| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,874,876 | A→C | 6.3% | S451A (TCG→GCG) ‡ | ilvA‑II ← | threonine deaminase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,874,876 | 0 | A | C | 6.3% | 318.8 / 11.6 | 111 | S451A (TCG→GCG) ‡ | ilvA‑II | threonine deaminase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (50/54); new base C (3/4); total (53/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.52e-01 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTGGCCAATTCGTTG > NC_002947/5874727‑5875024 | tttGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCga < 1:2393102/150‑1 (MQ=255) gCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTc > 2:1225735/1‑150 (MQ=255) cGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCCCGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGAt > 2:148657/1‑144 (MQ=255) cGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGTGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCa > 1:473922/1‑150 (MQ=255) cGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCTCGATGTTCCa < 2:1178093/150‑1 (MQ=255) cGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCTCGATGTTCCa < 2:2111944/150‑1 (MQ=255) cGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGAt < 1:148657/144‑1 (MQ=255) cGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCa < 1:1219280/150‑1 (MQ=255) cGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCa < 1:1225735/150‑1 (MQ=255) ggTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAgc > 2:1033214/1‑150 (MQ=255) ttttCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAgcgc > 2:669727/1‑150 (MQ=255) tttCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGcgcc < 1:669727/150‑1 (MQ=255) gTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCACCCGCCCAGCtt < 2:2172746/150‑1 (MQ=255) tCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCttg > 2:1863588/1‑150 (MQ=255) cccAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCttgt > 1:183134/1‑150 (MQ=255) cccAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCttgt > 2:456661/1‑150 (MQ=255) ccAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCttgtt < 2:1980209/150‑1 (MQ=255) ccAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCttgtt > 1:732693/1‑150 (MQ=255) tACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTc > 1:1185631/1‑126 (MQ=255) cGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGaa < 2:735139/150‑1 (MQ=255) ggTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGt > 2:1773889/1‑150 (MQ=255) ggTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGt < 1:486599/150‑1 (MQ=255) gTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACAAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGtt > 1:961792/1‑150 (MQ=255) cGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGAt < 2:1275984/112‑1 (MQ=255) cGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGAt > 1:1275984/1‑112 (MQ=255) cGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCttg < 2:1458494/134‑1 (MQ=255) cGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCttg > 1:1458494/1‑134 (MQ=255) cGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACa < 2:732693/150‑1 (MQ=255) tCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTg > 1:704490/1‑150 (MQ=255) ggCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGACCGCCATGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGcccc < 1:1863588/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTg > 1:1428528/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTg > 1:1012407/1‑150 (MQ=255) aGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGTGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGc < 2:473922/150‑1 (MQ=255) gcTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGc > 2:198086/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGc > 1:2073/1‑115 (MQ=255) tGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTc > 2:124620/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTc > 2:2060353/1‑150 (MQ=255) ccGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCTGGTTCCCTCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCgg > 2:64505/1‑150 (MQ=255) ccGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCgg < 1:198086/150‑1 (MQ=255) ccGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCgg < 1:1773889/150‑1 (MQ=255) cGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCggg < 1:1629102/150‑1 (MQ=255) cACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGaa < 1:2386089/150‑1 (MQ=255) aCCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAAt < 1:2319405/150‑1 (MQ=255) aCCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAAt < 1:1033214/150‑1 (MQ=255) aCCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAAt < 2:436253/150‑1 (MQ=255) ccAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAAtt > 2:2186566/1‑150 (MQ=255) cAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCTCGATGTTCCa < 2:1411574/93‑1 (MQ=255) gTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTc < 1:400490/88‑1 (MQ=255) gTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTc > 2:400490/1‑88 (MQ=255) gTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAgcgc < 1:136281/149‑1 (MQ=255) gTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGaa > 2:488225/1‑105 (MQ=255) gTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGaa < 1:488225/105‑1 (MQ=255) tcctccGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCacta > 2:2256823/1‑80 (MQ=255) tcctccGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCacta < 1:2256823/83‑4 (MQ=255) ctccGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCAt > 2:462926/1‑150 (MQ=255) tccGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCAtt > 2:1105823/1‑150 (MQ=255) ccGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCCGCACCAttt < 2:2168961/150‑1 (MQ=255) ggCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGa > 1:967941/1‑94 (MQ=255) gCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGaa > 2:568802/1‑97 (MQ=255) gCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGaa < 1:568802/97‑1 (MQ=255) aCCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTtcgtcg > 2:1462164/1‑150 (MQ=255) aCCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTAAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTtcgtcg > 1:148502/1‑150 (MQ=255) ccTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATTGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGc < 2:191753/150‑1 (MQ=255) cTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCt < 2:2075140/150‑1 (MQ=255) cTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCt > 1:375727/1‑150 (MQ=255) gCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCAc < 2:1428528/150‑1 (MQ=255) ccGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCgg > 1:1106144/1‑150 (MQ=255) caccacGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGa < 2:1595636/150‑1 (MQ=255) caccacGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGGTGAGGAAGTTGATCAGTGCCCCGGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGa < 2:331045/150‑1 (MQ=255) cacGCGCCCGTCAGCCGCGGCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCggacctgat < 2:1854887/150‑8 (MQ=255) cacGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGCGTg > 2:745504/1‑150 (MQ=255) acGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTgg > 2:2155586/1‑150 (MQ=255) ccGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGccgccg > 2:1113924/1‑150 (MQ=255) ccGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTCCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTg > 1:2007856/1‑129 (MQ=255) ccGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTCCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTg < 2:2007856/129‑1 (MQ=255) cgcgCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATg > 2:1267459/1‑150 (MQ=255) cgcCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGAc < 2:375727/150‑1 (MQ=255) ccATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGa < 2:183134/150‑1 (MQ=255) cATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAAGTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGaa < 2:1012407/150‑1 (MQ=255) aTGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCACCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAat > 1:1774296/1‑150 (MQ=255) ggTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGTCGCCGACCATATGACGAatat < 1:124620/150‑1 (MQ=255) tGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCa < 1:1113924/150‑1 (MQ=255) gCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAg > 1:1895799/1‑150 (MQ=255) tAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTg < 1:2186566/150‑1 (MQ=255) tAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTg < 1:2155586/150‑1 (MQ=255) tAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTg < 2:1223953/150‑1 (MQ=255) tAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTg < 1:1909180/150‑1 (MQ=255) tGGAACATCTCGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAGCAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAata > 1:2291055/1‑138 (MQ=255) tGGAACATCTCGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAGCAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAata < 2:2291055/138‑1 (MQ=255) tGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGaa < 2:1693722/50‑1 (MQ=255) tGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTGGcc > 1:727974/1‑150 (MQ=255) ggAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGaa < 1:141979/73‑1 (MQ=255) ggAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGaa > 2:141979/1‑73 (MQ=255) aaCATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTGGCCAAt < 1:2216456/150‑1 (MQ=255) tCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCata < 2:1952944/122‑1 (MQ=255) gagaTGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAg < 2:1263464/72‑1 (MQ=255) gagaTGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAg > 1:1263464/1‑72 (MQ=255) gagaTGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTGGCCAATTCGTTg < 1:1267459/150‑1 (MQ=255) agaTGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGt < 2:25111/36‑1 (MQ=255) agaTGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGt > 1:25111/1‑36 (MQ=255) | TTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTGGCCAATTCGTTG > NC_002947/5874727‑5875024 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |