| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,846,239 | T→C | 7.7% | T217A (ACC→GCC) | mutM ← | formamidopyrimidine‑DNA glycosylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,846,239 | 0 | T | C | 7.7% | 213.4 / 6.4 | 78 | T217A (ACC→GCC) | mutM | formamidopyrimidine‑DNA glycosylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/38); new base C (3/3); total (36/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.29e-01 | |||||||||||
TACACGCTCGCCCTCTGCCCCAGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAAACAACGCCTCGGTGGCGTAGATGTTGCC > NC_002947/5846097‑5846383 | tACACGCTCGCCCTCTGCCCCAGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCg > 2:1317610/1‑150 (MQ=255) acGCTCGCCCTCTGCCCCAGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGccc > 1:1808639/1‑150 (MQ=255) gCTCGCCCTCTGCCCCAGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTg < 1:1394660/150‑1 (MQ=255) cTCGCCCTCTGCCCCAGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGCGGTACCACCCTGc < 1:1324795/150‑1 (MQ=255) tCGCCGTCTGCCCCAGCTTCACTTCTCGCAACTCAGTGCCGCATACCTGGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCt < 2:988077/150‑1 (MQ=255) tCGCCCTCTGCCCCAGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGggtggt < 2:1338320/139‑1 (MQ=255) tCGCCCTCTGCCCCAGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGggtggt > 1:1338320/1‑139 (MQ=255) ccTCTGCCCCAGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGAt < 2:222117/150‑1 (MQ=255) ccTCTGCCCCAGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCCCGAt > 2:82178/1‑150 (MQ=255) ctctGCCCCAGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATg < 1:2209548/150‑1 (MQ=255) ctGCCCCAGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGgc < 2:1950587/150‑1 (MQ=255) ccccAGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGgccgc > 1:333017/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATg < 2:2085218/143‑1 (MQ=255) ccAGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATg > 1:2085218/1‑143 (MQ=255) aGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATg > 2:112150/1‑141 (MQ=255) aGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATg < 1:112150/141‑1 (MQ=255) ttCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCg > 1:2097323/1‑150 (MQ=255) ttCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCg > 2:2048637/1‑150 (MQ=255) cgcgCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGtt < 2:2343668/150‑1 (MQ=255) gcgcAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGttt < 2:2097323/150‑1 (MQ=255) aaCTCAGTTCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACGAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGGCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGAtc < 2:1456421/150‑1 (MQ=255) cTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGAtctc > 2:1616393/1‑150 (MQ=255) tCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCg > 1:1502207/1‑150 (MQ=255) cAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGa < 1:2048637/150‑1 (MQ=255) aGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGAt > 1:705431/1‑150 (MQ=255) ggtaTACCGTGCACGGCGGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCa < 2:745936/147‑1 (MQ=255) aCCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTc < 1:1631634/150‑1 (MQ=255) cTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGGTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGACGCACAGGGTGGTACCGCCCGACTCGAGAGCCCCCGCCAGAACCCGATTGATGTCGAGCGCCAGTTTCAg > 2:719810/1‑150 (MQ=255) ttGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGttt > 1:2114484/1‑128 (MQ=255) ttGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGttt < 2:2114484/128‑1 (MQ=255) aCGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGgcc < 2:667176/107‑1 (MQ=255) aCGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGgcc > 1:667176/1‑107 (MQ=255) aCGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAgc < 2:314250/150‑1 (MQ=255) ggCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGcgc > 1:2299205/1‑96 (MQ=255) ggCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTc < 2:2299205/98‑1 (MQ=255) ccGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGGCCGCCGCCACCGATACAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCTCGCCCgg < 1:265066/150‑1 (MQ=255) ccGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCg < 1:2195376/123‑1 (MQ=255) ccGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCg > 2:2195376/1‑123 (MQ=255) ccGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCgg < 2:1003940/150‑1 (MQ=255) ccGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGACCTCGATCGCCAGTTTCAGCTAGCGCGCCCgg > 2:2195945/1‑150 (MQ=255) cGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGAtct < 1:1710763/120‑1 (MQ=255) cGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGAtct > 2:1710763/1‑120 (MQ=255) gCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGa < 2:1808639/150‑1 (MQ=255) cGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATc < 2:333017/150‑1 (MQ=255) ccGTACACAAACAGTTCCTGCTGGACGGANGCCGGCTGCCCGTCGNCNCCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTANCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATcccg > 1:572926/1‑150 (MQ=255) gTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATcc < 1:1898005/146‑1 (MQ=255) gTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATcc > 2:1898005/1‑146 (MQ=255) aaaCAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCctc > 2:1488440/1‑150 (MQ=255) cAGTTCCTGCTGGAACTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCg < 1:2044059/150‑1 (MQ=255) gctgGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGt > 1:589857/1‑150 (MQ=255) ctgGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGt < 2:2189955/149‑1 (MQ=255) ctgGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGt > 1:2189955/1‑149 (MQ=255) ctgGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCCCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTc < 1:82178/150‑1 (MQ=255) gAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGAt > 2:917979/1‑150 (MQ=255) tACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACcg < 1:1092780/150‑1 (MQ=255) cccGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACcggcg < 1:1317610/150‑1 (MQ=255) ccGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTa > 2:886586/1‑100 (MQ=255) ccGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTa < 1:886586/100‑1 (MQ=255) ccGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGc > 2:822922/1‑132 (MQ=255) ccGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGc < 1:822922/132‑1 (MQ=255) ccGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACcggcgg > 2:512724/1‑150 (MQ=255) ggCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCa > 2:1248774/1‑150 (MQ=255) cTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCaaa < 1:1478664/150‑1 (MQ=255) cccGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTgg < 2:1002924/129‑1 (MQ=255) cccGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTgg > 1:1002924/1‑129 (MQ=255) cccGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGTTCGATACCGGCGGCAaacag < 2:705431/150‑2 (MQ=255) cccGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAaacaa < 1:917979/150‑1 (MQ=255) gTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAAACAACGc < 1:1248774/150‑1 (MQ=255) ccACCGTGAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAAACAACGCCTCg < 2:1812470/150‑1 (MQ=255) ccACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAAACAACGCCTCg > 1:1735917/1‑150 (MQ=255) aCCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAAACAACGCCTCGGt > 2:655390/1‑150 (MQ=255) aCCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCACCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAAACAACGCCTCGGt > 1:154123/1‑150 (MQ=255) catCGAGCAGGGCGGTACCACCCTGCGCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAAACAACGCCTCGGTGGCGTAGa < 2:2407501/148‑1 (MQ=255) catCGAGCAGGGCGGTACCACCCTGCGCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAAACAACGCCTCGGTGGCGTAGa > 1:2407501/3‑150 (MQ=255) gTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAAACAACGCCTCGGTGGCGTAGAt > 1:1317876/1‑150 (MQ=255) tcgagcAGGGCGGTACCACCCTGCGCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAAACAACGCCTCGGTg < 2:1587015/137‑1 (MQ=255) tCGAGCAGGGCGGTACCACCCTGCGCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAAACAACGCCTCGGTg > 1:1587015/1‑141 (MQ=255) gcgcAGGGGGGTACCGCCCGGCTCGATGGCCGCCCCCAGCGCCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAAGCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGAGACCGGCGGCAAACAACGCCTCGGTGGCGTAGATGtt < 1:799645/150‑1 (MQ=255) gcAGGGCGGTACCACCCTGCGCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAAACAACGCCTCGGTGGCGTAGATGTTGc > 2:888574/1‑150 (MQ=255) cAGGGTGATACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGGTTGGAGGCAGTGGTCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTGTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAAACAACGCCTCGGTGGCGTAGATGTTGcc < 2:572926/150‑1 (MQ=255) | TACACGCTCGCCCTCTGCCCCAGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAAACAACGCCTCGGTGGCGTAGATGTTGCC > NC_002947/5846097‑5846383 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |