| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,753,542 | 0 | C | A | 11.7% | 271.2 / 16.5 | 93 | intergenic (+47/‑319) | glnA/glnL | glutamine synthetase/two‑component system sensor histidine kinase/phosphatase GlnL/GlnG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (43/39); new base A (6/5); total (49/44) | |||||||||||
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Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
ACGACTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTG‑‑GCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAG‑CGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCT‑ATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTCTGAT > NC_002947/5753395‑5753691 | acgacTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTG‑‑GCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCgg < 2:292797/150‑1 (MQ=255)acgacTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGATGGTCTCTCCGCTGCAGT‑C‑GCTGTTTATCAGCGTGTTGGGCCTCTCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCgg < 1:656434/150‑1 (MQ=255) gacTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTG‑‑GCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGa < 1:2015559/150‑1 (MQ=255) 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2:2126187/1‑150 (MQ=255) cGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAG‑CGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCT‑ATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTCTGAt < 1:1636031/150‑1 (MQ=255) cGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAG‑CGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCT‑ATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTCTGAt < 2:1258149/150‑1 (MQ=255) | ACGACTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTG‑‑GCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAG‑CGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCT‑ATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTCTGAT > NC_002947/5753395‑5753691 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |