Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,783,376 | C→G | 6.3% | H599D (CAC→GAC) | kefA → | intermediate mechanosensitive channel protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,783,376 | 0 | C | G | 6.3% | 355.8 / 12.4 | 111 | H599D (CAC→GAC) | kefA | intermediate mechanosensitive channel protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (53/51); new base G (3/4); total (56/55) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.16e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.13e-01 |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
GCCTGGCGCTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGG > NC_002947/5783230‑5783523 | gCCTGGCGCTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACt > 1:489735/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTcc > 1:2239973/1‑150 (MQ=255) gcTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTGGACTTCCGcca < 2:1178253/150‑3 (MQ=255) gCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCTCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGGGGCGTG‑GCGGGAGTCCACTGCCGCTGGccca > 1:1391017/1‑150 (MQ=255) cAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACaa > 2:1249382/1‑150 (MQ=255) ccTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCAc > 1:982950/1‑128 (MQ=255) ccTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTgg < 2:864926/137‑1 (MQ=255) ccTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTgg > 1:864926/1‑137 (MQ=255) cTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGt > 2:412398/1‑150 (MQ=255) ttGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTc < 2:727889/150‑1 (MQ=255) ttGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTc > 1:727889/1‑150 (MQ=255) ttGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTc > 2:1910036/1‑150 (MQ=255) aGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGt < 1:1454137/150‑1 (MQ=255) aGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGt > 1:659543/1‑150 (MQ=255) tCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTcc < 1:547314/150‑1 (MQ=255) tGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAg < 1:364150/136‑1 (MQ=255) tGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAg > 2:364150/1‑136 (MQ=255) tCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATTCTCGCACCCGGAGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCgg > 1:1747472/1‑150 (MQ=255) gggCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTgg < 1:1249382/150‑1 (MQ=255) cAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTg > 2:1875125/1‑113 (MQ=255) cAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTg < 1:1875125/113‑1 (MQ=255) aaaaCGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTc > 1:1803995/1‑150 (MQ=255) aaaaCGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTc < 1:1828222/150‑1 (MQ=255) aaaaCGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTc > 1:1803935/1‑150 (MQ=255) aaaaCGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTc > 2:1494606/1‑150 (MQ=255) aaaaCGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTc > 2:2155835/1‑150 (MQ=255) aaaaCGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTc > 1:2068426/1‑150 (MQ=255) aaaaCGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTc > 1:1508762/1‑150 (MQ=255) aaaaCGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTc > 2:1059626/1‑150 (MQ=255) aaCGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTcgc < 1:2155835/150‑1 (MQ=255) cAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCt > 1:858777/1‑150 (MQ=255) cTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGc > 2:921613/1‑150 (MQ=255) tGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCa < 1:1059626/150‑1 (MQ=255) tGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCa < 2:1508762/150‑1 (MQ=255) gccgcACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACtgtg < 1:1318231/150‑1 (MQ=255) gccgcACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACtgtg < 1:412398/150‑1 (MQ=255) ccgcACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTgtgg < 2:1528389/150‑1 (MQ=255) gcACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTgtggtg < 2:1554968/150‑1 (MQ=255) aCTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCt < 2:2058966/150‑1 (MQ=255) ctctGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTg < 1:1672654/150‑1 (MQ=255) cAGCTGGCCCAGGCCCGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTCGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTg < 1:2028161/150‑1 (MQ=255) gCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACCCAGCCTCCAGTATCTTAATGGTGTAAGGCGTGCCCTGAAG‑CCACTGCCTCTGTCACAAATCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGAACTGTGGTGTTTTCACTGGTCTGc < 2:1729960/150‑1 (MQ=255) gCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCCCCTGGGCACTTTGGTGCTGGCACTGGTCGGc < 1:2233899/150‑1 (MQ=255) cccAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCg > 1:1729960/1‑150 (MQ=255) aGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACtgtg < 1:1049392/128‑1 (MQ=255) aGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACtgtg > 2:1049392/1‑128 (MQ=255) ggCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCgtggt > 1:1817458/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCgtggtg > 2:486410/1‑150 (MQ=255) ctggctggTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTggtggc > 1:360710/1‑150 (MQ=255) ctggctggTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTggtggc > 1:1843580/1‑150 (MQ=255) tggctggTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCgtg > 1:2157546/1‑144 (MQ=255) ggctggTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGTGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTggtggcgg < 1:520271/150‑1 (MQ=255) gctggTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACt < 2:316225/59‑1 (MQ=255) gctggTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACt > 1:316225/1‑59 (MQ=255) gctggTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTggtggcggt < 1:2251188/150‑1 (MQ=255) tggTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTggtggcggtgg < 1:795455/150‑1 (MQ=255) 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ccGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGc > 1:1651964/1‑150 (MQ=255) ccGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGc > 1:2281102/1‑150 (MQ=255) gTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCAc < 2:1786460/150‑1 (MQ=255) tATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACaaa > 1:619444/1‑49 (MQ=255) tATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACaaa < 2:619444/49‑1 (MQ=255) tCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGa > 1:2205863/1‑127 (MQ=255) tCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGa < 2:2205863/127‑1 (MQ=255) tCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCg > 1:2995/1‑140 (MQ=255) tCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCg < 2:2995/140‑1 (MQ=255) tCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTTGCAg > 1:826094/1‑150 (MQ=255) tCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAg > 2:1201541/1‑150 (MQ=255) tCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAg > 2:2389227/1‑150 (MQ=255) cGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAga < 1:387320/150‑1 (MQ=255) aCCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAgacga > 2:466945/1‑150 (MQ=255) gcgtg‑gcgGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTgg < 1:105129/150‑1 (MQ=255) gcgtg‑gcgGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCAGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTgg < 2:1747472/150‑1 (MQ=255) cgtg‑gcgGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTggg < 1:1201541/150‑1 (MQ=255) gtg‑gcgGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTgg < 1:704677/91‑1 (MQ=255) gtg‑gcgGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTgg > 2:704677/1‑91 (MQ=255) ccagcgGAAGTGGACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGt > 1:38996/4‑92 (MQ=255) ccagcgGAAGTGGACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGt < 2:38996/89‑1 (MQ=255) ccagcgGAAGTGGACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGa > 2:2315732/4‑113 (MQ=255) ccagcgGAAGTGGACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGa < 1:2315732/110‑1 (MQ=255) cagcgGAAGTGGACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCa > 1:1696511/3‑150 (MQ=255) cgGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCg < 2:1817458/150‑1 (MQ=255) ggAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCgg > 2:375032/1‑150 (MQ=255) ggAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCgg > 2:1911535/1‑150 (MQ=255) tCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCgtgg > 1:460567/1‑150 (MQ=255) | GCCTGGCGCTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACGCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTG‑GCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGG > NC_002947/5783230‑5783523 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |