150 (MQ=255) cggagagcTTTGGGGTCGGCCGCACAGTCAGGTTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTgg > 2:284192/7‑150 (MQ=255) aCGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGCTCTTCACGTGCAACCCGTTCCCCTCGATGACAGGCGCATTACCCAAGTCAGCCGTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTgg < 1:1969276/150‑1 (MQ=255) gTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGcc > 1:2207239/1‑150 (MQ=255) gcgcTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCAt < 2:2207239/150‑1 (MQ=255) gcTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCa < 1:435959/150‑1 (MQ=255) cTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAg > 1:1450856/1‑150 (MQ=255) tttCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAGGTCAGc > 1:1955878/1‑87 (MQ=255) tttCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGc < 2:1955878/87‑1 (MQ=255) tttCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGc < 2:1863984/150‑1 (MQ=255) tttCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGc < 2:954222/150‑1 (MQ=255) aatCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCCGc > 2:423631/3‑150 (MQ=255) ttCGCGACGGCCGCACCCGCAGCGTCACGTCCGTTCTTCACGTGCATCCCGTTACGCTCGATGACCGGCGCACTACCCCAGACACCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGCCAACGCCTGGATATC‑TGCACTAGCGATCACATGGCAAACAGcc < 2:457626/150‑1 (MQ=255) tCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCATGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCt < 1:2277081/150‑1 (MQ=255) ggTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGc > 1:2245486/1‑150 (MQ=255) acGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACTCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCg > 2:175769/2‑150 (MQ=255) ccGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCt < 1:2117961/150‑1 (MQ=255) gCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGc > 1:1794969/1‑119 (MQ=255) gCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGc < 2:1794969/119‑1 (MQ=255) aCTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGGCTGACTTGGGtaat > 2:1360254/1‑79 (MQ=38) gCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTc < 1:2163959/150‑1 (MQ=255) cAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGGCTGACTTGGGtaa < 2:2132214/76‑3 (MQ=38) cAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGGCTGACTTGGGtaa > 1:2132214/1‑74 (MQ=38) aGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAg > 1:118870/1‑117 (MQ=255) aGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAg < 2:118870/117‑1 (MQ=255) cACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCt > 1:979767/1‑150 (MQ=255) aCGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTc > 2:2056790/1‑150 (MQ=255) cccGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGaa < 2:1218072/150‑1 (MQ=255) ccGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAAc < 1:848104/81‑1 (MQ=255) ccGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAAc > 2:848104/1‑81 (MQ=255) gTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGAACGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAacac < 1:979880/150‑1 (MQ=255) ttcttcACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCCGCGCATGACGCATATGGGCCTGGGGTGGCTGGCGCGCTGGC‑ACCCGTCAACCTTACGCCCGGGTGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACAcg > 1:2350452/1‑150 (MQ=255) cACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTg < 2:1913903/150‑1 (MQ=255) caaggCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGc > 1:1289863/5‑150 (MQ=255) aCGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGc < 2:567531/150‑1 (MQ=255) aCGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGc < 2:639539/150‑1 (MQ=255) gTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTgg > 1:1297711/1‑89 (MQ=255) gTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTgg < 2:1297711/89‑1 (MQ=255) gTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTAACCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCAc > 1:2371787/1‑150 (MQ=255) gCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGc > 1:1996747/1‑88 (MQ=255) gCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGc < 2:1996747/88‑1 (MQ=255) gCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACcg > 1:423725/1‑150 (MQ=255) cAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACcgc > 1:1324650/1‑150 (MQ=255) cGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGt < 1:1736722/150‑1 (MQ=255) ccTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGTAGAgcg > 2:1536275/1‑150 (MQ=255) ccTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGTAGAgcg < 1:469872/150‑1 (MQ=255) ccTCGATGACCGGCGCATTACCAAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCAGCGCCTCGACCACGTCGTGCACCCCGCTGGAGAgcg > 2:368643/1‑150 (MQ=255) cTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTgg > 1:2320652/1‑85 (MQ=255) cTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGTAGAgcgc < 2:1535508/150‑1 (MQ=255) cTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCCGGCAAGGCTGatg > 2:223216/1‑106 (MQ=255) cTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTGGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTgg < 2:2320652/85‑1 (MQ=255) tCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGTAGAGCGcc > 2:1662127/1‑150 (MQ=255) tGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGaa < 1:1050395/118‑1 (MQ=255) tGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGaa > 2:1050395/1‑118 (MQ=255) cGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGTAGAGCGCCAACCGATa > 1:2185784/1‑150 (MQ=255) ggCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGTAGAGCGCCAACCGATaa < 2:2350452/150‑1 (MQ=255) ggCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGTAGAGCGCCAACCGATaa < 1:464826/150‑1 (MQ=255) cgcATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGTAGAGCGCCAACCGATAAcc < 2:1146931/150‑1 (MQ=255) ccagcgaCCCAAGGCTGACTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAAACAACCGCGCACCGCGCTGTAGAGCGCCAACCGATAAcc > 2:803819/7‑150 (MQ=255) cagcgaCCCAAGGCTGACTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGTAGAGCGCCAACCGATAACCg > 1:998870/6‑150 (MQ=255) tACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGTAGAGCGCCAACCGATAACCGCAcc < 1:1452157/150‑1 (MQ=255) gaCCCAAGGCTGACTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGTAGAGCGCCAACCGATAACCGCAcc > 1:1526951/2‑150 (MQ=255) aCCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGTAGAGCGCCAACCGATAACCGCACCa < 1:284192/150‑1 (MQ=255) aCCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGTAGAGCGCCAACCGATAACCGCACCa < 1:814766/150‑1 (MQ=255) cccAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGTAGAGCGCCAACCGATAACCGCACCAg > 2:502009/1‑150 (MQ=255) cccAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGTAGAGCGCCAACCGATAACCGCACCAg > 1:1085095/1‑150 (MQ=255) cccAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGTAGAGCGCCAACCGATAACCGCACCAg > 1:2256900/1‑150 (MQ=255) ccAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGa > 1:667120/1‑42 (MQ=255) ccAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGa < 2:667120/42‑1 (MQ=255) ccAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCt > 2:1084760/1‑84 (MQ=255) ccAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCt < 1:1084760/84‑1 (MQ=255) ccAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGTAGAGCGCCAACCGATAACCGCACCAGc > 1:2084171/1‑150 (MQ=255) ccAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGTAGAGCGCCAACCGATAACCGCACCAGc > 2:2407765/1‑150 (MQ=255) | ATACTGGATCGCGGCCTGGAAGTACCCCTATGCACAAGCCTTGGCCGAAGTACGCGACGTGCGCTTTCGGGTCGGCCGCACTGGCAGGGTCACGCCCGTTCTTCACGTGCAACCCGTTACCCTCGATGACCGGCGCATTACCCAAGTCAGCCTTGGGTCGCTGGCGCGCTGGCAACGCCTGGATATT‑CGCCCTGGCGATCAGGTGGCCATCAGCCTTGCCGGGCTGACCATTCCGCGGCTCGAACACGTCGTGCACCGCGCTGTAGAGCGCCAACCGATAACCGCACCAGC > NC_002947/5661320‑5661610 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |