| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,790,189 | 0 | G | T | 7.2% | 376.0 / 9.0 | 121 | intergenic (+12/+56) | ynfM/PP_5073 | efflux transporter/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (54/57); new base T (5/4); total (60/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.41e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
AGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAA‑CGGGATCGGGC‑TGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTT > NC_002947/5790040‑5790337 | aGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAA‑CGGGATCGGGC‑TGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTggg < 2:500824/150‑1 (MQ=255) gCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAA‑CGGGATCGGGC‑TGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGcc > 2:1669933/1‑150 (MQ=255) ccGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAA‑CGGGATCGGGC‑TGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGc < 1:1212621/148‑1 (MQ=255) 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gATGCATTCGTGGGCACGCCCGCTCCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAAAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCtt < 1:499675/150‑1 (MQ=255) gcctcttCGTGGTCACACCCGCTCCCACAGGTTGTGGGTGCGGGCGTGCCCACGAACAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTg > 2:1565211/6‑150 (MQ=21) aTGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTg > 1:1032417/1‑150 (MQ=255) gCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCACCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGt > 2:1828652/1‑150 (MQ=255) ttCGTGGTCACACCCGCTCCCACAGGTTGTGGGTGCGGGCGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCtt < 2:199493/150‑1 (MQ=37) gTGGTCACACCCGCTCCCACAGGTTGTGGGTGCGGGCGTGCCCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTc > 1:955229/1‑130 (MQ=21) gTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTgatgat > 2:2043972/1‑72 (MQ=255) gTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTc > 2:2176936/1‑150 (MQ=255) gTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTc < 2:1317620/150‑1 (MQ=255) tGGTCACACCCGCTCCCACAGGTTGTGGGTGCGGGCGTGCCCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATCAGCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACATTGGTCTTGTCg > 1:763237/1‑150 (MQ=25) ggCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGtt < 1:289867/150‑1 (MQ=255) | AGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAA‑CGGGATCGGGC‑TGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTT > NC_002947/5790040‑5790337 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |