| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,821,953 | T→A | 11.8% | L173Q (CTG→CAG) | metW → | methionine biosynthesis protein MetW |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,821,953 | 0 | T | A | 11.8% | 259.3 / 19.7 | 91 | L173Q (CTG→CAG) | metW | methionine biosynthesis protein MetW |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/41); new base A (3/8); total (42/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.13e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CTGCCGCTGGTACCTGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCGGAGGAATCGCACCATGCGT > NC_002947/5821804‑5822102 | cTGCCGCTGGTACCTGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCt < 2:1293346/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGTACCTGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGc < 2:574573/150‑1 (MQ=255) cTGGTACCTGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGt < 1:705711/150‑1 (MQ=255) gtgccgggCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATCCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGCGCACGAACGCCGGGCCAATGTACTCGACCGCCAGGCGGTCGa < 1:2130283/144‑1 (MQ=255) gTACCTGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGCACATCCACTTCTGCACCTTAGCCGAATTCGACGCCCTTGTCCACGCAAGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCAGGCGGTCGa < 2:1091664/150‑1 (MQ=255) gTACCTGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGa > 2:1940943/1‑150 (MQ=255) gTACCTGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCAGGCGGTCGa < 1:1671577/150‑1 (MQ=255) gTACCCGGCCGCCAAAGTCCGCATGCCGGTATCGGACTCCATGCCGTATACCTGGTACAACACGTCGAACATCCACCTCTGCCCATTCGCCGACTTCTAACTCCCTGTGCTCGAACCCCGGGTCAAGGTACTCGCCCGCTAGTCGGTCGa < 2:30629/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCGGAGCCAAGTTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCa > 2:737460/1‑150 (MQ=255) ccTGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCAGGCGGTCGagta < 2:1361694/150‑4 (MQ=255) tGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACt > 1:1096782/1‑150 (MQ=255) ggCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACtt < 1:1553712/150‑1 (MQ=255) cAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCg > 1:852207/1‑150 (MQ=255) aaaGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGtt > 2:1801237/1‑134 (MQ=255) aaaGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGtt < 1:1801237/135‑2 (MQ=255) aaaGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGc > 1:1656508/1‑150 (MQ=255) aTGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCAGGCGGTCGag > 2:182663/1‑128 (MQ=255) aTGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCAGGCGGTCGag < 1:182663/129‑2 (MQ=255) cgacGGTATCTGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACgggtggg > 2:1726613/4‑150 (MQ=255) ggTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGCGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGCTGAAGAGCTGATCCGCGACGggtggg‑gtgg > 1:2332799/1‑150 (MQ=255) gTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGc < 1:1940943/150‑1 (MQ=255) tCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCgg > 1:2277298/1‑150 (MQ=255) aCTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTAt < 2:1092695/150‑1 (MQ=255) cTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACGGCCTGGCGGTCGTCCGCGTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATg < 1:1624667/150‑1 (MQ=255) ttCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATgg > 1:1980768/1‑150 (MQ=255) ttCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACAGCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGACCGCCGGGCCACGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATgg < 2:362810/150‑1 (MQ=255) tGCCGTATACCTGGTACAACACGACGTCCGCCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTa > 1:1269045/1‑150 (MQ=255) aCCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTa < 2:967001/150‑1 (MQ=255) ccTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACgggtggg < 1:2320553/123‑1 (MQ=255) ccTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACgggtggg > 2:2320553/1‑123 (MQ=255) ccTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAg > 2:2401383/1‑150 (MQ=255) ccTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAg > 2:458582/1‑150 (MQ=255) tGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGt < 2:451336/150‑1 (MQ=255) tGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGt < 1:1726613/150‑1 (MQ=255) ggTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTg < 2:952103/150‑1 (MQ=255) gTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTga < 1:458582/150‑1 (MQ=255) aacaCGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACgggt < 2:1044195/112‑1 (MQ=255) aacaCGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACgggt > 1:1044195/1‑112 (MQ=255) aacaCGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGTGTGGcggtca > 1:806284/1‑121 (MQ=255) aacaCGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGGTGTGGcggtca < 2:806284/126‑6 (MQ=255) aacaCGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGt < 2:2214316/144‑1 (MQ=255) aacaCGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGt > 1:2214316/1‑144 (MQ=255) aacaCGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATc > 2:1811047/1‑150 (MQ=255) aacaCGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATc > 1:1454887/1‑150 (MQ=255) acGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGc > 2:971018/1‑150 (MQ=255) ccGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAg < 1:792428/136‑1 (MQ=255) ccGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAg > 2:792428/1‑136 (MQ=255) aaCATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCCAc < 1:2401383/150‑1 (MQ=255) aCATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCAGGCGGTCGa < 1:1253975/82‑1 (MQ=255) aCATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCAGGCGGTCGa > 2:1253975/1‑82 (MQ=255) tCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACgggtggg‑gtg < 2:533038/105‑1 (MQ=255) tCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACgggtggg‑gtg > 1:533038/1‑105 (MQ=255) cACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTc < 2:1096782/150‑1 (MQ=255) aCTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGACCGCAGATTCTGATGATGCTACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTca < 2:1269045/150‑1 (MQ=255) aCTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTca < 2:1454887/150‑1 (MQ=255) tCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTcagct < 2:1656508/150‑2 (MQ=255) tCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTcagca < 1:971018/150‑1 (MQ=255) ccTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCgg < 2:2277298/150‑1 (MQ=255) cTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCt > 1:1107297/1‑106 (MQ=255) cTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCt < 2:1107297/106‑1 (MQ=255) ttCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGc > 1:647834/1‑150 (MQ=255) cGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCt < 1:700109/150‑1 (MQ=255) ccGACTGCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGc < 2:233185/150‑1 (MQ=255) cGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCa > 2:1697038/1‑150 (MQ=255) 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aCGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGACTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTGCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGGCAGCCGTCTGGGCCTACCAGAGCATCAGCTCGCGGTCt > 1:947619/1‑150 (MQ=255) gCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGcc > 2:277369/1‑150 (MQ=255) gCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGcc > 1:2233592/1‑150 (MQ=255) gCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GGGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCCTCAGCAGTCCGGGCCTGGAAGAGCACCAGCTCGCGGTCTGACGcc > 1:976890/1‑150 (MQ=255) ggCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCAcc > 1:121285/1‑150 (MQ=255) aaGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAaga > 2:281025/1‑119 (MQ=255) aaGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAaga < 1:281025/119‑1 (MQ=255) aaGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCggag > 1:1183330/1‑150 (MQ=255) gACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCGGAGGAATCGCAc < 1:277369/150‑1 (MQ=255) aCCGCCAGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTa < 1:2377857/57‑1 (MQ=255) aCCGCCAGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTa > 2:2377857/1‑57 (MQ=255) ccTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCGGAGGAATCGCACCATGc > 1:259359/1‑150 (MQ=255) tGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCGGAGGAATCGCACCATGCGt > 1:1424209/1‑150 (MQ=255) | CTGCCGCTGGTACCTGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTTCTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCACTTGCACCGCAACGGGTGGG‑GTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCGGAGGAATCGCACCATGCGT > NC_002947/5821804‑5822102 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |