| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 555,771 | C→A | 5.3% | H29N (CAC→AAC) | rplN → | 50S ribosomal protein L14 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 555,771 | 0 | C | A | 5.3% | 306.5 / 4.7 | 95 | H29N (CAC→AAC) | rplN | 50S ribosomal protein L14 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (45/45); new base A (2/3); total (47/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.68e-01 | |||||||||||
TGGGCACTGGTTGAAGTCCTCGAACGCGCTGTTGAAGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGTGATGACCGCTGTCGTCGTACGTACCCGTCACGGTGTTCGTCGCGCTGACGGTTCCATCAT > NC_002947/555622‑555916 | tGGGCACTGGTTGAAGTCCTCGAACGCGCTGTTGAAGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGc > 2:1009926/1‑150 (MQ=255) ggCACTGGTTGAAGTCCTCGAACGCGCTGTTGAAGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCAc < 1:2083768/150‑1 (MQ=255) ggTTGAAGTCCTCGAACGCGCTGTTTAATTCTAAGGGCTAAGGTTTGGAGAAATTTTATGATTTATACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGt < 2:454147/150‑1 (MQ=255) ggTTGAAGTCCTCGAACGCGCTGTTGAAGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGt < 1:52302/150‑1 (MQ=255) ggTTGAAGTCCTCGAACGCGCTGTTGAAGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTGCGAAccgccga < 2:1950128/150‑2 (MQ=255) gTTGAAGTCCTCGAACGCGCTGTTGAAGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGtt > 1:887359/1‑150 (MQ=255) gTTGAAGTCCTCGAACGCGCTGTTGAAGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGtt < 2:2264097/150‑1 (MQ=255) aaGTCCTCGAACGCGCTGTTGAAGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGc < 2:1759757/150‑1 (MQ=255) gTCCTCGAACGCGCTGTTGAAGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCg < 1:653012/150‑1 (MQ=255) tCCTCGAACGCGCTGTTGAAGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTGCGAAccgccga < 2:1785075/142‑2 (MQ=255) tCCTCGAACGCGCTGTTGAAGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTGCGAAccgccga > 1:1785075/1‑141 (MQ=255) cTCGAACGCGCTGTTGAAGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTa > 1:250458/1‑150 (MQ=255) tCGAACGCGCTGTTGAAGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTAt > 2:952101/1‑150 (MQ=255) aaCGCGCTGTTGAAGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCCCACCGCCGTTACGCCGGTATCgg > 1:418334/1‑150 (MQ=255) aCGCGCTGTTGAAGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGt < 1:952101/150‑1 (MQ=255) gcgcTGTTGAAGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGa < 2:1678753/150‑1 (MQ=255) tGTTGAAGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGAcatc > 1:243700/1‑150 (MQ=255) ttGAAGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGAcatcat < 1:1479990/150‑1 (MQ=255) ttGAAGTCTAACGGCTAGGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTCGCCGATCACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTCCGCCGGTACCGGTGAcctcat < 2:1717/150‑1 (MQ=255) gAAGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACAtcatca > 2:1957492/1‑150 (MQ=255) aGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCaaa < 2:250458/150‑1 (MQ=255) gTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAg < 1:1957492/150‑1 (MQ=255) tCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTGCGAAccgccga < 2:1545637/121‑2 (MQ=255) tCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTGCGAAccgccga > 1:1545637/1‑120 (MQ=255) taagggctaagggTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACGGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCg < 2:1778854/126‑1 (MQ=255) taagggctaagggTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACGGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCg > 1:1778854/1‑126 (MQ=255) aagggctaagggTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAAc < 1:2010308/150‑1 (MQ=255) agggctaagggTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAAcc > 1:1307926/1‑150 (MQ=255) agggctaagggTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAAcc < 1:276427/150‑1 (MQ=255) agggataagggTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAAcc < 1:1679628/150‑1 (MQ=255) ggctaagggTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGt > 1:523922/1‑150 (MQ=255) ggctaagggTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGt > 1:1839700/1‑150 (MQ=255) gctaagggTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAg > 2:237947/1‑142 (MQ=255) gctaagggTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAg < 1:237947/142‑1 (MQ=255) taagggTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCaa < 2:1415757/150‑1 (MQ=255) gggTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGAcatca > 1:301171/1‑131 (MQ=255) gggTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGAcatca < 2:301171/131‑1 (MQ=255) gTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAg < 2:1307926/150‑1 (MQ=255) gagaAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTAGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGa > 1:1172771/1‑120 (MQ=255) gagaAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTAGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGa < 2:1172771/120‑1 (MQ=255) agaAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAAtt > 1:334203/1‑150 (MQ=255) aTTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCcgc > 2:141795/1‑150 (MQ=255) tttATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCg > 1:1474832/1‑103 (MQ=255) tttATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCg < 2:1474832/103‑1 (MQ=255) ttATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCcgcgc > 2:1146862/1‑149 (MQ=255) ttATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCcgcgc < 1:1146862/149‑1 (MQ=255) gATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTaa < 1:670486/150‑1 (MQ=255) aTTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAg < 1:141795/150‑1 (MQ=255) tCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGt < 2:887359/150‑1 (MQ=255) tCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGt < 2:523922/150‑1 (MQ=255) aGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGt > 1:1887186/1‑101 (MQ=255) aGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGt < 2:1887186/101‑1 (MQ=255) aGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTg > 2:335615/1‑102 (MQ=255) aGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTg < 1:335615/102‑1 (MQ=255) aGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCa > 1:79832/1‑150 (MQ=255) aGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCa > 2:1970950/1‑150 (MQ=255) gACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCaa > 1:838273/1‑150 (MQ=255) tCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGACAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCaaaaa > 1:644178/1‑150 (MQ=255) cAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCaaaaaa < 1:426502/150‑1 (MQ=255) aaTCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAg > 1:683430/1‑150 (MQ=255) aaTCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAg > 2:687968/1‑150 (MQ=255) aTCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAg > 2:2286387/1‑118 (MQ=255) aTCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAg < 1:2286387/118‑1 (MQ=255) aTCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAgg > 2:1397386/1‑150 (MQ=255) aTGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCaa < 2:79832/150‑1 (MQ=255) tGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAg > 2:1193022/1‑150 (MQ=255) cTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGtg > 1:439999/1‑150 (MQ=255) tCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGtga > 1:208033/1‑150 (MQ=255) cGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGtgat < 2:2203803/150‑1 (MQ=255) gATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGt < 2:880066/131‑1 (MQ=255) gATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGt > 1:880066/1‑131 (MQ=255) tgGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCACGGTCCTCGGCGGTTCGCACCCCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGTGATGACCg < 1:1349841/150‑1 (MQ=255) gCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGTGATGACCGCt > 2:548248/1‑150 (MQ=255) cGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCCAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGt < 1:2294465/138‑1 (MQ=255) cGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGt > 2:2294465/1‑138 (MQ=255) cGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGTGATGACCGCTgt > 2:1384037/1‑150 (MQ=255) gcggcgCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGTGATGACCGCTGTCGTcgtac > 1:1030747/1‑150 (MQ=255) gcggcgCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGAAAAAAAGAAAAAAAAGGCCAAGTGATGACCGCTGTCGTcgtac < 2:243700/150‑1 (MQ=255) cggcgCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAAGTCAAAAAAGGCCAAGTGATGACCGCTGTCGTcgtacg > 1:1934847/1‑150 (MQ=255) cgcTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGTGATGACCGCTGTCGTCgtacgtac < 1:687968/150‑1 (MQ=255) gcTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGTGATGACCGCTGTCGTCGTACGTAcc > 1:1549071/1‑150 (MQ=255) tcgtcgCGTCATGTGAATCAAGGTACGGGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGTGATGACCGCTGTCGTCGTACGTACCCg > 2:824780/1‑150 (MQ=255) tCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGACAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGTGATGACCGCTGTCGTCGTACGTACCCGTCACGgtg < 2:644178/150‑1 (MQ=255) gtgCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGTGATGACCGCTGTCGTCGTACGTACCCGTCACGGTGTtcg > 2:169349/1‑150 (MQ=255) aTCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCaa < 1:509840/76‑1 (MQ=255) aTCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCaa > 2:509840/1‑76 (MQ=255) aTCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGTGATGACCGCTGTCGTCGTACGTACCCGTCACGGTGTTCGTcgc > 1:1436412/1‑150 (MQ=255) aTCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGTGATGACCGCTGTCGTCGTACGTACCCGTCACGGTGTTCGTcgc > 2:775754/1‑150 (MQ=255) gTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCcgc > 2:472358/1‑76 (MQ=255) gTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCcgc < 1:472358/76‑1 (MQ=255) ccggcggTTCCCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGTGATGACCGCTGTCGTCGTACGTACCCGTCACGGTGTTCGTCGCGCTGACGGtt < 1:1614335/149‑1 (MQ=255) cggcggTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGTGATGACCGCTGTCGTCGTACGTACCCGTCACGGTGTTCGTCGCGCTGACGGTTc > 2:820892/1‑150 (MQ=255) ggcggTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGTGATGACCGCTGTCGTCGTACGTACCCGTCACGGTGTTCGTCGCGCTGACGGTTcc < 1:820892/150‑1 (MQ=255) gcggTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGTGATGACCACTGTCGTCGTACGTACCCGTCACGGTGTTCGTCGCGCTGACGGTTCca < 1:1193022/150‑1 (MQ=255) gTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGTGATGACCGCTGTCGTCGTACGTACCCGTCACGGTGTTCGTCGCGCTGACGGTTCcatca < 2:208033/150‑1 (MQ=255) ttCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGTGATGACCGCTGTCGTCGTACGTACCCGTCACGGTGTTCGTCGCGCTGACGGTTCcatcat > 1:1899109/1‑150 (MQ=255) | TGGGCACTGGTTGAAGTCCTCGAACGCGCTGTTGAAGTCTAAGGGCTAAGGGTCGGAGAAATTTTATGATTCAGACTCAATCCATGCTCGATGTGGCCGATAACAGCGGCGCTCGTCGCGTCATGTGCATCAAGGTACTCGGCGGTTCGCACCGCCGTTACGCCGGTATCGGTGACATCATCAAAGTAACCGTCAAGGAAGCAATTCCGCGCGGTAAGGTCAAAAAAGGCCAAGTGATGACCGCTGTCGTCGTACGTACCCGTCACGGTGTTCGTCGCGCTGACGGTTCCATCAT > NC_002947/555622‑555916 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |