| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,696,623 | A→G | 7.7% | intergenic (+19/‑193) | pyrC' → / → hslV | dihydroorotase‑like protein/ATP‑dependent HslVU protease peptidase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,696,623 | 0 | A | G | 7.7% | 235.5 / 4.9 | 85 | intergenic (+19/‑193) | pyrC'/hslV | dihydroorotase‑like protein/ATP‑dependent HslVU protease peptidase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/38); new base G (2/5); total (41/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.34e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
CCGCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATG > NC_002947/5696476‑5696770 | ccGCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACg > 2:1390836/1‑150 (MQ=255)ccGCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACg < 2:1225595/150‑1 (MQ=255)ccGCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACg > 1:2306256/1‑150 (MQ=255) cGCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGc > 1:1586966/1‑150 (MQ=255) cAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGccc < 2:2035443/150‑1 (MQ=255) gTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCGTGCCCGCtaa < 2:1756088/150‑3 (MQ=255) gTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCGTGCCCGCtaa < 1:485454/150‑3 (MQ=255) gTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCGTGCCCGCtaa > 2:485454/1‑148 (MQ=255) aCCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCcaca < 1:221053/150‑1 (MQ=255) aCCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCcaca > 1:1768779/1‑150 (MQ=255) aCCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCcaca > 1:274009/1‑150 (MQ=255) ccGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAg < 1:1444333/150‑1 (MQ=255) cGTTGCTGGCGAACAATGGTTCT‑CCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGa > 2:39292/1‑150 (MQ=255) cTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATcac < 1:2286822/150‑1 (MQ=255) aTGCTTGTCTCGGGGCGAGAACTGCAGCTTCTTCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGCTGGCCACATCTGCCACGAGGTGTGAGGACGATGCGTAGCGGGCACGCCCGCTCCCTCATGATCACCACAATTCCa < 2:1002286/150‑1 (MQ=255) tGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCaa < 1:438025/150‑1 (MQ=255) tGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCaa < 2:2306256/150‑1 (MQ=255) ggTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAg < 1:516731/150‑1 (MQ=255) ttCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGc > 2:1185127/1‑150 (MQ=255) ctcCCGTGGCGAGAGCTGCCCGGTCATCGGCAACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACTTTGCTCGATGGCCACATCTGCCACGACGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGAATTACCACAATTCCAAGGCAt < 2:1019739/150‑1 (MQ=255) tccGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCAtgt < 1:39292/149‑1 (MQ=255) cccGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCAtgt < 1:1390836/150‑1 (MQ=255) gCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAAGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAAc > 1:2391099/1‑150 (MQ=255) aaCTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCAGTAGCACCGCGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCtgt < 1:1853095/150‑1 (MQ=255) aCTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGATGCCTGAGTAACATGCTTCGCGGGGCAGCTCGCTCCCCCCGGGTCGCGATGGTCCCAGGGCATTTGGTAACCCtgtt < 2:398054/150‑2 (MQ=255) aCTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCtgtg < 1:2366223/150‑1 (MQ=255) cTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTgg < 2:2073787/150‑1 (MQ=255) tGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGGGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCACGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACACTGTggg > 1:1027550/1‑150 (MQ=255) tGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTggg > 1:1552951/1‑150 (MQ=255) gCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGa < 2:1215680/150‑1 (MQ=255) cccGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAg < 2:1552951/150‑1 (MQ=255) cccGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAg > 1:1460053/1‑150 (MQ=255) ccGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACACTTCCAAGGCATGTGGTAACCCAGTGGGAGc > 1:2307721/1‑150 (MQ=255) gTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCgg < 2:1768779/150‑1 (MQ=255) ttCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGc < 1:2315297/147‑1 (MQ=255) ttCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGc > 2:2315297/1‑147 (MQ=255) aTCGGCCACTGCCTGCCGGCCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGcgt < 2:1586966/150‑3 (MQ=255) tCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCTCAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGAGAGCGGGCATg > 2:2350291/1‑150 (MQ=255) tCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACaa < 2:2014122/113‑1 (MQ=255) tCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACaa > 1:2014122/1‑113 (MQ=255) gCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGccc > 2:535519/1‑150 (MQ=255) gCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCAACACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGccc > 1:517462/1‑150 (MQ=255) cACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCAtgtg < 2:1404310/122‑1 (MQ=255) cACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCAtgtg > 1:1404310/1‑122 (MQ=255) aCTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCcgcg > 2:2050408/1‑150 (MQ=255) ctgcctgcCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCg > 1:1586059/1‑86 (MQ=255) ctgcctgcCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCg < 2:1585831/86‑1 (MQ=255) ctgcctgcCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCg < 2:1586059/86‑1 (MQ=255) ctgcctgcCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCg > 1:1585831/1‑86 (MQ=255) cctgccGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGa > 1:1349180/1‑94 (MQ=255) cctgccGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGa < 2:1349180/94‑1 (MQ=255) cctgccGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATg > 2:1381029/1‑150 (MQ=255) tgccGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGcc > 1:1116570/1‑150 (MQ=255) gggCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGTTCGCTCCCACAGGATCGCCACAATTCCAAGGCATGTGGTGACCCTGGGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTca < 2:1577608/150‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTcac > 1:1383922/1‑150 (MQ=255) ttATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCgg > 2:1416836/1‑117 (MQ=255) ttATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCgg < 1:1416836/117‑1 (MQ=255) ttATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTttcccc > 2:323303/1‑150 (MQ=255) taCCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAg > 1:18558/1‑71 (MQ=255) taCCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAg < 2:18558/71‑1 (MQ=255) cctggcgcGATGGCCACATGTGCCTCCATGGCTGAGTGCCATGCGGGGGGGGCGCGCCAGACCCCGCTGGATCGCCACAATTCCAAGGCGTGTGGTATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCaa < 2:1460053/143‑1 (MQ=255) cTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCAt > 2:2129716/1‑90 (MQ=255) cTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCAt < 1:2129716/90‑1 (MQ=255) cTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCCAg > 2:1139633/1‑150 (MQ=255) cTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCACCCCACCAAg > 1:399532/1‑150 (MQ=255) ttGGTCGGGCGCCACCTCCGCCACGAGGCGTGAGTACCATGCTGAGCCGGCACGCCCGCTCCCACACGATCACCACAACTCCAAGGCATCTGGTAACCCTGTGTTAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAgc < 2:2391099/150‑1 (MQ=255) cGATGGCCACCTCTCCGACCAGACGCGACTACCTGGCTGACCCGGTGCGCCCTCTCTTACACGATCACCACAACTCCAAGGAATGTGGTAACCCTGGGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGAc < 2:561239/150‑1 (MQ=255) aTGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCAc > 1:1499038/1‑46 (MQ=255) ccACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCAAAAAGCGaagaatcg > 1:410529/1‑143 (MQ=255) caTCTGGCACGAGTCCTGTCTACCAGGCGGAGCCGGTACGCCCGCTCCTACAGGATCACCACATCTCCCACGCATGCTGAAACCCAGGGTGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATcc < 1:1381029/150‑1 (MQ=255) ccACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCAAAGCGCGACAATTCACcacccccc > 1:1372754/1‑149 (MQ=255) cACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCCCCCACCGCGACCATTCAAccccccccc > 2:296443/1‑148 (MQ=255) aCGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCGACCGCGCCCATACATCACCCCCGGt > 2:293927/1‑150 (MQ=255) cGAGGCCTGAACACCATGCACAGAGGGCACGGCCGTTCACACAGGAGCACCACAAATCCAACGCAGGCGGATTCGCTTGGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGtt < 1:293927/150‑1 (MQ=255) ccTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAAt < 1:1185127/150‑1 (MQ=255) ttcccATGCTTACCGGCTACGCCTGCCCTCACAGGATCACCACAATTGCAAGGCAGGTTGTAAACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTc < 2:399532/147‑1 (MQ=255) ccATGCGTGGCGGGCACGCTCGCTCCCACACGATCGCCACATTTCCAAGGCCTGTGGTATACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTcccc < 2:2307721/150‑1 (MQ=38) ttAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTcccc > 1:1791159/1‑144 (MQ=255) ttAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTcccc < 2:1791159/144‑1 (MQ=255) gaGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAAt > 2:1818614/2‑36 (MQ=11) gaGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAAt < 1:1818614/35‑1 (MQ=11) gCGGGCACGCCCGCCCCCACCGGGTCACCACCATTCCCAGGCATGTGGTAACCCTGGGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCcccccaccccca < 2:2395387/150‑1 (MQ=255) ggCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCAACCATTCATCCCCCCCCTCTGAAAACCCCCtccccccccccccac > 2:1705059/1‑146 (MQ=255) ggCACGCCCGCCCCCACAGGATAACCACAATTCCCAGGCATGTGGTAACCCTGGGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCatat < 1:535519/150‑1 (MQ=255) gCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCCCCAACCGCCACCCTTCATCCACCACCGTTGACATACTTTcccacaccccccgatt > 1:469265/1‑145 (MQ=255) | CCGCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATG > NC_002947/5696476‑5696770 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |